全基因組關聯(lián)分析饅頭比容與質構snp標記

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1、全基因組關聯(lián)分析饅頭比容與質構SNP標記劉娟1陳廣鳳2田紀春3吳澎1趙子彤1楊藝1李向陽1唐曉珍1(山東省高校食品加工技術與質量控制重點實驗室;山東農業(yè)大學食品學院1,泰安271018)(德州學院生態(tài)與景觀學院2,德州253023)(山東農業(yè)大學小麥品質育種研究室;山東省作物生物學重點實驗室3,泰安271018)摘要為從分子水平研究控制饅頭比容與質構性狀的基因位點,以205份不同小麥品種為實驗材料,利用分布于小麥全基因組的24355個單核苷酸多態(tài)性(SNP)標記對饅頭比容與質構性狀進行關聯(lián)分析。共檢測到42個比容性狀顯著關聯(lián)位點,其中8個極顯著關聯(lián)位點(P<0.0001),同時也是

2、高遺傳貢獻率位點(R2>10%),2個位點至少在兩個環(huán)境中穩(wěn)定表達;檢測到313個質構性狀顯著關聯(lián)位點,其中31個極顯著關聯(lián)位點,46個高遺傳貢獻率位點,11個位點至少在兩個環(huán)境中穩(wěn)定表達。同時,發(fā)掘了5個質構性狀主效關聯(lián)位點,如3B染色體上黏聚性關聯(lián)位點Kukri_c13329_800等。本研究所得到的這些標記為在分子水平上研究饅頭品質性狀提供了有價值的參考。關鍵詞饅頭比容饅頭質構單核苷酸多態(tài)性標記全基因組關聯(lián)分析顯著關聯(lián)位點中圖分類號:TS201.1文獻標識碼:AGenome-WideAssociationAnalysisbetweenSNPMarkersandSpecific

3、volumeandTextureRelatedTraitsofSteamedBreadLIUJuan1,CHENGuangfeng2,TIANJichun3,WUPeng1*,ZHAOZitong1,YANGYi1,LIXiangyang1,TANGXiaozhen1(KeyLaboratoryofFoodProcessingTechnologyandQualityControlinShandongProvince;CollegeofFoodScienceandEngineering,ShandongAgriculturalUniversity1,Taian271018)(Coll

4、egeofEcologyandLandscapeArchitecture,DezhouUniversity2,Dezhou253023)(StateKeyLaboratoryofCropBiology;GroupofQualityWheatBreading,ShandongAgriculturalUniversity3,Taian271018)AbstractInordertostudythegenelocithatcontrolspecificvolumeandtextureofsteamedbread,205diversewheatvarietieswereusedtocond

5、ucttrait-markersassociationusing24355singlenucleotidepolymorphism(SNP)markerscoveredthewholegenomeofwheat.Intheresults,42significantmarkersweredetectedforspecificvolumeofsteamedbreaddistributedacross7chromosomesofwheat,including8highlysignificantmarkers(P<0.0001),aswellashighgeneticcontributio

6、nmarkers(R2>10%),2markersdetectedintwoormoreenvironment.313significantmarkersweredetectedfortexturetraitsofsteamedbreadmappedonto15chromosomesofwheat,including31highlyassociatedmarkers(P<0.0001),46highgeneticcontributionmarkersand11stablemarkers.Atthesametime,5mainsitesweredetectedfortextureof

7、steamedbread,suchasKukri_c13329_800onchromosome3B.Theseresultswillfacilitatefurtherresearchesinsensorypropertiesinsteamedbread.基金項目:山東省重點研發(fā)計劃(公益類)(2017GNC10101)山東農業(yè)大學作物生物學國家重點實驗室開放課題(2015KF14)收稿日期:2017-10-09作者簡介:劉娟,女,1994年出生,碩士,食品科學通訊作者

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