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《ssr標(biāo)記技術(shù)在植物遺傳多樣性研究上的應(yīng)用》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫(kù)。
1、ChineseAgriculturalScienceBulletinVol.22No.72006July·90·http://www.casb.org.cn農(nóng)業(yè)生物技術(shù)科學(xué)SSR標(biāo)記技術(shù)在植物遺傳多樣性研究上的應(yīng)用楊進(jìn)(荊門職業(yè)技術(shù)學(xué)院生物工程系,湖北荊門448000)摘要:微衛(wèi)星(microsatellites)或簡(jiǎn)單序列重復(fù)(simplesequencerepeats,SSRs)是以1~6個(gè)堿基為基本單元的串聯(lián)重復(fù)序列,具有含量豐富、多態(tài)性高、共顯性和檢測(cè)方法簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn),是研究植物遺傳多樣性的優(yōu)異的分子標(biāo)記之一,已被用于多種植物的遺傳多樣性研究。概述
2、了微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的原理及特點(diǎn),介紹了其實(shí)驗(yàn)技術(shù)方法及發(fā)展,探討了其在植物遺傳多樣性中的應(yīng)用和發(fā)展前景。關(guān)鍵詞:微衛(wèi)星DNA標(biāo)記;遺傳多樣性;植物中圖分類號(hào):Q75文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:ATheApplicationofMicrosatelliteDNAMarkerinPlantGeneticDiversityResearchYangJin(DepartmentofBiologicalEngineering,JingmenTechnicalCollege,JingmenHubei448000)Abstract:Microsatellite,alsoknownass
3、implesequencerepeats,wasrandomrepetitivesequencescom-posedofmotifof1~6bp.Asithadmanyadvantages,suchasabundance,highpolymorphism,codomi-nance,simpleprocess,microsatelliteDNAmarkerwasoneoftheexcellentmolecularmarkerinplantge-neticdiversityresearch.Ithadbeenappliedtogeneticdiversity
4、researchinmanyplants.Thetheoryandcharacteristicswasbrieflysummarized.Itsexperimentationmethodsanddevelopmentwaspresented.Theapplicationandfutureinplantgeneticdiversityresearchwasdiscussed.Keywords:MicrosatelliteDNAmarker,Geneticdiversity,Plant微衛(wèi)星(microsatellites)或簡(jiǎn)單序列重復(fù)(simple要豐富
5、得多[4~7]。擬南芥、大豆、玉米、大麥、水稻、西紅sequencerepeats,SSRs)是以1~6個(gè)堿基為基本單元的柿等重要植物的SSR位點(diǎn)已被整合到遺傳圖譜串聯(lián)重復(fù)序列[1]。它們普遍存在和隨機(jī)分布于大多數(shù)上[8~12]。真核生物的基因組中,重復(fù)數(shù)具有高頻率的變異。這遺傳多樣性是一個(gè)需要用種、變種、亞種或品種的種?;稽c(diǎn)的多態(tài)性可以十分容易地通過設(shè)計(jì)特異遺傳變異來衡量其內(nèi)部變異性的概念,遺傳多樣性為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增檢測(cè)。由于SSR高水平的多態(tài)性、物種和個(gè)體的適應(yīng)及進(jìn)化提供原材料。利用DNA分容易檢測(cè)和共顯性等特點(diǎn),使得它們成為一個(gè)豐富的子標(biāo)記技
6、術(shù)可以有助于從本質(zhì)上揭示物種遺傳變異及遺傳標(biāo)記來源。目前含有約8000個(gè)位點(diǎn)的高飽和人其變異規(guī)律,而微衛(wèi)星DNA標(biāo)記技術(shù)是研究遺傳多類微衛(wèi)星圖譜已經(jīng)完成[2],一些哺乳動(dòng)物的SSR遺傳樣性水平和居群間的相互關(guān)系及統(tǒng)計(jì)分析居群的遺傳圖譜也被構(gòu)建。結(jié)構(gòu)、等位基因頻率以及居群間的遺傳分化的優(yōu)異的在植物系統(tǒng)中,Condit和Hubbel首先對(duì)5個(gè)熱帶分子標(biāo)記之一,已被用于多種植物的遺傳多樣性研究。森林樹種和玉米中的微衛(wèi)星進(jìn)行了研究,結(jié)果表明在1微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的原理及特點(diǎn)[3]。隨后,一些主要栽培1.1植物中同樣存在豐富的微衛(wèi)星微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的基本原理植物中的
7、SSR類型及頻率也相繼被評(píng)價(jià)。大豆、水稻、微衛(wèi)星DNA廣泛存在于各種真核生物的基因組玉米和擬南芥中的SSR變異比其他分子標(biāo)記如RFLP中,而且分布比較均勻[13]。鑒于微衛(wèi)星DNA序列具有基金項(xiàng)目:湖北省科技攻關(guān)項(xiàng)目“金銀花“中銀一號(hào)”的選育及高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)立體栽培模式的研究(2005AA201C53)。作者簡(jiǎn)介:楊進(jìn),男,1969年出生,湖北天門人,碩士學(xué)歷,副教授;研究方向:植物生物技術(shù),主持多項(xiàng)省市科研項(xiàng)目,發(fā)表科研論文近20篇。E-mail:jmyangjin@tom.com。收稿日期:2006-03-02,修回日期:2006-03-12。中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào)
8、第22卷第7期2006年7月農(nóng)業(yè)生物技術(shù)科學(xué)http://www.casb.or