稗草葉綠體基因組測序及其分子標(biāo)記開發(fā)與利用

稗草葉綠體基因組測序及其分子標(biāo)記開發(fā)與利用

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時(shí)間:2019-03-13

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1、.JWi碩士學(xué)位論文中文論文題目:稗草葉綠體基因組測序及其分子標(biāo)記開發(fā)與利用英文論文題目::巾沾人姓名:林張翔指導(dǎo)教郵:———專業(yè)學(xué)位類別:專業(yè)學(xué)位領(lǐng)±成:作所在學(xué)院:農(nóng)業(yè)張物技術(shù)學(xué)院論文提交日期丨年!月分類號(hào)單位代碼:密級(jí)學(xué)號(hào):碩士學(xué)位論文中文論文題目:稗萆葉綠體基因組測序及其分子標(biāo)記開發(fā)與利用英文論文題目:申請人姓名:林張翔指導(dǎo)教師:變龍江教授專業(yè)學(xué)位類別:農(nóng)學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位領(lǐng)域:作物學(xué)所在學(xué)院:農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院論文提交日期年月稗草葉綠體基因組測序及其分子標(biāo)記開發(fā)與利用論文作者簽名:指導(dǎo)教師簽名:論文評(píng)閱人評(píng)閱人評(píng)閱人評(píng)閱人評(píng)閱人答辯委員會(huì)主席:委員委員委員後爺崎委員委

2、員答辯日期:二、?EchinochloachloroplastgenomesequencinganddevelopmentofmolecularmarkersAuthor'ssignature:LyvSupervisor'ssignature:Thesisreviewer1::::::::::浙江大學(xué)研宄生學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研宄成果。除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研宄成果,也不包含為獲得浙江大學(xué)或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的

3、任何貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確的說明并表示謝意。學(xué)位論文作者簽名簽字曰期:年月日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解浙江大學(xué)有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交本論文的復(fù)印件和磁盤,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)浙江大學(xué)可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索和傳播,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。保密的學(xué)份論文在解密后話用本將叔書)浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文目錄目錄搬文獻(xiàn)綜述稗草簡介葉綠體基因組學(xué)研宄葉綠體基因組結(jié)構(gòu)及研宄現(xiàn)狀葉綠體基因組測序技術(shù)進(jìn)展葉綠體基因組在植物系統(tǒng)發(fā)育研宄中的應(yīng)用材料與方法實(shí)驗(yàn)材料與數(shù)據(jù)實(shí)驗(yàn)方法物種鑒定稗草葉綠體基因

4、組分析稗屬進(jìn)化分析稗草葉綠體分子標(biāo)記開發(fā)結(jié)果與分析物種鑒定表型鑒定系統(tǒng)進(jìn)化分析葉綠體基因組拼接葉綠體基因組注釋葉綠體基因組比較分析稗屬分化時(shí)間估計(jì)稗草葉綠體分子標(biāo)記開發(fā)隨碩士期間發(fā)表論文浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文致謝致謝七年浙大夢,一生求是情。轉(zhuǎn)眼間已在浙大學(xué)習(xí)生活了七年,在這美麗的求是園里,每一條路都有我的足跡,每一個(gè)角落都有我的回憶。時(shí)光匆匆,如白駒過隙,回想這三年的研究生生活有太多的收獲、感動(dòng)與不舍,在這即將畢業(yè)的時(shí)刻,我由衷的感謝一路走來給予我支持、鼓勵(lì)與幫助的人。首先要感謝的是我的導(dǎo)師樊龍江教授。本課題能夠順利完成,離不開樊老師的諄諄教誨和悉心指導(dǎo),在研究項(xiàng)目的選題、路

5、線設(shè)計(jì)、方案實(shí)施直至論文撰寫等各個(gè)環(huán)節(jié),樊老師都嚴(yán)格把關(guān),投入了大量的時(shí)間和心血。樊老師在科研和生活上都給了我很大的幫助,他淵博的學(xué)識(shí)、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)闹螌W(xué)態(tài)度、求真務(wù)實(shí)的科研精神和精益求精的工作作風(fēng)都深深的影響了我,使我受益匪淺,讓我在學(xué)習(xí)專業(yè)知識(shí)的同時(shí)也領(lǐng)會(huì)到了許多待人接物與為人處世的道理。其次,我要感謝本實(shí)驗(yàn)室的講師葉楚玉、師兄桂毅杰、閆成海、劉揚(yáng)、邱杰、王營營,師姐白雪菲、吳三玲,以及師弟師妹王衛(wèi)娣、沈恩惠、法一飛、陳力、付菲、毛凌鋒、褚琴潔、于勇一、劉晨等人在生物信息和實(shí)驗(yàn)方面提供的幫助,讓我在這樣一個(gè)溫馨團(tuán)結(jié)的大家庭中順利的完成課題。感謝張海強(qiáng)在科研上的鼓勵(lì)幫助和生活上的

6、悉心照顧,感謝他對我的包容和付出,與我共同分享快樂分擔(dān)壓力,陪我度過了一段別樣精彩的研究生生活。感謝吳敏潔、季靈艷等每一位好朋友在生活上的關(guān)心和幫助。最后,我要感謝我親愛的爸爸媽媽,感謝他們的養(yǎng)育之恩,感謝他們?yōu)槲宜冻龅牡囊磺?,他們的支持和鼓?lì)是我不斷拼搏進(jìn)取的動(dòng)力源泉和精神支柱。值此論文即將完成之際,我謹(jǐn)向所有給予我關(guān)心、支持和幫助的老師、朋友、親人,以及參加本次論文評(píng)閱和答辯的各位老師表達(dá)最誠摯的謝意!林張翔年月于浙大紫金港浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要摘要禾本科稗屬包含大量能夠?qū)е伦魑锂a(chǎn)量減少的雜草,在全世界范圍內(nèi)廣泛分布,形態(tài)復(fù)雜多樣,分類鑒定較為困難。隨著高通量測序技

7、術(shù)的發(fā)展,序列信息成為了物種研究和進(jìn)化分析的基礎(chǔ),然而至今為止,稗屬的序列信息仿然十分有限。本研究通過對稗屬兩個(gè)種水田稗和稗(新鮮綠色葉片進(jìn)行高通量測序,利用葉綠體基因組序列的保守性進(jìn)行稗草葉綠體拼接組裝,獲得了兩條完整的稗草葉綠體基因組序列。此外,研究利用葉綠體基因組估算了稗屬的分化時(shí)間,并開發(fā)了分子標(biāo)記,為稗屬的全基因組研究奠定了基礎(chǔ)。具體結(jié)果如下:水田稗的葉綠體基因組長,,大單拷貝區(qū)(長小單拷貝區(qū)長反向重復(fù)區(qū)長,。稗的葉綠體基因運(yùn)長,長,長,長。兩條葉綠體基因組之間存在個(gè)插入缺失和個(gè)堿基替換位點(diǎn),均包含蛋白編

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