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《胃癌組織的dna甲基化和基因表達(dá)研究》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、分類號(hào)：密級(jí)：?jiǎn)挝淮a：10092學(xué)號(hào)：20121277漱方雜HEBEINORTHUNIVERSITY碩士學(xué)位論文胃癌組織的DNA甲基化和基因表達(dá)研究單位：河北北方學(xué)院專業(yè)：腫瘤學(xué)研究生姓名：彭濤導(dǎo)師姓名及職稱:李曙光教授研究起止日期：2012.9-2015.5提交日期：2015.5分類號(hào)：密級(jí)：?jiǎn)挝淮a：10092學(xué)號(hào)：20121277胃癌組織的DNA甲基化和基因表達(dá)研究單位：河北北方學(xué)院專業(yè)：腫瘤學(xué)研究生姓名：彭濤導(dǎo)師姓名及職稱：李曙光教授研究起止日期：2012.9-2015.5提交日期:2015.5河北北方學(xué)院學(xué)位論文使用授權(quán)及知識(shí)產(chǎn)權(quán)歸屬承諾本學(xué)位論文在導(dǎo)師（或指導(dǎo)小組）的指導(dǎo)下，由
2、本人獨(dú)立完成。本學(xué)位論文研究所獲的研究成果，其知識(shí)產(chǎn)權(quán)歸河北北方學(xué)院所有。河北北方學(xué)院有權(quán)對(duì)本學(xué)位論文進(jìn)行交流、公開和使用。導(dǎo)師簽名：研究生簽名：研究生簽名：2015年05月30日河北北方學(xué)院研究生學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本論文是在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝等內(nèi)容外，文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫的研究成果，指導(dǎo)教師對(duì)此進(jìn)行了審定。本論文由本人獨(dú)立撰寫，文責(zé)自負(fù)。導(dǎo)師簽名：研究生簽名：2015年05月30日目錄目錄中文摘要…………………………………………………………………1英文摘要…………………………………………………………………3英文縮寫……………………
3、……………………………………………5研究論文胃癌組織的DNA甲基化和基因表達(dá)研究前言…………………………………………………………………6材料與方法…………………………………………………………8結(jié)果………………………………………………………………14附圖………………………………………………………………18附表………………………………………………………………22討論………………………………………………………………37結(jié)論………………………………………………………………41參考文獻(xiàn)……………………………………………………………42綜述DNA甲基化在胃癌的研究進(jìn)展………………………………47致謝……
4、………………………………………………………………56個(gè)人簡(jiǎn)歷…………………………………………………………………57I中文摘要胃癌組織的DNA甲基化和基因表達(dá)研究摘要鑒于目前胃癌DNA甲基化的研究多集中于單個(gè)或幾個(gè)基因，且DNA甲基化在胃癌發(fā)生、發(fā)展和浸潤(rùn)轉(zhuǎn)移過程中的作用尚不明確。因此，運(yùn)用高通量甲基化芯片明確DNA甲基化和其表達(dá)與胃癌組織學(xué)類型、腫瘤的部位、浸潤(rùn)深度、淋巴結(jié)和腹膜轉(zhuǎn)移及預(yù)后的關(guān)系，具有重要意義。通過GO分類注釋以及KEGGPATHYWAY注釋分析后，能為建立胃癌DNA甲基化譜，探索胃癌發(fā)生、發(fā)展的表觀遺傳性機(jī)制，并擬建立胃癌分子分期及判斷預(yù)后的分子標(biāo)記物群，并針對(duì)靶分子設(shè)計(jì)干
5、預(yù)措施，為胃癌的治療開辟新的路徑。本課題應(yīng)用DNA甲基化芯片檢測(cè)胃癌及其癌旁正常組織基因組甲基化情況，并利用軟件對(duì)篩選基因進(jìn)行功能分析，探討胃癌的發(fā)生發(fā)展及預(yù)后的分子機(jī)制。實(shí)驗(yàn)方法：采用甲基化DNA免疫沉淀方法(MethylatedDNAimmunoprecipitation,MeDIP)結(jié)合NibleGen公司DNA甲基化芯片對(duì)胃癌及其癌旁組織進(jìn)行甲基化基因篩選，通過分析軟件對(duì)基因進(jìn)行GO(GeneOntology)和KEGG（KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes）pathway注釋分析。結(jié)果顯示：1.甲基化差異基因：（1）基因啟動(dòng)子區(qū)：存在于胃癌組織中的甲
6、基化差異基因?yàn)?13個(gè)，如SHP1、FGF8、CSF2RA；胃癌組織中以1號(hào)和4號(hào)染色體甲基化差異基因最多，均為11個(gè)。18號(hào)和20號(hào)染色體甲基化差異基因最少，均為1個(gè)；存在于配對(duì)癌旁正常組織甲基化差異基因?yàn)?61個(gè)，如：TNF、IGF2、BMP7。配對(duì)癌旁正常組織中以11號(hào)染色體甲基化差異基因最多，為17個(gè)；其次，以9號(hào)、19號(hào)和20號(hào)染色體甲基化差異基因較多，均為11個(gè)，Y染色體甲基化差異基因最少，為0個(gè)。（2）CpG島：存在于胃癌組織中的甲基化差異基因?yàn)?23個(gè)。如：WNT2B、JAK2、TPT1；存在于癌旁組織甲基化差異基因?yàn)?39個(gè)，如：TNFRSF4、HOXC8、NFYA。2.甲
7、基化差異基因的功能分類：（1）GO分析軟件將功能相同的基因進(jìn)行1中文摘要了分類，組成了不同的基因群：①蛋白磷酸化相關(guān)基因；②調(diào)節(jié)細(xì)胞分解代謝相關(guān)基因；③離子轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因；④酶活性調(diào)節(jié)相關(guān)基因；⑤轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)基因；⑥代謝相關(guān)基因；⑦細(xì)胞分裂相關(guān)基因；⑧細(xì)胞周期調(diào)節(jié)相關(guān)基因；⑨信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)基因等。（2）通路分析顯示DNA甲基化差異基因主要參與了腫瘤的發(fā)生、凋亡、機(jī)體免疫、氨基酸代謝等，例如：癌癥通路、JAK-ST
