資源描述:
《蝗綠僵菌cqma102體表入侵相關(guān)基因machy的克隆和分析》由會員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、蝗綠僵菌CQMa102體表入侵相關(guān)基因MaChy的克隆和分析重慶大學(xué)碩士學(xué)位論文學(xué)生姓名:姚秀清指導(dǎo)教師:夏玉先教授專業(yè):生物學(xué)學(xué)科門類:理學(xué)重慶大學(xué)生物工程學(xué)院二O一一年十一月CloningandFunctionalAnalysisofMaChygeneinMetarhiziumacridumAThesisSubmittedtoChongqingUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementfortheDegreeofMasterofScienceByXiuqingYaoSupervisedbyProf.YuxianXiaMa
2、jor:BiologyCollegeofBioengineeringofChongqingUniversity,Chongqing,ChinaNov.2011重慶大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要摘要蝗綠僵菌(Metarhiziumacridum)是一類應(yīng)用廣泛的蟲生真菌,在農(nóng)業(yè)害蟲生物防治中起著重要作用。蟲生真菌的致病力是影響其廣泛使用的主要限制因素,迄今為止,實(shí)驗(yàn)室在前期工作中構(gòu)建了蝗綠僵菌CQMa102在侵染過程中,相比于體內(nèi),在體表時(shí)期的高表達(dá)的差減文庫,從此文庫中,選擇了蝗綠僵菌CQMa102體表時(shí)期高表達(dá)的一條EST序列,該EST序列長750bp,經(jīng)過比對發(fā)現(xiàn)該序列與其他
3、物種中的氰化物水合酶的同源性較高。利用本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建的蝗綠僵菌CQMa102在產(chǎn)孢時(shí)期的均一化全長cDNA文庫,獲取了該基因(MaChy)的cDNA全長。通過以基因組為模板PCR擴(kuò)增后克隆測序的方式,成功獲取了MaChy基因的DNA全長。利用RNAi的方法研究了MaChy的功能。主要研究結(jié)果如下:①獲得了MaChy基因的cDNA全長,并進(jìn)行了相關(guān)生物信息學(xué)分析。MaChy基因cDNA序列全長為1202bp,5’端有80bp的UTR區(qū)域,3’端有50bpUTR區(qū)域,其開放閱讀框?yàn)?074bp。預(yù)測該基因編碼357個(gè)氨基酸,與多個(gè)物種如eptosphaeriamaculans(A
4、AF66098.1)、Aspergillusniger(XP_001389844.1)、Fusariumsolani(CAM82815.1)、Neurosporacrassa(XP_960160.2)、PenicilliumchrysogenumWisconsin(XP_002562104.1)、Aspergillusniger(ABX75546.1)、Alternariabrassicicola(AAP88966.1)對應(yīng)所編碼都有97%以上的蛋白同源性。該蛋白沒有信號肽,也不具有跨膜的結(jié)構(gòu)。②生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,該蛋白的分子量39.78kDa,等電點(diǎn)為5.53。為酸
5、性蛋白。預(yù)測其在177位(NASK)、206位(NASE)、332位(NSTD)氨基酸處存在N-糖基化位點(diǎn);4位(TIR)、77位(SMR)、300位(TKK)、323位(TPK)氨基酸處存在蛋白激酶C磷酸化位點(diǎn);104位(SELD)、134位(THVE)、179位(SKHE)、341(STLE)處有一個(gè)酪蛋白激酶2磷酸化位點(diǎn);122位(GTVINH)、144位(GSGDSL)、238位(GARLGL)、262位(GNGYSR)N-十四?;稽c(diǎn)。③通過PCR擴(kuò)增基因組送測序后,獲取了MaChy基因的DNA全長,將DNA序列與cDNA序列用DNAMAN軟件比對,結(jié)果顯示:Ma
6、Chy基因不含內(nèi)含子,DNA全長1202bp。④采用RNAi的方法進(jìn)行MaChy基因的功能研究。構(gòu)建MaChy基因的農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化的RNA干擾載體后,通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化蝗綠僵菌CQMa102中,經(jīng)過培養(yǎng)基的初篩和PCR篩選后,獲得多個(gè)穩(wěn)定的MaChy基因干擾突變株。⑤分析了MaChy基因干擾突變株的毒力變化,統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn)干擾突變株和出發(fā)菌株的半數(shù)致死時(shí)間沒有顯著差異,推測MaChy基因的功能與毒力不相關(guān)。I重慶大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要⑥觀察干擾突變株與出發(fā)菌株在附著胞形成方面的差異,從多個(gè)角度進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,在附著胞形成比率,形成時(shí)間,附著胞形態(tài),附著胞大小都沒有顯著
7、的差異。⑦分析了MaChy基因在體表和體內(nèi)的表達(dá)差異。統(tǒng)計(jì)定量PCR數(shù)據(jù)得到的結(jié)論顯示,在體表階段的表達(dá)量最高,大約是體內(nèi)表達(dá)量的2.5倍,而在1/4SDA液體培養(yǎng)基中的表達(dá)量與體內(nèi)表達(dá)量基本相同,表明該基因在體表階段是高表達(dá)的。關(guān)鍵詞:綠僵菌,MaChy基因,RNAi,干擾突變株II重慶大學(xué)碩士學(xué)位論文英文摘要ABSTRACTTheascomycetesMetarhiziumacridumwaswellcharacterizedentomopathogenicfungiandwidelyusedinbiologi