基于線粒體基因組全序列的鱚屬魚(yú)類系統(tǒng)發(fā)育研究

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1、＂義？ｆｗ料雜ｏｃｅａｎｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆｃｈｉｎａ碩±學(xué)位論文ＩＭＡＳＴＥＲＤＳＥＲＴＡＴＩＯＮ巧基于線粒體基因組全序列的鏈屬魚(yú)類系統(tǒng)論文涵目：發(fā)育研究ＴｈｅＣｏｍｌｅｔｅＭｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＧｅｎｏｍｅｓａｎｄｐｓｌｉｌｓｉｓｏｆ義／／幻ｏＳｅｃｉｅ英文趣目?。墸校瑁铮纾澹睿澹簦悖牐粒睿幔纾鹱鳎犝撸盒ぜ夜猓墸崳姡墸壷笇?dǎo)教師：巧天翔教授學(xué)位類別：全曰制學(xué)術(shù)學(xué)位專業(yè)名稱：漁業(yè)資源

2、研究方向：漁業(yè)生物學(xué)扔＊互三２０１５６＾１ａ謹(jǐn)レ乂此論文獻(xiàn)給我的導(dǎo)師、家人和我的朋友們！肖家光基于線粒體基因組全序列的嬉屬魚(yú)類系統(tǒng)發(fā)育研究？如皮－Ｉ學(xué)位論義答辯口期：ｆ指穿教師簽字：答辯委Ｗ會(huì)成員簽字；義考麥戶。和叫則獨(dú)創(chuàng)聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研巧工作及取得的研巧成果。據(jù)我所知，除了文中特別加Ｗ標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其（：他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過(guò)的研巧成果，也不包含未獲得

3、注如沒(méi)有其他需要特別聲明的，本欄可空）或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書(shū)使用過(guò)的一材料。與我同工作的同志對(duì)本研巧所做的任何貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確的說(shuō)明并表示謝意。：學(xué)位論文作者簽名：餐化簽字曰期年占月ｆ曰自學(xué)位論文版奴使用授權(quán)書(shū)、本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留使用學(xué)位論文的規(guī)定，并同意Ｗ下事項(xiàng)：１、學(xué)校有權(quán)保留并向國(guó)家有關(guān)部口或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤，允許論文被查閱和借閱。２、學(xué)校可Ｗ將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索，可＂采用影印、縮印或掃描等

4、復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。同時(shí)授權(quán)淸華大學(xué)中＂用于出版和編入國(guó)學(xué)術(shù)期刊（光盤版）電子雜志社ＣＮＫＩ《中國(guó)知識(shí)資源總庫(kù)》，授權(quán)中國(guó)科學(xué)技術(shù)信息研究所將本學(xué)位論文收錄到《中國(guó)學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù)》。（保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書(shū)）學(xué)位論文作者簽名：導(dǎo)師簽字；簽字曰期：年曰簽字曰期年曰Ｗ＾月午＾月?tīng)?zhēng)基于線粒體基因組全序列的毎屬魚(yú)類系統(tǒng)發(fā)育研究巧要７／〇＞）ｅｒｃｆｏｒｍｅｓ）轄屬魚(yú)類（＆隸屬于妒形目（Ｐ、ｅｏ）護(hù)ｉ護(hù)亞目（Ｐｒｃｉｄｅｉ、轄ｉａａｅ，科（Ｓｌｌｇｉｎ

5、Ｗ）廣泛分布于紅海、印度洋和西太平洋沿岸，中國(guó)近海均有分一布。轄屬魚(yú)類形態(tài)和體色上非常相近，使得該屬魚(yú)類的分類直存在諸多問(wèn)題，近年來(lái)隨著分子方法的成熟，越來(lái)越多的館屬新種及隱存種被發(fā)掘。本研究Ｗ館’亞洲饋屬魚(yú)類中６種常見(jiàn)魚(yú)種斑館（況仏巧０ａｅｏ／ｗ）、（筑化巧〇ｏｓｆａ化〇）、中國(guó)鶴（ＳｉＵａｏｓｉｎｉｃｏ）、少錢鶴（Ｓａｏｎｉｃａ）、多驗(yàn)館（ＳＷａｏｓｉｈａｍａ）ｇｉＶａｇｏｊｐｇ巧巧度館（＆仏巧ｏ加成ＣＯ）為研究對(duì)象，在線粒體全基因組水平上拴釋了６種饒屬魚(yú)類間的遺

6、傳差異－并對(duì)其種間遺傳分化程度進(jìn)行了深入探討，進(jìn)而揭示６種館屬魚(yú)類么間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，為館屬魚(yú)類的分類及進(jìn)化提供分子水平的證據(jù)。主要結(jié)果如下：１．六種館屬魚(yú)類線巧體基因組特征分析￣本研巧擴(kuò)增得６種僖屬魚(yú)類線粒體基因組全長(zhǎng)介于］６４９３ｂｙ】７Ｕ９ｂ之間。ｆｐ＾＾ＷＵ＂少巧搖線粒體基因組長(zhǎng)度最長(zhǎng)，其ｔＲＮＡ與ＮＤ１基因間、ｔＲＮＡ與ＭｄｔＲＮＡ基因間分別包含有ｌ〇３ｂｐ和２３５ｂｐ的非編碼區(qū)；亞洲館線粒體基因組長(zhǎng)一度最短。除少巧搖之外，其他５種館魚(yú)蛋白質(zhì)編碼基因的長(zhǎng)度均致，少錢

7、健線粒體基因組ＮＤ２基因長(zhǎng)９ｂｐ，ＡＴＰ６基因長(zhǎng)６ｂｐ。６種館屬魚(yú)類控制區(qū)長(zhǎng)度變異，ｂ，較大，中國(guó)館線粒體控制區(qū)長(zhǎng)度最短為８２６ｐ；多巧緒線粒體控制區(qū)長(zhǎng)度最長(zhǎng)為１２７４ｂｐ，其線粒體控制區(qū)內(nèi)存在串聯(lián)重復(fù)序列。本實(shí)驗(yàn)測(cè)定的多麟傍控制區(qū)重復(fù)單元為％ｂ，共重復(fù)８次。六者線粒體基因組均包含１３個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因ｐ、２個(gè)ｒＲＮＡ基因、２２個(gè)ｔＲＮＡ基因和２個(gè)主要的非編碼區(qū)（控制區(qū)和〇１＿），除中一國(guó)健外，其他５種德魚(yú)的線粒體基因狙排列順序與大多數(shù)脊椎動(dòng)物致。中國(guó)館Ａｉａ＾＂ｔＡ，ＲＮＡ，

8、線粒體基因組存在著基因重排現(xiàn)象，其中與ｔＲＮ發(fā)生滑移由正ＡｉａＡｓｎＣｓＴ郵ｙ＾－－－ＮＡｔｔ－ｔＷＮＡＣＹ常的ＷＡＮＣＹ基因簇（ＲＮＡＲＮＡＲＮＡｔＲＮＡ）變ｔＲ為基因簇，所測(cè)得６種館屬魚(yú)類線粒體基因組的Ｃ的含量均最高，。在堿基組成上Ｇ的含量最低：從堿基偏倚性上，６種健屬魚(yú)類線粒體基因組ＧＣ含量在兩條鏈間具明顯的偏向性，Ｗ，且不同片段中這種偏向性的程度不同蛋白質(zhì)編碼基因密，而ＡＴ含量在兩條鏈中無(wú)偏向性，１２碼子第