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《花金龜科(cetoniidae)部分種類基因序列及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究》由會員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、沈陽大學(xué)碩士學(xué)位論文本試驗研究中使用核酸測序法測定了花金龜科43條核酸序列，分別為：褐繡花金龜(AnthracophorarusticolaBurmeister)、白星花金龜(ProtaetiabrevitarsisLewis)、多紋星花金龜(ProtaetiafamelicaJanson)藍(lán)星花金龜(ProtaetiaimpavidaJanson)的Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COII基因序列，華美花金龜(CetoniamagnificaBallion)、暗綠花金龜(Cetoniaviridiop
2、acaMotschulsky)、黃粉鹿花金龜(DicranocephaluswallichibowringiPascoe)的Cytb、COI、28SrRNA、COII基因序列，疏紋星花金龜(ProtaetiacathaicaBates)的Cytb、COI、28SrRNA基因序列，雙斑短突花金龜(GlycuphananicobaricaJanson)Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA基因序列，小青花金龜(OxycetoniajucundaFaldermarm)Cytb、16SrRNA、28SrRNA基因序列，
3、自NCBI中查詢下載一條Chilolobaacuta的28SrRNA基因序列。應(yīng)用DNAmanl00軟件及ClustalX2．0軟件進(jìn)行拼接、校正及多重同源性比較，MEGA4．0軟件對序列組成和遺傳距離進(jìn)行分析，并采用Kimura．2參數(shù)模型、NJ法和MP法重建系統(tǒng)發(fā)育樹。得到下述結(jié)論：(1)花金龜科11個種Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COII基因序列長度分別為350bp、537bp、703bp、600bp、246bp，保守位點(diǎn)分別為226個、372個、572個、577個、156個，其中均為第二位點(diǎn)
4、居高；變異位點(diǎn)依次為124個、165個、131個、23個、90個，第三位點(diǎn)的變異率最高。Cytb基因序列中A、T、G、C的平均含量分別為36．8％、33．2％、19％、11％，其中A_卜T的平均含量為70．O％，G+C的平均含量為30．0％；COI基因序列中A、T、G、C的平均含量分別為30．3％、35．5％、15．9％、18．2％，其中A+T的平均含量為75．8％，G+C的平均含量為34．2％；16SrRNA基因序列中A、T、G、C的平均含量分別為39．9％、34．1％、8．7％、17．2％，其中A+T的平均含量為74
5、％，G+C的平均含量為25．9％；COII基因序列中A、T、G、C的平均含量分別為34．2％、32．8％、17．8％、15．2％，其中A+T的平均含量為67％，G+C的平均含量為33％。28SrRNA基因序列中A、T、G、C的平均含量分別為25．4％、20．8％、沈陽大學(xué)碩士學(xué)位論文30．4％、23．4％，其中A+T的平均含量為46．2％，G屺的平均含量為53．7％。表現(xiàn)出明顯的線粒體及核的堿基偏好性。(2)花金龜科11個種Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COII的堿基轉(zhuǎn)換／顛換平均值(It值)分別為1
6、．1、1．2、1．3、2．5、1．1。其中，Cytb基因序列的疏紋星花金龜與多紋星花金龜?shù)腞值為2．3745，16SrRNA基因的白星花金龜與多紋星花金龜R值為2．5179，COII基因的藍(lán)星花金龜與多紋星花金龜R值為1．5731，均說明屬內(nèi)不同種間的R較大，親緣關(guān)系較近，這與形態(tài)學(xué)分類結(jié)果基本相吻合。(3)花金龜科11個種Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COII基因的遺傳距離分別為0．0097．0．4103、0．0038．0．2340、0．0104．0．1571、0．0104．0．0223、0．009
7、7．0．2477。其中最小值均發(fā)生在星花金龜屬內(nèi)，尤以疏紋星花金龜、白星花金龜之間與多紋星花金龜之間最小，說明同屬不同種親緣關(guān)系較近。(4)線粒體Cytb、COI、16SrRNA、COII基因序列中，氨基酸使用中頻率最高的是Leu(亮氨酸)，密碼子使用頻率最高的為UAA、AAA；核基因序列氨基酸使用頻率最高的是Arg(精氨酸)，密碼子使用頻率最高的是CUC。說明線粒體基因與核基因在氨基酸和密碼子的使用方面有明顯差異。(5)基于Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COIl5種基因，采用Kimura-2參數(shù)模型
8、分別構(gòu)建的11種花金龜NJ樹和MP樹結(jié)果顯示：NJ和MP樹的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系基本一致，即星花金龜屬Protaetia的疏紋星花金龜、白星花金龜、多紋星花金龜、藍(lán)星花金龜優(yōu)先聚為一個分支，其次為花金龜屬Cetonia的華美花金龜(長毛花金龜)和暗綠花金龜，其他屬先后聚集在花金龜科支下，外群多色異麗金龜和斑股鍬甲處于次外枝和
