栽培花生基因組bac文庫的構建

栽培花生基因組bac文庫的構建

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時間:2019-02-15

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1、摘要栽培花生(ArachishypogaeaL.)是異源四倍體,含有A和B兩個基因組?,F(xiàn)有研究認為四倍體栽培種是由二倍體種A.duranensis(Agenome)和A.ipaansis(Bgenome)單一雜交后經(jīng)染色體自發(fā)加倍而成。單一雜交起源、多倍化引起的生殖隔離和少數(shù)育種親本的使用,使栽培花生基因組高度保守,遺傳多樣性非常有限,因此,利用遺傳作圖的方法分析基因十分困難?;ㄉ蚪MBAC文庫的構建,對利用物理圖譜的方法來分析花生基因組有很大的價值,可從該文庫中調取大量有用的基因,在利用基因工程技術改良作物品種性狀、開展分子育種等方面發(fā)揮重要作用。本實驗以栽培花生中花8號

2、植株葉片為材料,參照己報道的BAC文庫構建方法,在此基礎上進行技術改進,建立了一套適用于栽培花生品種的BAC文庫構建技術體系。選取幼嫩的植物葉片,得到了濃度適宜,分子量大于1Mb的高分子量DNA瓊脂糖包埋塊兒,選擇合適的酶切條件回收到符合分子量要求的DNA大片段,通過建立高效的連接體系,到目前為止共得到25,344個重組克隆。隨CLOg取80個克隆經(jīng)小量堿裂解法提取質粒酶切鑒定,脈沖凝膠電泳結果顯示,插入片段大小在30kb.150kb之間,平均插入片段大小為80kb,空載率為1.25%。隨機挑取3個BAC克隆做穩(wěn)定性繼代實驗,連續(xù)培養(yǎng)100代之后,BAC克隆依然穩(wěn)定,沒有重排

3、現(xiàn)象。本實驗構建的BAC文庫是我國迄今構建的第一個栽培花生BAC文庫,盡管文庫覆蓋率到目前為止還不能滿足作圖和測序的需要,但是建立了一個完整高效的適用于栽培花生基因組的BAC文庫構建技術體系。關鍵詞:栽培花生;BAC文庫;文庫構建lfff『I『

4、fI川刪644AbStractAbstractCultivatedpeanut0rach捃hypogaeaL.)isallallotetraploidofrecentorigin,withallAABBgenome.Itwasreportedthatallotetraploidisarosefromhybridizationoftwo

5、wildspecies,A.duranensis(Agenome)andA.枷謄瑚西(Bgenome),andspontaneouschromosomeduplication.Reproductiveisolationresultedt%mpolyploidizationandlimitofbreedingparentshaveledtolimitedavailabilityofalleliccombinations,lackofvariabilityinsomeimportanttraits.Therefore,theanalysisofthegenomeofpeanuti

6、sdifficulttoberealizedbygeneticlinkagemapping.Bacterialartificialchromosome(BAC)librariesalefundamentaltoolsforgenomiestudies,beingimportantforphysicalmapping,map—basedgenecloningandanalysisofgenestructureandfunction,playinganimportantroleinagriculturaldevelopment.Weconstructedabacterialart

7、ificialchromosome(BAC)libraryintheresearchbasedonthegenomeofcultivatedpeanutzhonghua8.Accordingtothetraditionalmethod,ahigh-efficienttechnologysystemofBAClibraryconstructionforpeanutwasestablished.WegottheproperconcentrationandsizeofnuclearDNAfragmentsfromyoungleaves.Throughaseriesofpartial

8、restrictiondigests,wedeterminedtheconditionsthatyieldamaximumpercentageoffragmentsbetween100kb一300kb,andwereclaimedthepartialdigestedDNAtobelinkedtothevector.Sofarwehaveobtained25,344recombinantclones.80cloneswereselectedrandomlyfortesting.TheresultofPFG

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