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《基于高通量測序技術(shù)的膀胱癌轉(zhuǎn)錄組分子標(biāo)記的初步篩選》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、萬方數(shù)據(jù)中圖分類號數(shù)三Z:!壘UDC610學(xué)校代碼!Q5蘭3密級公玨碩士學(xué)位論文基于高通量測序技術(shù)的膀胱癌轉(zhuǎn)錄組分子標(biāo)記的初步篩選,州■●1●n1^『lneDrlml上ySCreenlngO士mo上eCU上armar量【erSO士bladderurothelialcarcinomabasedonHigh—throughputsequencing作者姓名:學(xué)科專業(yè):研究方向:學(xué)院(系、所):指導(dǎo)教師:肖四方臨床醫(yī)學(xué)臨床檢驗(yàn)診斷學(xué)中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬海口醫(yī)院張淑芳教授答辯委員會(huì)主席中南大學(xué)二。一四年五月萬方數(shù)據(jù)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明,所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研
2、究工作及取得的研究成果。盡我所知,除了論文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得中南大學(xué)或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我共同工作的同志對本研究所作的貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明。申請學(xué)位論文與資料若有不實(shí)之處,本人承擔(dān)一切相關(guān)責(zé)任。作者簽名:塑日期:蘭年三月旦目學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者和指導(dǎo)教師完全了解中南大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定:即學(xué)校有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交學(xué)位論文的復(fù)印件和電子版;本人允許本學(xué)位論文被查閱和借閱;學(xué)校可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,可以采用
3、復(fù)印、縮印或其它手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密論文待解密后適應(yīng)本聲明。作者簽名:!基望查導(dǎo)師簽名立遮i盤芳萬方數(shù)據(jù)基于高通量測序技術(shù)的膀胱癌分子標(biāo)記的初步篩選摘要:目的:基于高通量測序技術(shù)、RT—qPcR和免疫組化技術(shù),從轉(zhuǎn)錄層面和蛋白表達(dá)角度探索膀胱尿路上皮癌發(fā)生發(fā)展的可能機(jī)制,篩選出膀胱腫瘤早期診斷和監(jiān)測的分子標(biāo)記。方法:通過高通量測序技術(shù)對一膀胱尿路上皮癌的患者進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序和生物信息學(xué)分析,篩選到候選的差異表達(dá)分子,同時(shí)收集31對膀胱尿路上皮癌腫瘤組織和癌旁非腫瘤組織樣品,采用RT—qPCR驗(yàn)證這些差異表達(dá)分子CDHl、vEGFA、PTPRF和CLDN7的表達(dá)水平。同時(shí)對C
4、DHl和CLDN7進(jìn)行免疫組化進(jìn)行檢測,探討這些分子在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中的分子機(jī)制和臨床意義。結(jié)果:1.CDHl、VEGFA、PTPRF和CLDN7可能成為候選膀胱癌早期診斷和監(jiān)測的分子標(biāo)記;CDHl和CLDN7mRNA在腫瘤組織相對癌旁非腫瘤組織表達(dá)上調(diào),但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(伶O.05);2.vEGFA在腫瘤組織中相對癌旁非腫瘤組織表達(dá)上調(diào),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(尺0.05);3.cDHl、VEGFA、PTPRF和CLDN7分別與腫瘤復(fù)發(fā)關(guān)系作多元Logistic回歸分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)PTPRF表達(dá)作為腫瘤復(fù)發(fā)因素進(jìn)入模型(戶O.002),說明PTPRF和腫瘤復(fù)發(fā)關(guān)系密切;4.CDHl和C
5、LDN7免疫組化顯示:CDHl在膀胱腫瘤組織和癌旁非腫瘤組織蛋白表達(dá)中未發(fā)現(xiàn)有明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)意義差異(腳.05),膀胱尿路上皮癌腫瘤組織CLDN7表達(dá)上調(diào),具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(氏0.05)。結(jié)論:1.CLDN7、VEGFA和PTPRF等差異表達(dá)基因被納入可能的膀胱癌分子早期診斷和治療的分子標(biāo)記候選集;2.VEGFA可能作為候選的膀胱腫瘤診斷的分子標(biāo)記,PTPRF可能與膀胱腫瘤的復(fù)發(fā)關(guān)系比較密切。全文圖15幅,表13個(gè),參考文獻(xiàn)76篇。關(guān)鍵詞:膀胱尿路上皮癌;高通量測序;分子標(biāo)記篩選;轉(zhuǎn)錄組;差異表達(dá)基因分類號:R737.14Ⅱ萬方數(shù)據(jù)ThestIldyOfmolecularmarkerso
6、fbladderu加theHalAbstI曩Ct:Obiective:Toe)【ploremeoccun.enceanddevelopmentofbladderur.0thelialcarciIlomaof也epossiblemechanismbasedon仃趾scriptometecllIlologyf如mnleperspectlVeof仃鋤scriptionandproteiIle沖ressiom趾dtoscreenearlydi卿losis觚dmollitorillgofmolecularmarkersofbladdercancer.Memods:T1lisp啊ectadop
7、tedlligll—t11roughputsequenciIlgtecIulologytope—b皿缸anscriptomesequenciI】曙鋤dbioiIl】}bmaticsa工lalysisonnon.t哪orandtIlmortissues鋤ples,screenedandidemified廿ledi丘.eremiallyexpressedgenesofbladdercancer.Meanwbieweverifiedourhypo也esisandident毋