鱭屬魚類和江鱈的線粒體基因組全序列研究

《鱭屬魚類和江鱈的線粒體基因組全序列研究》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內(nèi)容在學術論文-天天文庫。

1、＾個躬各義々（ＫＡＮＵＮＮＡＦＩＶＥＲＳＩＴＹＯＦＣＨＩ碩±學位論文ＭＡＳＴＥＲＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮ論文趣目：巧巧魚類和江健的線粒體基因組全序列研究ＳｔｕｄｉｅｓｏｎＣｏｍｐｌｅｔｅＭｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＧｅｎｏｍｅｓ：ｏｆｅｎｕＣｏｉｌｉａａｎｄｏｔａｏｔａ巧文跑目ＧｓＬｌ作者：指導教師：？天翔教巧學位類別：全日制學術學位專業(yè)名稱：漁業(yè)資源研究方向：漁業(yè)生物學ｉ＾ＳＰＫＩＭ＾Ｓ謹心又此論文獻給我的母校張楠

2、驕屬魚類和江轄的線粒體基因組全序列研究學位論文答辯日期＜：指導教巧簽字：答辯委員會巧員簽字；乂斗Ｉ窺締ｙ＃ｆ獨創(chuàng)汚明本人聲明所呈交的學位論文是本人在導師指導下進行的研巧工作及取得的研巧成果。據(jù)我所知，除了文中特別加Ｗ標注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研巧成果，也不包含未獲得（注；如沒有其他需要特別聲明的，本欄可巧）或巧他教育機構的學位或證書使用過的材料一。與我同工作的同志對本研巧所做的任何貢獻均己在論文中作了明確的說明并表示謝意。學位論文作者簽名：簽宇日期

3、：１月曰珠１０任年６＾巧＾１什學位論文版權使用授權書、本學位論文作者完全了解學校有關保留使用學位論文的規(guī)定，并同意Ｗ下事項：１、學校有權保留并向國家有關部口或機構送交論文的復印件和磁盤，允許論文被査閱和借閱。２、學?？蓪W位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關數(shù)據(jù)庫進行檢索，可Ｗ＂采用影印、縮印或掃描等復制手段保存、匯編學位論文。同時授權清華大學中＂國學術期刊（光盤版）電子雜志枉用于出版和編入ＣＮＫＩ《中國知識資源總庫》，授權中國科學技術信息研巧所將本學位論文收錄到《中國學位論文全文數(shù)據(jù)庫》。（保密

4、的學位論文在解密后適用本授權書）：學位論文作者簽名：＾導師簽字《秦餐簽字日期一ｏＫ年《月４日簽字日期年＾月＾日＾少（驕屬魚類和江質(zhì)的線粒體基因組全序列研究摘要驕屬（。／從７）魚類是廣泛分布于太平洋西北部和印度洋中小型魚類，主要棲息于沿岸海域一，多進行短距離溯河生殖徊游。我國擠屬魚類的分類直存在爭０議一。江錯ａ〇＾Ｗｏｗ）是蜂科中唯的淡水魚類，主要分布在北絳４〇＾北的歐洲、亞洲和北美洲，是北極淡水區(qū)冷水性肉食魚類。本研巧對刀巧、鳳轎和韋絲轎的線粒體基因組結構和組成進行了分析與比較，并在線粒體

5、基因組全序列水平探討了轎屬魚類的系統(tǒng)發(fā)育關系Ｗ及刀轎、鳳轎的種內(nèi)遺傳分化程度。同時，比較分析了江蜂Ｈ個區(qū)域內(nèi)個體的線粒體基因組的結構和組成，并討論了江擅在分布范圍內(nèi)的遺傳分化。主要結果如下：１．刀巧、鳳巧和屯絲巧線粒體基因組特征分析本研究擴増得到刀巧Ｈ個單倍型類群的線粒體基因組全序列，全長分別為１６８％ｂｐ、１６９００ｂｐ和１６８９６ｂｐ；鳳巧南北世系的線粒體基因組全序列，全長分別為１６９６４ｂｐ和１７０７５ｂｐ；韋絲轎線粒體基因組全序列全長為１６８５１ｂｐ。Ｈ種巧屬魚類長度差異主要由于三者控制區(qū)內(nèi)均

6、存在庫聯(lián)重復巧列。Ｈ者線粒體基因組包括１３個蛋白質(zhì)編碼基因、２２個ｔＲＮＡ基因、２個ｒＲＮＡ基因和２個非編碼區(qū)一（控制區(qū)和〇Ｌ）。，其排列順序與大多數(shù)脊椎動物相致在巧基組成上，ＧＣ含量在兩條鏈中均具明顯偏倚，但ＡＴ含量相差不大，Ｈ與Ｌ鏈蛋白質(zhì)編碼基因巧碼子第Ｈ位點分別呈現(xiàn)明顯的反Ｇ和反Ｃ偏倚，并反映在Ｗ相同巧基結尾的密碼子使用偏好上。王者蛋白質(zhì)編碼基因的起始密碼子和終止密碼子完全相同，除ＣＯＩＷＧＴＧ為起始密碼子外，其余均ＷＡＴＧ為起始密碼子；終止密碼子包括＾ａｇｙ）ＴＡＡ－－、ＴＡ和Ｔ王種類型。除

7、了ＩＲＮＡ外，其余化ＮＡ均能形成穩(wěn)定的莖環(huán)結構，刀巧各單倍型類群間及鳳巧南北世系間在ｔＲＮＡ上的堿基替換大多發(fā)生在環(huán)區(qū)。除了存在串聯(lián)重復序列而導致線粒徒基因組全序列長度差異外，巧屬魚－類控制區(qū)結構較為保守。在控制區(qū)識別了終止序列區(qū)、中央保守區(qū)（ＣＳＢＦ？Ｄ）－？３和保守序列區(qū)（ＣＳＢ１）。刀巧Ｈ個單倍型類群線粒體基因組全序列間妓義度較?。ǎ迹埃埃埃矗?，但鳳巧南北世系線粒體基因組全序列間呈現(xiàn)較大的歧義度。２．基于線粒體基因組全序列的巧屬魚類《統(tǒng)發(fā)育關系聯(lián)合線粒體基因組中各進化速率不同的片段，利用貝葉斯聯(lián)

8、合模型和ＭＬ分析方法重建了轎屬魚類的系統(tǒng)進化關系，結果顯示，所研究的巧屬魚類分為兩個一大分支。第個分支中包含刀轎、韋絲斷和林氏轎。其中，刀轎和走絲驕親緣關系最近，然后再與，形成姐妹種林氏轎聚類。本研巧中刀轎的Ｈ個單倍型類群