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1、河北醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文應(yīng)用SELDI技術(shù)初步篩選肺纖維化生物標(biāo)記物姓名:李學(xué)任申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):內(nèi)科學(xué)指導(dǎo)教師:魏路清201203中文摘要應(yīng)用SELDI技術(shù)初步篩選肺纖維化患者生物標(biāo)記物摘要目的:應(yīng)用表面加強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜篩選特發(fā)性肺纖維化和類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎合并間質(zhì)性肺疾病患者支氣管肺泡灌洗液和血清中的差異蛋白,初步建立診斷分類樹模型。.方法:在我院呼吸科門診或住院患者中,選取特發(fā)性肺纖維化和類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎合并間質(zhì)性肺疾病患者為實(shí)驗(yàn)組,選取胸部影像學(xué)正常的咳嗽或胸悶患者作為對照組,該組患者行支氣管鏡是為了明確診斷
2、,且鏡檢未見明顯異常、支氣管肺泡灌洗液細(xì)胞學(xué)常規(guī)檢查無嗜酸粒細(xì)胞升高。在患者及家屬知情同意下,留取血清和支氣管肺泡灌洗液標(biāo)本。2010年1月至2012年2月期間,共納入特發(fā)性肺纖維化患者34例、風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎合并間質(zhì)性肺疾病患者15例、對照組患者25例。將CMl0芯片與血清或者支氣管肺泡灌洗液標(biāo)本結(jié)合后,通過增強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜進(jìn)行檢測獲得蛋白質(zhì)指紋圖譜,用BiomarkerWizard軟件、BiomarkerPattem軟件以及Spssl3.0對測得的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,初步構(gòu)建分類樹模型并隨機(jī)選取部分病例進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果:1.
3、CMl0芯片和表面加強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜檢測出特發(fā)性肺纖維化和對照組患者支氣管肺泡灌洗液標(biāo)本中247個(gè)蛋白峰,l3個(gè)蛋白質(zhì)峰差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t檢驗(yàn),P<0.05),與對照組相比,質(zhì)荷比為2240.57、3459.32、3501.78、4146.50、4516.51、4615.88、5651.26表達(dá)升高,質(zhì)荷比為4989.10、5043.68、6968.76、14733.3、11687.7、11782.1表達(dá)下降,以質(zhì)荷比3459.32、4516.51、4989.91、14733.3建立診斷分類樹篩選模型靈敏度為91.1
4、76%(31/34),特異度為92.O%(23/25),ROC曲線下面積為0.949,隨機(jī)選取特發(fā)性肺纖維化和對照組患者支氣管肺泡灌洗液各15例進(jìn)行驗(yàn)證,模型靈敏度為93.333%(14/15),特異度為86.667%(13/15);CMl0芯片和表面加強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜檢測出特發(fā)性肺纖維化和對照組血清樣本中143個(gè)蛋白峰,7個(gè)蛋白質(zhì)峰差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t檢驗(yàn),P<0.05),與對照組相比,質(zhì)荷比3382.59、4806.03、3453.39表達(dá)升高,質(zhì)荷比為5825.48、11525.3、11886.0、11689.4
5、表達(dá)下中文摘要降,以質(zhì)荷比3453.39、5825.48、11886.0建立診斷分類樹篩選模型,靈敏度為94.737%(18/19),特異度為84.615%(11/13),ROC曲線下面積為0.913,隨機(jī)選取特發(fā)性肺纖維化和對照組患者血清各lO例進(jìn)行驗(yàn)證,模型靈敏度為100%(10/10),特異度為90%(9/10)。特發(fā)性肺纖維化患者構(gòu)建的血清診斷分類樹和支氣管肺泡灌洗液診斷分類樹的靈敏度、特異‘度、正確率、ROC曲線面積比較,f檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)尸值均大于0.05,無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2.CMl0芯片和表面加強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜檢測
6、出類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎合并間質(zhì)性肺疾病患者和對照組血清標(biāo)本中143個(gè)蛋白峰,4個(gè)蛋白質(zhì)峰差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t檢驗(yàn),P<0.05),質(zhì)荷比分別為2876.75,3382.59,11525.3,11886:0,表達(dá)均升高,以質(zhì)荷比11525.3,2876.75建立診斷分類樹,靈敏度為93.333%(14/15),特異度為92.308%(12/13),ROC曲線下面積為0.936,隨機(jī)選取類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎合并間質(zhì)性肺疾病和對照組患者血清各lO例進(jìn)行驗(yàn)證,模型靈敏度為90%(9/10),特異度為90%(9/10)。結(jié)論:1.表面加強(qiáng)激光解吸電離
7、飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)能篩選出了特發(fā)性肺纖維化患者支氣管肺泡灌洗液和血清差異蛋白,以質(zhì)荷比3459.32、4516.51、4989.91、14733.3建立支氣管肺泡灌洗液分類樹模型和以質(zhì)荷比3453.39、5825.48、l1886.0建立血清診斷分類樹模型價(jià)值均較高,有進(jìn)一步研究意義。另外,血清中存在質(zhì)荷比11689.4、3453.39差異蛋白和支氣管肺泡灌洗液中存在質(zhì)荷比l1687.7、3459.32,是否同源值得進(jìn)一步研究。2.表面加強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)能篩選出了類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎合并間質(zhì)性肺疾病血清差異蛋白,以質(zhì)荷比l
8、1525.3,2876.75建立血清診斷分類樹建立診斷支氣管肺泡灌洗液分類樹模型價(jià)值較高,有進(jìn)一步研究意義。關(guān)鍵詞:特發(fā)性肺纖維化;類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎合并間質(zhì)性肺疾病;支氣管肺泡灌洗液;血清;SELDI.TOF.MS;蛋白質(zhì)英文摘要DiscoveryofBiomar