山羊lpl基因遺傳多態(tài)性及其與肌內(nèi)脂肪含量的關(guān)聯(lián)分析

山羊lpl基因遺傳多態(tài)性及其與肌內(nèi)脂肪含量的關(guān)聯(lián)分析

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1、AnhuiAgriculturalUniversityMasterDegreeThesisAnalysesofMolecularGeneticPolymorphismsoftheLPLGeneandTheirAssociationswithIntramuscularFatContentinGoatsPostgraduatecandidate:YinJieAcademicsupervisor:Prof.JingJianpingCo-supervisor:LecturerLingYinghuiCollegeofAnimalScienceandTec

2、hnology,AnhuiAgriculturalUniversity,Hefei,230036Hefei,Anhui,ChinaJune,2014萬方數(shù)據(jù)項(xiàng)目資助1.國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目:調(diào)控山羊卵巢雌激素和孕酮的相關(guān)miRNA的鑒定及作用機(jī)制研究(編號(hào):31372310)2.國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目:miR-27b介導(dǎo)Pax3基因調(diào)控山羊骨骼肌細(xì)胞增殖與分化研究”(編號(hào):31301934)3.國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863)計(jì)劃項(xiàng)目:牛羊分子細(xì)胞工程育種技術(shù)創(chuàng)新與優(yōu)勢(shì)性狀新品種培育(編號(hào):2011AA100307)4.安徽省自主創(chuàng)新專項(xiàng):高產(chǎn)優(yōu)

3、質(zhì)肉用山羊選育及規(guī)?;a(chǎn)技術(shù)示范(編號(hào):12z0102044)5.安徽省自主創(chuàng)新專項(xiàng):安徽白山羊新品系擴(kuò)繁、選育及應(yīng)用(編號(hào):13Z03049)6.安徽省自然科學(xué)基金項(xiàng)目:miRNA-1和miRNA-133調(diào)控山羊骨骼肌生長(zhǎng)發(fā)育的功能研究(編號(hào):1308085QC54)。萬方數(shù)據(jù)獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知,除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究

4、所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名:時(shí)間:年月日關(guān)于論文使用授權(quán)的說明本人完全了解安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,即:學(xué)校有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和磁盤,允許論文被查閱和借閱,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。同意安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)可以用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容。(保密的學(xué)位論文在解密后應(yīng)遵守此協(xié)議)研究生簽名:時(shí)間:年月日第一導(dǎo)師簽名:時(shí)間:年月日萬方數(shù)據(jù)摘要脂蛋白脂酶(Lipoproteinlipase,LPL)基因是一種在脂肪代謝過程中起關(guān)鍵作用的蛋白水解

5、酶。LPL基因已被看做是影響IMF的候選基因。提高山羊脂肪沉積能力,有利于獲得與山羊肌肉脂肪性狀相關(guān)的標(biāo)記位點(diǎn)。本研究選用安徽白山羊、波爾山羊、馬頭山羊、濟(jì)寧青山羊、岷山黑裘皮羊、臨朐奶山羊等6種山羊群體為試驗(yàn)動(dòng)物,采用PCR-SSCP分析方法研究LPL基因的多態(tài)型,并運(yùn)用GLM模型,對(duì)檢測(cè)出來的的SNP及其與羊IMF的關(guān)聯(lián)分析。1.根據(jù)GenBank上公開發(fā)表的相關(guān)山羊LPL基因,設(shè)計(jì)引物P1-P10,應(yīng)用PCR-SSCP分析方法在LPL基因上發(fā)現(xiàn)P1-SSCP多態(tài)位點(diǎn),該位點(diǎn)上具有五種基因型AA、BB、AB、AC和BC。序列測(cè)定結(jié)果表明,P

6、1-SSCP的變異是由堿基G→287A的替換造成的。在P6-SSCP多態(tài)位點(diǎn)上發(fā)現(xiàn)三種基因型AA、BB、AB。序列測(cè)定結(jié)果表明,P6-SSCP變異是由堿基G→16997A的替換造成,Gln→Ser。在P7-SSCP多態(tài)位點(diǎn)上發(fā)現(xiàn)三種基因型AA、BB、AB。序列測(cè)定結(jié)果表明,P7-SSCP變異是由堿基A→18313C替換造成,導(dǎo)致Asp→Ala。2.在上述6個(gè)群體中分析了PCR-SSCP位點(diǎn)的基因型分布情況,Hardy-Weinberg檢驗(yàn)結(jié)果表明:在P1-SSCP位點(diǎn)上,除安徽白山羊之外,所有品種均達(dá)到Hardy-Weinberg平衡(P>0.

7、05)。在P6-SSCP位點(diǎn)和在P7-SSCP位點(diǎn)上,所有品種均達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05)。3.根據(jù)SNP群體動(dòng)力學(xué)分析,287G、18313A在6個(gè)群體中分布均較穩(wěn)定,16997G在群體中表現(xiàn)一定特異性,安徽白山羊分布達(dá)0.9750,波爾山羊0.8828,馬頭山羊0.8333,臨朐奶山羊0.7500,濟(jì)寧青山羊0.7037,岷山黑裘皮山羊中分布率最低是0.6979。G-16997A與IMF呈負(fù)相關(guān)性;A-18313C位點(diǎn)與IMF顯著相關(guān)聯(lián)(P<0.05),這說明P7位點(diǎn)處A-18313C與脂肪沉積能力有相關(guān)性。關(guān)

8、鍵詞:山羊;LPL基因;遺傳多態(tài)性;肌內(nèi)脂肪含量I萬方數(shù)據(jù)AbstractLipoproteinlipase(LPL)playsamajorrolei

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