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《中國栽培和野生大豆農(nóng)藝品質(zhì)性狀與ssr標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析i群體結(jié)構(gòu)及關(guān)聯(lián)標(biāo)記》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫。
1、作物學(xué)報AcrAAG】mNOMICAs肌cA2008，34(7)：1169一1178ISSN0496—3490：CoDENTSHPA9http：／，www．chinacmps．org，zwxb，E·mail：xbzw@chinajoumal．net．cnDOI：10．3724，SEJ．1006．200S．01169中國栽培和野生大豆農(nóng)藝品質(zhì)性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析I．群體結(jié)構(gòu)及關(guān)聯(lián)標(biāo)記文自翔趙團(tuán)結(jié)鄭永戰(zhàn)劉順湖王春娥王芳蓋鈞鎰。(南京農(nóng)業(yè)大學(xué)大豆研究所，國家大豆改良中心／作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國家重點實驗室，江蘇南京2l0095)摘要：關(guān)聯(lián)作圖是一種利用連鎖不平衡(1inkagedisequi
2、librium，LD)檢測自然群體中基因位點及其等位變異的方法。利用60個ssR標(biāo)記，對全國大豆地方品種群體(393份代表性材料)和野生大豆群體(196份代表性材料)的基因組變異進(jìn)行掃描，分析兩類群體的連鎖不平衡位點、群體結(jié)構(gòu)，并采用TAssEL軟件的GLM(generallinearmodel)方法對16個農(nóng)藝、品質(zhì)性狀觀測值進(jìn)行標(biāo)記與性狀的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明：(1)在公共圖譜上不論共線性的或是非共線性的ssR位點組合都有一定程度的LD，說明歷史上發(fā)生過連鎖群間的重組；栽培群體的連鎖不平衡成對位點數(shù)較野生群體多，但野生群體位點問連鎖不平衡程度高，隨距離的衰減慢。(2)群體ssR數(shù)據(jù)遺傳結(jié)
3、構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)，栽培群體和野生群體分別由9和4個亞群體組成，亞群的劃分與群體地理生態(tài)類型相關(guān)聯(lián)，證實地理生態(tài)類型劃分有其遺傳基礎(chǔ)。(3)栽培群體中累計有27個位點與性狀相關(guān)；野生大豆種質(zhì)中累計有34個位點與性狀相關(guān)。部分標(biāo)記在兩類群體中都表現(xiàn)與同一性狀關(guān)聯(lián)，檢出的位點有一致性，也有互補(bǔ)性；一些標(biāo)記同時與2個或多個性狀相關(guān)聯(lián)，可能是性狀相關(guān)乃至一因多效的遺傳基礎(chǔ)；關(guān)聯(lián)位點中累計有24位點(次)與遺傳群體連鎖分析定位的QTL一致。關(guān)鍵詞：栽培大豆【G砂c咖Fm甜(L．)Mem】；野生大豆(Gfyci，lPs咖sieb．etzucc．)；ssR；群體結(jié)構(gòu)；關(guān)聯(lián)分析AssociationAnaIysi
4、sofAgronomicandQualitymraitswithSSRMarkersinG砂c覷e瓏嬲andG砂c覷口s咖inChina：I．PopulationstructureandAssociatedMarkersWENZi—Xiang；ZHAOTuan—Jie，ZHENGYong—Zhan，LIUShun—Hu，WANGChun—E，WANGFang，觚dGAIJun—Yi‘(SoybeaIlResearchInstitIlteofN姐jingAgricult咐試Umvcfs時／NationaIcencer衙Soyb啪岫唧V鈿ent，N砸0nalKeyL呶腳oryforCropG爭
5、ne吐csa11dGem瞄asmEIlllaJlcement，Nanjing2l0095，Jiang姒。China)Abstract：AssocialjonmappingisaprocedurefordetectingQTLs勰weⅡasⅡ地irallelesbasedonliIll【agedisequilibrium(LD)．111egenotypingdataof60simple-sequencerepeat(SSR)markerSonrepresen洲Ves鋤plesof393landracesofG砂c咖懈(L．)MeIr．a(chǎn)11d196wildaccessionsofG咖c加8j
6、咖Sieb．etZucc．wercusediIlmepresentstIldy．LiIlkagedisequilibriumofpain】viseloci卸dpopulations仃uctIlrewerefirstly柚alyzedfortlle鉚opopul撕ons，ttlenmeassociat．onanalysisbetweenSSR10ci鋤d16agron0Illic柚dquality仃ai協(xié)waspe墑帥edbyusingTASsELGLM(generallinearmodel)pr0鯽n．111edi骶I．entdeg嗽sofLDwercdetectednotonly鋤ong
7、syntcnicmarkersbutalso鋤ongnOnsyntenic叩es，suggestingmatnlerehadbeenhistoricalre-combiIIation鋤onglilll【agegmups．，I'llecultivatedsoybeaIlpopulationhadmoreLDlocipairsmaIlwildsoybe柚populadon，while也e1a缸參rhadhi譬herdegre
