基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的荊州黑麥基因組特異標(biāo)記開(kāi)發(fā)與染色體定位分析

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1、分巧號(hào)?淵學(xué)號(hào)20測(cè)1178?.為請(qǐng)泉達(dá)*參全日制專業(yè)學(xué)位碩壬學(xué)位論文基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的荊州黑麥基因組特異標(biāo)記開(kāi)發(fā)與染色體定位分析了桃春指導(dǎo)教師開(kāi)增軍教授學(xué)位類別農(nóng)業(yè)推廣碩±專業(yè)名稱作物.-r.'研究方向小麥分子細(xì)胞遺傳學(xué)—VV.答辯日期二〇五年八月—\_'J..'式■'-■■,??《..?I:>■....■'A:DEVELOPMENTANDPHY別CALLOCALIZATIONOf-RYEGENOM

2、ESPECIFICMARKERSBASEDONTRANSCRIPTOMESEQUENCESOFSECALECEREALSByDingTaochunSupervisedbyProf.QiZengjunADissertationSubmittedtoNaninAriculturalUniversitjggy化PartialFulfiUment化化eRequirements化rMasterDegreeofAgriculturalScienceNaninAriculturalUniversitjgg

3、yAuust2015g,原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文,是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下,獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外,本論文不包含任何其他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過(guò)的作品成果。對(duì)本文的研究做出重要貢獻(xiàn)的個(gè)人和集體,均已在文中W明確方式標(biāo)明。本人完全意識(shí)到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者(需親筆)簽名:節(jié))(弁5日了;^^學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書(shū)本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,同意學(xué)校保留并向國(guó)家有關(guān)部口或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版。,允許論文被査閱和借閱本人授權(quán)南京農(nóng)業(yè)大學(xué)

4、可W將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,可W、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編學(xué)位論文采用影印。保巧□,在年解密后適用本授權(quán)書(shū);本學(xué)位論文屬于不保密口。(請(qǐng)"。在W上方框內(nèi)打V)學(xué)位論文作者(需親筆)簽名;1>,s年W曰巧)庵?導(dǎo)師(需親筆)簽名年月T日^目錄目錄摘要IABSTRACT陽(yáng)一第部分文巧綜巧11分子標(biāo)記在小麥染色體工程中的應(yīng)用11.1染色體工程的概念與意義11.2分子標(biāo)記的類型與發(fā)展11.3基于NGS測(cè)序的分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)與應(yīng)用21.4分子標(biāo)巧在小麥染色體工程中的應(yīng)用4

5、1.4.1鑒定染色體部分同源性41.4.2用于小麥異染色體系的選育與鑒定.41.4.3外源抗病基因的追蹤與輔助選擇51.4.4外源抗性基因的精細(xì)定位與克隆5第二部分研究報(bào)告71材料與方法.......—71.1植物材料718.2來(lái)源于荊州黑麥的轉(zhuǎn)錄組序列相似性比較和引物設(shè)計(jì)1.3分子標(biāo)記分析81.3DNA.1的提?。福崳姡保茫遥墸梗崳姡常玻墸袛U(kuò)増及擴(kuò)増產(chǎn)物的檢測(cè)2結(jié)果與分析92.1百薩偃麥草ESTs標(biāo)記在荊州黑麥中的可轉(zhuǎn)移性分析92-.2基于RNAS巧的荊州黑麥基因組特異標(biāo)記開(kāi)發(fā)與染

6、色體定位102.2.1引物設(shè)計(jì)101基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的荊州黑麥基因組將異標(biāo)記開(kāi)發(fā)與染色體定位分析2.2.2引物的擴(kuò)增分析和荊州黑麥基因組特異標(biāo)記的篩選112.2.3多態(tài)性標(biāo)記在荊州黑麥染色體上的定位132.3荊州黑麥特異標(biāo)記的應(yīng)用分析20324-3.1基于RNAseq開(kāi)發(fā)荊州黑麥特異標(biāo)記的特點(diǎn)243.2荊州黑麥特異標(biāo)記的染色體定位253.3荊州黑麥特異標(biāo)記的應(yīng)用潛力25全文結(jié)論27參教獻(xiàn)29致巧35摘要基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的荊州黑麥基因組特異標(biāo)記開(kāi)發(fā)與染色體定位分析摘要工

7、、優(yōu)品種的重要途徑。分子染色體程是拓寬小麥遺傳基礎(chǔ),培育高產(chǎn)質(zhì)和抗?。?、入加快外源基因的轉(zhuǎn)標(biāo)記可有效追蹤鑒定導(dǎo)到小麥背景中的外源染色體和片段,移利用和物理定位,為染色體工程的發(fā)展注入了新的活為。我國(guó)栽培黑麥品種荊州黑麥(庇ca/ecerea/eL.CV.Jingzhouheimai,JZHM)高抗白粉病、黃花葉病和紋枯病,在其染色體化和化上均發(fā)現(xiàn)抗白粉病基因,但是,由于這些染色體在巧有有利基因的同時(shí)還攜帶不利基因,因此培育僅具目標(biāo)基因的小片段

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