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《皮膚擴張早期mirna和mrna的變化及關(guān)鍵mirna篩選》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文皮膚擴張早期miRNA和mRNA的變化及關(guān)鍵miRNA篩選miRNAandmRNAExpressioninEarlyStageofSkinExpansionandKeymiRNAScreening碩士生：劉文輝學(xué)號：1127239447導(dǎo)師：李青峰教授專業(yè)：外科學(xué)（整復(fù)外科）研究方向：創(chuàng)傷修復(fù)與體表器官再造項目基金：國家自然科學(xué)基金（No.81230042）申請學(xué)位級別：碩士培養(yǎng)單位：上海交通大學(xué)附屬第九人民醫(yī)院答辯日期2015年4月上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文皮膚擴張早期miRNA和mRNA的變化及關(guān)鍵miRNA篩選摘要目的建立皮膚擴張模型
2、，探究皮膚擴張早期中miRNA和mRNA表達(dá)譜的變化情況。方法取6-8周SD大鼠建立擴張模型，在擴張早期取下擴張皮膚，并利用未擴張皮膚作為對照，采用AffymetrixmicroRNA3.0平臺和AffymetrixGeneChipRatGene1.0ST檢測擴張早期miRNA和mRNA的表達(dá)變化；利用統(tǒng)計學(xué)方法初步篩選出表達(dá)發(fā)生變化的miRNA和mRNA，并根據(jù)差異表達(dá)的倍數(shù)篩選出表達(dá)差異較大的關(guān)鍵miRNA。采用TargetScan、miRDB和IPA數(shù)據(jù)庫對關(guān)鍵miRNA進行靶點預(yù)測；利用miRNA與靶點mRNA數(shù)量變化呈負(fù)相關(guān)的關(guān)系初步明確擴張早期miRNA可能調(diào)控
3、的mRNA靶點，建立miRNA-靶mRNA的一一對應(yīng)關(guān)系。對靶點mRNA進行功能分析和通路分析，明確擴張早期關(guān)鍵miRNA-靶mRNA-通路的對應(yīng)關(guān)系。結(jié)果篩選出了11個滿足統(tǒng)計學(xué)差異和表達(dá)倍數(shù)變化的miRNA，明確了miRNA-靶mRNA之間的相互作用關(guān)系；這些miRNA調(diào)控的靶點參與TGF-βSignaling、ApoptosisSignaling和PDGFSignaling等通路。結(jié)論本研究篩選出了11個皮膚擴張早期的關(guān)鍵miRNA，調(diào)控擴張過程中的關(guān)鍵通路，這些miRNA可作為調(diào)控皮膚早期擴張的靶點。關(guān)鍵詞皮膚擴張miRNAmRNA通路分析上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位
4、論文miRNAandmRNAExpressioninEarlyStageofSkinExpansionandKeymiRNAScreeningAbstractObjectiveToestablishearlystagemodelofskinexpansion;todeterminethemiRNAandmRNAexpressioninearlystageofskinexpansion.Methodearlyskinexpansionmodelwasestablishedusing6-8weeksSDrat.Expandedskinsamplesweretakeninthee
5、arlystageandunexpandedskinwasusedascontrol.AffymetrixmicroRNA3.0andAffymetrixGeneChipRatGene1.0STwereundertakentorevealthemiRNAandmRNAexpressionchangeduringearlyexpansionstage.StatisticanalysiswasappliedtofiltratedifferentiallyexpressedmiRNAandmRNA,foldchangeofmiRNAswasalsocalculatedtodete
6、rminekeymiRNAs.TargetScan,miRDBandIPAwereappliedtopredicttargetsofthesekeymiRNAs.NegativecorrelationbetweenmiRNAandmRNAwasusedtodeterminetherealtargetofkeymiRNAsintheearlystageofexpansion.Result11keymiRNAwasdetectedandcorrespondingrelationbetweenmiRNAsandtheirtargetswasalsodetermined.These
7、keymiRNAsregulatepathwayslikeTGF-βSignaling、ApoptosisSignalingandPDGFSignaling.ConclusionPresentstudydetermined11keymiRNAsintheearlystageofskinexpansionandtheyregulatepathwaysplayanimportantroleinskinexpansion.ThesekeymiRNAscouldserveastargetstoimproveexpansio
