豬流行性腹瀉病毒(pedv)流行株的序列分析和抗原表位表達

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1、學(xué)校代碼:學(xué)號:分類號:密級:’總碩士學(xué)位論文題豬流行性腹擔(dān)病流行■序列分析和抗原表愈直怒程小鄉(xiāng)指導(dǎo)教師時間二〇一五年五月Thesequencesanalysisandepitopeexpressionofporcineepidemicdiarrheavirus(PEDV)epidemicstrainsAThesisSubmittedinPartialFulfillmentoftheRequirementFortheMasterDegreeinAgonomyByChengXiao-naSupervisor:YangYu-huiMa

2、jor:WildlifeConservationandUtilizationSubmitedtime:May,2015海南大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明和使用授權(quán)說明原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文,是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下,獨立進行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外,本論文不含任何其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品或成果對本文的研究做出重要貢獻的個人和氣體,均已在文中以明確方式標(biāo)明。本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)《論文作者簽名:曰期年‘月曰學(xué)位論文艇權(quán)使用授權(quán)說明本人完全了解海南大學(xué)關(guān)于收集、保存、使用學(xué)位論文的規(guī)定,即

3、:學(xué)校有杈保留并向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版’允許論文被查闔和借閱。學(xué)校可以為存在館際合作關(guān)系兄弟高校用戶提供文獻傳遞脤務(wù)和務(wù)。本人授權(quán)海南大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密論文在解密后遵守此規(guī)定。論文作者簽名導(dǎo)師簽名日期曰期:月日本人已經(jīng)認(rèn)真閱讀:“高校學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫發(fā)布章程”,同意將本人的學(xué)位論文提交高校學(xué)位論文:全文據(jù)庫”中全文發(fā)布’并可按《章程”中規(guī)定享受相關(guān)權(quán)益。同意論文提交后滯后:口半年二年:口二年發(fā)布,論文作者簽

4、名:導(dǎo)師簽名:曰期:月曰日期:年《月曰摘要豬流行性腹瀉(是以水樣腹瀉、脫水和嘔吐為臨床癥狀的一種高接觸性急性腸道傳染病,病原為豬流行性腹瀉病毒(。豬流行性腹瀉病毒和傳染性胃腸炎病毒(同屬冠狀病毒科冠狀病毒屬(的成員??梢哉T使各種年齡段的豬發(fā)病,其中受它侵害最嚴(yán)重的是哺乳仔豬,可造成乳豬高達的發(fā)病率和死亡率。自年在我國暴發(fā)以來,該病已然成為世界流行性的疾病,是造成我國各地養(yǎng)殖場仔豬死亡的主要疫病之一,嚴(yán)重地危害養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展和養(yǎng)殖戶的經(jīng)濟利益。因此,每年對的流行病學(xué)監(jiān)測和免疫預(yù)防是一項必不可少的任務(wù),特別是通過分子生物學(xué)手段對的分子流

5、行病學(xué)特征進行監(jiān)測,可使我們了解毒株的來源和變異程度及毒株之間的親緣關(guān)系,從而為該病的防控提供理論依據(jù)。針對于此,本論文進行了如下內(nèi)容的研究:利用和分子克隆等分子生物學(xué)技術(shù)對地方流行毒株—進行了全基因測序,并使用和軟件將該序列與來自我國、美國、韓國、加拿大等國的株參考毒株進行比較分析,確定了各個毒株之間的親緣關(guān)系,并繪制了系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明:該毒株長與疫苗株、、的同源性分別為、、發(fā)育樹分為個進化分支,即和型。主要為疫苗株,包含大多數(shù)流行毒株,包括中國年不同省份旳毒株以及美國、韓國、加拿大等國的流行毒株,這說明群是全球目前主要的優(yōu)

6、勢流行毒株。從單個基因的發(fā)育樹分析可知,相較于易于變異的基因,—基因、五基因、因、因的序列較為保守。對年來自個省市地區(qū)的株地方流行毒株的基因,進行了克隆測序,并使用生物軟件將這些序列與來自我國、美國、韓國、日本等國的株參考毒株進行比較分析,確定了各個毒株之間的親緣關(guān)系,并繪制了系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明:株流行株與株參考毒株基因的發(fā)育樹分為個進化分支,即和型。主要為疫苗株,包含大多數(shù)流行毒株,是全球目前主要的優(yōu)勢流行毒株,其中國內(nèi)流行毒株缺乏地區(qū)性。為了在基因上篩選出反應(yīng)原性較好的片段,利用生物學(xué)軟件對基因進行了抗原位點分析,將基因中三

7、段不同抗原位點通過融合技術(shù)連接在一起進行原核表達,然后進行檢測。結(jié)果表明,最后獲得的融合蛋白具有免疫活性,說明所選的三個片段中存在具有免疫原性的片段,至于幾個片段具有抗原性,還需進一步實驗驗證。關(guān)鍵詞:豬流行性腹瀉病毒;分子流行病學(xué)調(diào)查;全基因;基因;原核表達AbstractPorcineepidemicdiarrhea(PED)isanacuteinfectiousdiseasewithseverediarrhea,vomitinganddehydrationclinicalfeaturescausedbyporcineepid

8、emicdiarrheavirus(PEDV).Porcineepidemicdiarrheavirusand(TGEV)belongtothecoronavirusfamilyofthegenusCoronavirus.Pigsofvarious

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