道地藥材浙玄參的隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA研究

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1、道地藥材浙玄參的隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA研究作者:朱振洪,萬海同,余勤,劉文洪,韓進(jìn)【摘要】目的探討道地藥材浙玄參與非道地藥材之間遺傳變異大小,并建立道地藥材浙玄參的品質(zhì)鑒定方法。方法運(yùn)用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RAPD)法對產(chǎn)于浙江、山東、湖北的玄參科植物玄參進(jìn)行了分子標(biāo)記研究。結(jié)果共篩選出9條有效引物,獲得142條DNA帶,通過聚類分析,構(gòu)建DNA分子系統(tǒng)樹圖,確定不同居群間的親緣關(guān)系。結(jié)論同種異地藥材所形成的不同居群,具有不同的遺傳多樣性特征。其中浙玄參與山東、湖北玄參存在較大遺傳差異,說明浙玄參作為道地藥材,具有自身獨(dú)特的遺傳特征。【關(guān)鍵

2、詞】道地藥材;玄參;隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA;聚類分析 玄參別名元參、黑參、浙玄參,為玄參科植物玄參ScrophulariuningpoensisHemsl.的干燥根,具有滋陰降火、解毒之功效。主產(chǎn)于浙江,另外在山東、湖北、四川、陜西等也有栽培。其中以浙江產(chǎn)玄參為道地藥材,為著名的“浙八味”之一。由于該藥材品種多、產(chǎn)區(qū)廣,單純地依賴形態(tài)分類、組織學(xué)或化學(xué)指紋如高效液相色譜(HPLC)、氣相色譜(GC)等難以區(qū)別[1]?,F(xiàn)代分子生物學(xué)研究表明,中藥材生物資源的多樣性是由于其基因多態(tài)性導(dǎo)致的[2]。為從基因角度揭示“道地”7藥材的生物學(xué)本質(zhì),本文采

3、用RAPD技術(shù)分別對來源于浙江、山東、湖北產(chǎn)地的玄參進(jìn)行遺傳多樣性研究,旨在為道地藥材浙玄參的藥材鑒定、栽培繁育、質(zhì)量評價(jià)提供依據(jù)?! ?材料與儀器  1.1供試植物材料分別采于浙江臨安、湖北恩施、山東青州等地。取新鮮健壯嫩葉置液氮罐中,帶回實(shí)驗(yàn)室-70℃冰箱中保存。  1.2DNA提取試劑提取緩沖液:100mmol/LTris-HCl(pH8.0),50mmol/LEDTA(pH8.0),500mmol/LNaCl,10mmol/Lβ-巰基乙醇。20%SDS,5mol/LKAc,10mg/mlRNaseA,異丙醇,滅菌水等?! ?.3PC

4、R試劑10核苷酸隨機(jī)引物由上海生工生物工程公司合成,共70條(序列編號分別為:S1~S40,S71~S90,S111~S120);DNA聚合酶、Buffer等為MBI公司產(chǎn)品。  1.4儀器SIGMA3K-15高速冷凍離心機(jī),PCR儀(Biometrapersonal,Germany),瓊脂糖電泳儀和凝膠成像系統(tǒng)為上海天能科技有限公司產(chǎn)品。  2方法7  2.1基因組DNA提取方法采用改良SDS法提取基因組[3],具體操作如下:取1g葉片,剪碎后加入適量PVP,一起于液氮中研磨成粉。轉(zhuǎn)移粉末到加有500μl提取緩沖液的離心管中,輕輕混勻,使

5、粉末充分散開。加入50μl20%SDS溶液,混勻后于65℃水浴中保溫10~15min(間斷晃動(dòng)2~3次)。加入150μl5mol/LKAc,混勻,置冰上20~30min。4℃12000r/min離心15min。上清液轉(zhuǎn)入新離心管中,加入等體積的氯仿-異戊醇,輕輕顛倒混勻。4℃12000r/min離心15min,上清液轉(zhuǎn)入另一離心管中,加入2/3體積預(yù)冷的異丙醇,-20℃放置30min。4℃12000r/min離心15min,棄上清液,沉淀自然晾干后加入50μlTE緩沖液溶解,并加入10mg/mlRNA酶1μl,于37℃保溫1h。電泳檢測基因

6、組的完整性。  2.2引物篩選及PCR方法[4]首先進(jìn)行隨機(jī)引物的篩選,10核苷酸隨機(jī)引物購自上海生工(編號分別為:S1~S40,S71~S90,S111~S120),PCR反應(yīng)體為:10×PCRbuffer2.5μl,25mmol/LMgCl23μl,2.5mmol/L4dNTP1.5μl,引物(0.5μmol/L)1μl,模板DNA(100ng)1μl,Taq聚合酶(5U/μl)0.5μl,補(bǔ)加雙蒸水至25μl。PCR儀的反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性3min,94℃變性45s,36℃退火45s,72℃延伸1min,共44個(gè)循環(huán),72℃保溫7

7、min。PCR結(jié)束后用1.2%的Agrose進(jìn)行電泳分析結(jié)果?! ?.3RAPD數(shù)據(jù)分析[5]按瓊脂糖凝膠同一位置上DNA7帶的有無進(jìn)行統(tǒng)計(jì),有帶(包括弱帶)記為“1”,無帶記為“0”。利用NTSYS(2.10e)軟件對RAPD電泳結(jié)果進(jìn)行聚類分析。計(jì)算出各物種之間的遺傳距離,并構(gòu)建DNA分子系統(tǒng)樹。  3結(jié)果  3.1改良SDS法提取植物基因組DNA植物基因組抽提方法常用的有CTAB法和SDS法,植物中的主要矛盾是粉碎破壁困難和糖類的影響,所以一般采用陽性表面活性劑的方法。最常用的就是CTAB和SDS。但CTAB的表面活性比SDS差,所以

8、本實(shí)驗(yàn)采用改良SDS法,其基本原理是研磨的組織細(xì)胞用熱的SDS裂解后,加入高濃度的KAc,0℃放置以除去蛋白和多糖類雜質(zhì),最后用異丙醇沉淀。用瓊脂糖凝膠電泳(0.8%)檢測,發(fā)現(xiàn)

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