日本結(jié)縷草在機(jī)械損傷脅迫下的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析

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1、ｃＳＴＲ＇＾Ｖ分類號(hào)ｏＶｆＴＨＥＳＩＳ＾ｌｕｉｃｘ日本結(jié)縷草在機(jī)械損傷脅迫下的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析（中文題名）ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅＳｅｑｕｅｎｃｉｎａｎｄＡｎａｌｓｉｓｏｆＺｏｓｉａａｏｎｉｃａｇｙｙｊｐＵｎｄｅｒｔｈｅＭｅｃｈａｎｉｃａｌＷｏｕｎｄｉｎＴｒｅａｔｍｅｎｔｇ‘（英文題名）李亞超（作者姓名）指導(dǎo)教前曾會(huì)明副教授申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士學(xué)科專業(yè)名稱草學(xué)研究方向草地植物生物技術(shù)與遺傳育種論文提交日期２０１５年４月論立答辯日期２０１５年６月學(xué)位授予日期：，答辯

2、委員會(huì)主席‘：？：評(píng)閱人：先索林大學(xué)碩士論文同意發(fā)表的聲明研究生院：本人及導(dǎo)師完全同意《中國優(yōu)秀博碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫“”出版章程》（以下簡(jiǎn)稱章程）及我校與中國學(xué)術(shù)期刊（光盤版）電子雜志社簽定的《ＣＮＫＩ共建共享中國優(yōu)秀博碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫（ＣＤＭＤ）和北京林業(yè)大學(xué)研究生院博碩士學(xué)位論文全文數(shù)“”據(jù)庫（ＤＭＤ）協(xié)議書》（以下簡(jiǎn)稱協(xié)議書）的有關(guān)內(nèi)容，愿意將本人的碩士學(xué)位論文委托研究生院向中國學(xué)術(shù)期刊（光盤版）電子雜志社的《中國優(yōu)秀博碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫》投稿。所在：學(xué)科為，論文題目為：》給予出版希望《中國優(yōu)秀博

3、碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫，并同意在《中國博碩士學(xué)位論文評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)庫》和ＣＮＫＩ系列數(shù)據(jù)庫中使用，同意按章程和協(xié)議書規(guī)定孚受相關(guān)權(quán)益。作者簽名：導(dǎo)師簽名劃?。誓辏对拢?？日永久聯(lián)系地址（郵編）：永久聯(lián)系電話：注：《中國優(yōu)秀博碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫出版章程》可從ｈｔｔｐ：／／ｇｒａｄｕａｔｅ，ｂ．ｊｆｕ．ｅｕｄ．ｃｎ中學(xué)位工作／學(xué)位論文欄目下瀏覽獨(dú)創(chuàng)性聲明……本人聲明所呈交的論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下（或我個(gè)人）進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也

4、不包含為獲得北京林業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料一。與我同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。簽名：日期：關(guān)于論文使用授權(quán)的說明、本人完全了解北京林業(yè)大學(xué)有關(guān)保留使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：學(xué)校有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件，允許論文被查閱和借閱；學(xué)?？梢怨颊撐牡娜炕虿浚崳姺謨?nèi)容，可以采用影印、縮印或其他復(fù)制手段保存論文。（保密的論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定）一：簽名：導(dǎo)師簽名：日期樣ｂ、ｌｌ摘要為了探討日本結(jié)縷草響應(yīng)機(jī)械損傷的分子機(jī)理，本研究在機(jī)械損傷脅迫下對(duì)日本結(jié)縷草葉片進(jìn)行轉(zhuǎn)

5、錄組測(cè)序分析。通過研究，得到如下結(jié)論：Ｄ１．根據(jù)磷脂酶基因的表達(dá)模式及過氧化氧含量、細(xì)胞膜透性的檢測(cè)結(jié)果表明，植株組織在機(jī)械損傷脅迫下隨時(shí)間的響應(yīng)趨勢(shì)中，脅迫處理Ｏｉｌ、２ｈ、６ｈ三個(gè)處理時(shí)間點(diǎn)存在顯著差異，可確定機(jī)械損傷處理Ｏｈ（Ｔ７）、２ｈ（Ｔ８）和６ｈ（Ｔ９）為后續(xù)測(cè)序及驗(yàn)證試驗(yàn)的條件。２．高通量測(cè)序得到１５．９Ｇｂ數(shù)據(jù)量，Ｔｒｉｎｉｔ組裝得到７４３８５Ｕｎｉｅｎｅｓ。通ｙ軟件，ｇ過蹄選Ｔ７與Ｔ８得到３２９９個(gè)差異基因（ＤＥＧｓ），其中２３７４上調(diào)表達(dá)，９２５下調(diào)表達(dá)；，，Ｔ７與Ｔ９蹄選得到３，３１７個(gè)ＤＥＧｓ，其中２，４３３上調(diào)表達(dá)

6、，８８４下調(diào)表達(dá)。３３８０８４Ｕｎｉｅｓ１４６３２ＣＯＧ，２７８５７．共有。個(gè)，ｇｅｎ得到注釋，個(gè)基因注釋到數(shù)據(jù)庫，注釋到ＧＯ數(shù)據(jù)庫，７，２０１個(gè)基因注釋到ＫＥＧＧ，其中，涉及基因的復(fù)制，重組和修一。復(fù)及氧化磷酸化等與損傷脅迫相關(guān)的信號(hào)傳導(dǎo)，氧化還原反應(yīng)等系列代謝通路４通過對(duì)差異基因的功能分類分析，著重蹄選了與過氧化氫代謝途徑相關(guān)的基．因。推測(cè)在植物響應(yīng)機(jī)械損傷脅迫中，過氧化物酶（ＰＯＤ）可能是較為重要的抗氧化物酶。從結(jié)果中蹄選出１３個(gè)功能注釋為ＰＯＤ的Ｕｎｉｇｅｎｅｓ。根據(jù)表達(dá)模式的不同，ＰＯＤ異構(gòu)體有三類功能：（１）與生成過氧化氫有關(guān)的異構(gòu)體ＰＯ

7、Ｚ）（２、７０、５６、５９、６２）；（２）與清除過氧化氫有關(guān)的異構(gòu)體ＰＯＤ１９；（３）可能協(xié)同參與過氧化氧的生成與清除過程的異構(gòu)體ＰＯＤ１。５．通過實(shí)時(shí)熒光定量ＰＣＲ，成功驗(yàn)證５個(gè)基因在Ｔ７、Ｔ８和Ｔ９的表達(dá)情況（基因ＩＤ為ｃ４５８６７．ｈｃＯ、ｃ５４５６０．ｒａｈｃ０、ｃ３８７３５１１．口ｒａ．ｒａｈｃ０、ｃ４６０ｒａｈｃ０禾ｇｐｇｐｇｐ＿ｇｐ＿＿＿ｃ４９４４０ｒａｃ０。，。．ｇｈ）其中三個(gè)上調(diào)兩個(gè)下調(diào)表達(dá)ｐ—ｅｎｉｔｈ，，，關(guān)鍵字：日本結(jié)縷草Ｚ機(jī)