油菜非特異性脂轉(zhuǎn)運蛋白基因家族的全基因組水平鑒定和表達(dá)分析

油菜非特異性脂轉(zhuǎn)運蛋白基因家族的全基因組水平鑒定和表達(dá)分析

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1、分類號:S512.1學(xué)校代碼:10712UDC:633.10研究生學(xué)號:2013050113密級:公開灶衣林研枚大學(xué)2015屆全日制碩士專業(yè)學(xué)位研究生學(xué)位論文油菜非特異性脂轉(zhuǎn)運蛋白基因家族的全基因組水平鑒定和表達(dá)分析類頌農(nóng)業(yè)推廣碩士領(lǐng)域、方向作物研究生王洪指導(dǎo)教師馬翎健教授胡贊民教授完成時間2015年5月中國陜西楊凌研究生學(xué)位論文的獨創(chuàng)性聲明本人聲明:所呈交的全曰制碩士專業(yè)學(xué)位論文是我個人在導(dǎo)師指導(dǎo)下獨立進行的研究工作及取得的研究結(jié)果;論文中的研究數(shù)據(jù)及結(jié)果的獲得完全符合學(xué)?!蛾P(guān)于規(guī)范西北農(nóng)林科技大學(xué)研究生學(xué)術(shù)道德的暫行規(guī)定》,如果違反此規(guī)定,一

2、切后果與法律責(zé)任均由本人承擔(dān)。盡我所知,除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論丈中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究結(jié)果,也不包含其他人和自己本人已獲得西北農(nóng)林科技大學(xué)或其它教育機構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料,與我一同工作的同事對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文的致謝中作了明確的說明并表示了謝意8研究生簽名:時間:7〇以年t月i曰導(dǎo)師指導(dǎo)研究生學(xué)位論文的承諾本人承諾:我的全日制碩士專業(yè)學(xué)位研究生所呈交的碩士學(xué)位論文是在我指導(dǎo)下獨立開展研究工作及取得的研究結(jié)果,屬于我現(xiàn)崗職務(wù)工作的結(jié)果,并嚴(yán)格按照學(xué)?!蛾P(guān)于規(guī)范西北農(nóng)林科技大學(xué)研究生學(xué)術(shù)道德的暫行規(guī)定

3、》而獲得的研究結(jié)果。如果違反學(xué)?!蛾P(guān)于規(guī)范西北農(nóng)林科技大學(xué)研究生學(xué)術(shù)道德的暫行規(guī)定》,我愿接受按學(xué)校有關(guān)規(guī)定的處罰處理并承擔(dān)相應(yīng)導(dǎo)師連帶責(zé)任。關(guān)于研究生學(xué)位論文使用授權(quán)的說明本學(xué)位論文的知識產(chǎn)權(quán)歸屬西北農(nóng)林科技大學(xué).本人同意西北農(nóng)林科技大學(xué)保存或向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的紙質(zhì)版和電子版,允許論文被查閱和借閱;同意西北農(nóng)林科技大學(xué)將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容授權(quán)匯編錄入《中國優(yōu)秀碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫》進行出版,并享受相關(guān)權(quán)益.本人保證,在畢業(yè)離開(或者工作調(diào)離)西北農(nóng)林科技大學(xué)后,發(fā)表或者使用本學(xué)位論文及其相關(guān)的工作成果時,將以西北農(nóng)林科技大

4、學(xué)為第一署名單位,否則,愿意按《中華人民共和國著作權(quán)法》等有關(guān)規(guī)定接受處理并承擔(dān)法律責(zé)任。任何收存和保管本論文各種版本的其他單位和個人(包括研究生本人)未經(jīng)本論文作者的導(dǎo)師同意,不得有對本論文進行復(fù)制、修改、發(fā)行、出租、改編等侵犯著作權(quán)的行為,否則,按違背《中華人民共和國著作權(quán)法》等有關(guān)規(guī)定處理并追究法律責(zé)任。(保密的學(xué)位論文在保密期限內(nèi),不得以任何方式發(fā)表、借閱、復(fù)印、縮印或掃描復(fù)制手段保存、匯編論文)研究生簽名:時間:年(月曰油菜非特異性脂轉(zhuǎn)運蛋白基因家族的全基因組水平鑒定和表達(dá)分析摘要油菜是我國最重要的油料作物,其最主要的育種目標(biāo)是提高油菜

5、種子油脂含量和改良脂肪酸組分。特異性脂轉(zhuǎn)運蛋白(nsLTPs)是一類分子量小的堿性蛋白質(zhì)。它們具有8個位置保守的半胱氨酸殘基,這8個半胱氨酸殘基參與形成4個二硫鍵。植物nsLTPs具有多種不同的功能,例如響應(yīng)不同的外界環(huán)境條件,抵抗細(xì)菌和真菌病原體,影響有性生殖以及最基本的調(diào)控脂質(zhì)轉(zhuǎn)運等。既然nsLTPs的一個主要功能是調(diào)控脂質(zhì)轉(zhuǎn)運,那么它們可能影響油菜種子含油量以及脂肪酸組成。但是目前還沒有在基因組水平上研究油菜nsLTPs基因家族的相關(guān)報道。所以我們的目地就是在基因組水平上研究油菜nsLTPs基因家族。通過生物信息學(xué)手段全面地分析白菜型油菜的

6、基因組,本研究一共鑒定了77個BrnsLTPs候選基因?;谒鼈兊陌被嵝蛄邢嗨菩?,這些BrnsLTPs一共可以劃分為10個亞類(I、II、III、IV、V、VI、VII、VIII、IX和Y)。共線性分析結(jié)果證明全基因組復(fù)制事件(WGD)是BrnsLTPs家族成員擴張的主要方式。BrnsLTPs基因在不同器官或組織的轉(zhuǎn)錄本文件表明它們具有不同的基因表達(dá)模式。其中有一些BrnsLTPs基因只在或主要在莢中表達(dá),這暗示它們可能與種子含油量以及脂肪酸組成相關(guān)聯(lián)。此外,大部分BrnsLTPs基因能響應(yīng)Pi的誘導(dǎo)。總之,在基因組水平鑒定BrnsLTPs成員

7、,對其進行生物信息學(xué)分析和表達(dá)分析,將會促進該基因家族的研究,并為闡明它們在種子含油量和脂肪酸組成方面的生物學(xué)功能提供新的視角。關(guān)鍵詞:白菜型油菜;非特異性脂質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白;基因克?。槐磉_(dá)分析GENOME-WIDEIDENTIFICATIONANDEXPRESSIONANALYSISOFBRNSLTPSGENEFAMILYINBRASSICARAPAABSTRACTNon-specificlipidtransferproteins(nsLTPs)aresmallandbasicproteinscharacterizedbyaconservedpatt

8、ernofeightcysteines,formingfourdisulfidebridges.Therearemanydifferen

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