snps分子標記技術在昆蟲學研究中的應用

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1、應用昆蟲學報ChineseJournalofAppliedEntomology2011,48(1):167—173*SNPs分子標記技術在昆蟲學研究中的應用董輝錢海濤柳曉利叢斌(沈陽農(nóng)業(yè)大學植物保護學院害蟲生物防治研究沈陽110866)摘要單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)主要是指在染色體基因組水平上由于單個核苷酸的變異而引起的DNA序列多態(tài)性,包括單堿基的轉換或顛換引起的點突變,其中最少出現(xiàn)1種等位基因頻率不小于1%,常以雙等位基因的形式出現(xiàn),穩(wěn)定而可靠。在目前的昆蟲基因組研究中,SNPs標記的研究主要集中在

2、果蠅、蚊媒、家蠶等一些模式生物。本文對SNPs標記在昆蟲的種類鑒定、遺傳圖譜構建、種群遺傳學、抗藥性分子機理等方面進行了綜述,最后展望了SNPs在種群遺傳、標記輔助選擇和生物進化等研究領域中的應用前景。關鍵詞單核苷酸多態(tài)性,昆蟲學,DNA,遺傳標記ApplicationsofSNPsmolecularmarkersinEntomologyDONGHuiQIANHai-TaoLIUXiao-LiCONGBin(LaboratoryforBio-ControlofPestInsects,CollegeofPlantProtection,ShenyangAgricul

3、turalUniversity,Shenyang110866,China)AbstractSinglenucleotidepolymorphisms(SNPs)mainlyrefertosequencepolymorphisminDNAcausedbyasinglenucleotidevariationatthegenomiclevel.Theseincludepointmutationscausedbysinglebasetransversionsorconversionsinwhichthefrequencyofonekindofalleleisnotlessthan

4、1%.StableandreliableSNPsofteninvolvetwoalleles.TheuseofSNPsmarkersincurrentresearchoninsectgenomesisstillmainlyrestrictedtoafewmodelorganisms;forexample,thefruitfly,mosquitoandsilkworm.ThispapersummarizesthetypesofSNPsmarkersusefulinentomologicalresearch,includingtaxonomy,geneticmapconstr

5、uction,populationgeneticsandelucidatingmolecularmechanismsofpesticideresistance.FutureprospectsfortheapplicationofSNPs,infieldssuchaspopulationgenetics,marker-assistedselectionandevolution,arediscussed.Keywordssinglenucleotidepolymorphisms,insectology,DNA,geneticmarkers分子標記是繼形態(tài)標記、細胞標記和生化標

6、RFLP)和微衛(wèi)星標記(simplesequencerepeats,記之后發(fā)展起來的一種新的遺傳標記形式。由于SSR)之后最有前途的第三代分子標記,正在農(nóng)業(yè)、分子標記直接以DNA的形式表現(xiàn),不受環(huán)境條件生物學、醫(yī)學等眾多學科發(fā)揮著巨大作用。近年和發(fā)育階段的影響,且標記的數(shù)目多,多態(tài)性高,來,伴隨著昆蟲DNA序列數(shù)據(jù)增加和51種昆蟲其研究與應用已得到了迅猛的發(fā)展,相繼出現(xiàn)了全基因組測序計劃的完成或部分完成(http://20多種DNA分子標記方法。1996年,美國麻省www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/leuks.cgi),DNA理工學院人類基因組研究

7、中心的Lander(1996)第序列數(shù)據(jù)庫海量遞增,為我們研究單個核苷酸水一次提出單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotide平的變異提供了前所未有的機遇(Blackandpolymorphisms,SNPs)可以作為新一代的分子標Vontas,2007)。本文對SNPs標記在昆蟲的種類鑒記。目前,該標記已經(jīng)成為繼限制性片段長度多定、遺傳圖譜構建、種群遺傳學、抗藥性分子機理態(tài)性(restrictionfragmentlengthpolymorphisma,等方面進行了綜述。*資助項目:國家自然科學基金(30871674,3

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