小麥tambd4基因的克隆、結(jié)構(gòu)及表達(dá)的初步分析

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1、萬(wàn)方數(shù)據(jù)20植物生理學(xué)通訊第44卷第1期,2008年2月小麥TaMBD4基因的克隆、結(jié)構(gòu)及表達(dá)的初步分析孟凡榮·,劉昊英1,司志飛1,尹鈞2,李永春2-’河南農(nóng)業(yè)大學(xué)1生命科學(xué)學(xué)院,2國(guó)家小麥工程技術(shù)研究中心,鄭州450002提要:以擬南芥MBD基因的EST為基礎(chǔ),采用電子克隆并結(jié)合RT.PCR方法分離克隆了包含開(kāi)放閱讀框的小麥甲基結(jié)合域蛋白基因TaMBD4.序列分析顯示,TaMBD4蛋白有典型的甲基結(jié)合域.組織表達(dá)特性分析表明,TaMBD4在干種子和胚乳中的表達(dá)量高于其它組織.TaMBD4的eDNA和基因組DNA比較分析顯示,此基因包括1個(gè)內(nèi)舍子,進(jìn)一步分析表明這個(gè)內(nèi)含子為2個(gè)GG

2、CAGT序列的串聯(lián)重復(fù),推測(cè)該內(nèi)含子可能與TaMBD4基因的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控相關(guān).關(guān)鍵詞:DNA甲基化;小麥;如jlf8D4;克??;基因結(jié)構(gòu)和表達(dá)PreliminaryStudyonCloning,StructureandExpressionofTaMBD4GeneinWheatMENGFan·Ron91,LIUHao-Yin91,SIZhi.Feil,YINJun2,LIYong-Chun2’’。CollegeofLifeScience,2NationalEngineeringResearchCentreforWheaf’HenanAgriculturalUniversity,Zheng

3、zhou450002,ChinaAbstract:InordertoprovideaninsightintomolecularcharacteristicsandputativeepigeneticfunctionsofMBDinwheat,agenewithcompleteopenreadingframe(ORF)designatedas死d舾回啤wasidentifiedinwheatby擁silicocloningapproachanditsfragmentwasclonedbvRT.PCR.AminoacidsequenceanalysisshowedthatTaMBD4co

4、ntainedaconservedmethyl-CpGbindingdomain.whichmightplayaputativeroleinepigeneticmechanism.SpatialexpressionanalysisshowedthattheexpressionlevelofIaMBD4washigherindryseedsandendospermthanthatinothertissuestested.ThecompartiveanalysisbetweeneDNAandgenomicDNAofthegeneshowedthatashortintronwasinclu

5、ded.Interestingly.wefoundthattheintronwascomposedof2tandemsimplesexluencerepeats.whichmightbeinvolvedintheposttranscriptionalregulationoftheTaMBD4.Keywords:DNAmethylation;wheat;死MBD4:cloning;genomicstructureandexpressionDNA甲基化是生物體內(nèi)普遍存在的一種基因修飾現(xiàn)象。植物基因組中DNA甲基化一般發(fā)生在mCpG、mCpNpG和mCpNpN(N=A、C或T)(Gruen

6、baum等1981;Matzke等1989:Tariq和Paszkowski2004),在植物組織特異性或發(fā)育調(diào)控性基因的表達(dá)中起重要作用,高等植物細(xì)胞在不同的分化與發(fā)育階段具有不同的甲基化模式,DNA甲基化的動(dòng)態(tài)變化是維持植物個(gè)體正常生長(zhǎng)發(fā)育的分子調(diào)控機(jī)制之--(Cao等2000;Finnegan等2000;Takeda和Paszkowski2006)。已有研究表明,DNA甲基化與基因表達(dá)調(diào)控密切相關(guān)。啟動(dòng)子及基因編碼區(qū)域的DNA甲基化或脫甲基化可以抑制或激活基因的轉(zhuǎn)錄,DNA甲基化調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的分子機(jī)制有2種可能:一是DNA甲基化直接干擾轉(zhuǎn)錄因子與啟動(dòng)子的結(jié)合(Eden和Ceda

7、r1994):二是甲基化的DNA上特異結(jié)合了甲基結(jié)合蛋白(methylationbindingdomainprotein,MBD),進(jìn)而召募轉(zhuǎn)錄抑制復(fù)合體(包括共抑制因子和組蛋白脫乙?;傅?,誘發(fā)組蛋白的脫乙?;?,導(dǎo)致染色體結(jié)構(gòu)的變化和轉(zhuǎn)錄的抑制(Springer和Kaeppler2005:Ballestar和Esteller2005)。多數(shù)的實(shí)驗(yàn)都支持第2種機(jī)制。甲基結(jié)合域蛋白MBD是與甲基化DNA特異結(jié)合的反式作用因子,在基因表達(dá)調(diào)控和維持生物體正常

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