基于ssr的玉米、水稻紋枯病菌(rhizoctonia solani ag1-ia)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析

基于ssr的玉米、水稻紋枯病菌(rhizoctonia solani ag1-ia)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析

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1、山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文基于SSR的玉米、水稻紋枯病菌(RhizoctoniasolaniAG1--IA)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析姓名:溫娜娜申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):植物病理學(xué)指導(dǎo)教師:劉愛新20120612山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要立枯絲核菌(Rhizoctoniasolani)寄主范圍廣泛,可侵染危害250多種植物。R.solani是一個復(fù)合種,該種至少包括14個融合群,每個融合群又可分為不同的融合亞群。尼solaniAGl.IA屬于AGl融合群的IA亞群,該真菌可危害玉米、水稻和大豆等多種植物,在玉米和水稻形成典型的紋枯病癥狀,是玉米和水稻紋枯病的優(yōu)勢致病類群。R.sola

2、niAGl.IA群體結(jié)構(gòu)組成和變化對該類病害的發(fā)生和流行起著非常重要的作用。本研究中,我們利用SSR分子標(biāo)記,對我國8個省104株R.solaniAGl.IA玉米分離物和山東和廣東4個主要產(chǎn)稻區(qū)的61個R.solaniAGl.IA分離物的群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,旨在明確AGl.IA群體在不同地區(qū)間的遺傳多樣性組成及演化動態(tài),希望為進(jìn)一步制定玉米和水稻紋枯病的綜合治理措施提供理論依據(jù)。1.紋枯病菌采集、分離及融合群確定從安徽、江蘇、陜西、河南、山東、河北、遼寧、吉林等8個省31個地區(qū),采集具有典型紋枯病癥狀的標(biāo)本,經(jīng)分離培養(yǎng),通過菌絲融合測定、ITS序列測定等鑒定所屬的融合群,將

3、104株鑒定為AGl.IA的玉米分離物用于本研究。從山東臨沂、東營和濟(jì)陽采集標(biāo)本,經(jīng)分離培養(yǎng),通過菌絲融合測定、ITS序列測定等鑒定所屬的融合群,將5l株鑒定為AGI.IA的水稻分離物用于本研究,還有10株來自廣東的菌株。2.R.solaniAGI-IA玉米分離物的致病性分化對104株AGl.IA玉米分離物進(jìn)行離體葉片致病力測定,采用DPS系統(tǒng)進(jìn)行UPGMA聚類分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)所有菌株被分為3個類型。強(qiáng)致病力菌株有29株,包括LYl.3.1、YWK.195、和SZ002.19等,弱致病力菌株ll株,64株表現(xiàn)為中等致病力。結(jié)果還發(fā)現(xiàn),各菌株的致病力與地理來源之間沒有明顯的相關(guān)性,

4、各地的菌株均存在不同程度的致病力分化,在不同地區(qū)隨機(jī)分布。3.R.solaniAGl.IA玉米分離物遺傳多樣性分析利用lO對引物對8個省份的104株玉米紋枯病菌進(jìn)行SSR分析,共檢測到36條多態(tài)性條帶,每對引物可檢L飆,IN2—5條多態(tài)性條帶。采用UPMGA法進(jìn)行SSR聚類分析發(fā)現(xiàn),104株AGI.IA菌株在O.57到1.00不同的遺傳相似系數(shù)范圍內(nèi),被分為不同的聚類組,結(jié)果表明,R.solaniAGl.IA玉米分離物存在豐富的遺傳多樣性,SSR分組與菌株的地理來源沒有明顯的相關(guān)性。Nei's遺傳多樣性指數(shù)在江蘇和安徽為最高,分別為0.4544和0.4630,Shannon‘s

5、指基于SSR的玉米、水稻紋枯病菌(RhizoctoniasolaniAGI-IA)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析數(shù)在江蘇和安徽為最高,分別為O.8402和0.8001,表明來自江蘇和安徽的玉米紋枯病菌種群的遺傳結(jié)構(gòu)相對于其他地區(qū)較復(fù)雜。其中,來自安徽和河北的菌株遺傳距離最大,來自吉林和河南的遺傳距離最小。對群體的遺傳分化進(jìn)行分析,群體間和群體內(nèi)都存在著一定的遺傳分化,群體間的變異約占總變異的24.6%,群體內(nèi)變異約占總變異的75.4%,因此,遺傳變異主要發(fā)生在群體內(nèi)。4.R.solaniAGl一IA水稻分離物遺傳多樣性分析。利用lO對SSR引物對山東3個水稻產(chǎn)區(qū)的51株AGl.IA水稻分離物

6、和10株廣州分離物進(jìn)行SSR遺傳多樣性分析,共檢測到32條多態(tài)性條帶,每對引物能擴(kuò)增出2~5條多態(tài)性條帶。采用UPMGA法進(jìn)行SSR聚類分析結(jié)果表明,61個分離物在O.50到1.oo遺傳相似系數(shù)范圍內(nèi),被分為不同聚類組。來自不同地區(qū)的水稻紋枯病菌,多以地理來源聚為一類,表明SSR分組與菌株的地理來源有一定的相關(guān)性。Nei’s遺傳多樣性指數(shù)在廣東省達(dá)到最大,為0.4228,Shannon's指數(shù)在廣東省達(dá)到最高,為0.7309,表明來自廣東省的水稻紋枯病菌具有復(fù)雜的遺傳結(jié)構(gòu)。其中,來自廣東和濟(jì)陽的菌株遺傳距離最遠(yuǎn),臨沂和濟(jì)陽的菌株遺傳距離最近。對群體的遺傳分化進(jìn)行分析,群體內(nèi)和群

7、體間都存在一定的遺傳分化,群體間的變異約占總變異的17.4%,群體內(nèi)的變異占總變異的82.6%,因此,遺傳變異主要發(fā)生在群體內(nèi)。關(guān)鍵詞:RhizoctoniasolaniAGl.IA:玉米紋枯?。核炯y枯?。籗SR;遺傳多樣性Ⅱ山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文AbstractRhizoctoniasolaniJ.QKahnaregeographicallydistributedworldwideandshowedahostrangeofmorethan250plantspecies.Currentl

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