沉香隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性dna反應(yīng)體系的建立

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1、沉香隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA反應(yīng)體系的建立:邵敏周鶴峰唐歷波劉銀花李官成【摘要】  目的對(duì)影響沉香隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RAPD)反應(yīng)的各因素進(jìn)行優(yōu)化,建立適用于沉香RAPD的最佳反應(yīng)體系。方法采用改良的CTAB法提取基因組DNA,變化單一因素的方法對(duì)模板DNA濃度、Taq酶用量、dNTPs、引物濃度、Mg2+濃度、退火溫度對(duì)RAPD影響進(jìn)行分析。結(jié)果建立了適合沉香RAPD分析的最佳反應(yīng)體系:在20μl反應(yīng)體系中,模板DNA用量20ng、Taq酶1.0U、dNTPs濃度為0.3~0.4mmol·L-1、隨機(jī)引物濃度為0.6μmol·L-1、Mg2+濃度1.5~2

2、.0mmol·L-1。PCR反應(yīng)條件:94℃,10min;94℃,1min;36℃,1min;72℃,2min;45個(gè)循環(huán),72℃,8min。結(jié)論該反應(yīng)體系具有良好的穩(wěn)定性和重復(fù)性。【關(guān)鍵詞】沉香;RAPD;基因組DNA;反應(yīng)體系  Abstract:ObjectiveToestablishtheoptimumRAPDreactionsystemofAquilariaagallochaRoxb.MethodsThegenomicDNAAquilariaagallochaRoxb.bymodifiedCTABmethod,andthedifferentTemp

3、lateDNA,Taq,dNTPs,Primer,Mg2+,theannealingtemperatureizedreactionsystemandprogramofRAPDforAquilariaagallochaRoxb.edinavolumeof20μl,erase,0.3~0.4mmol·L-1dNTPs,0.6μmol·L-1randomPrimer,1.5~2.0mmol·L-1Mg2+.Afterpre-denaturingat94℃for10min,undertheconditionofdenaturingat94℃for1min,annea

4、lingat36℃for1min,extensionat72℃for2min,amplifyingfor45cycles,finallyextensionat72℃for8min.ConclusionThereactionsystemisreproducibleandhighlystable.  KeyicDNA;Reactionsystem  沉香為瑞香科植物白木香Aquilariasinensis(Lour.)Gilg含有樹(shù)脂的木材[1],是一種熱帶亞熱帶常綠喬木。白木香是我國(guó)生產(chǎn)沉香藥材唯一的植物資源,主要分布于廣東省東南部、西南部、中部以南地區(qū)和海南

5、,屬國(guó)家二級(jí)保護(hù)野生植物。沉香是臨床常用的理氣藥,具行氣止痛、溫中止噯、納氣平喘功效,用于治療胸腹脹痛、胃寒嘔吐呃逆、腎虛氣逆喘急等癥。據(jù)統(tǒng)計(jì),建國(guó)至今有一千六百多個(gè)藥方使用沉香;另外,沉香樹(shù)是很好的園林綠化樹(shù)種,又是珍貴的天然香料。長(zhǎng)期以來(lái)由于森林資源、生態(tài)環(huán)境遭受災(zāi)害和人為破壞,天然沉香資源日趨枯竭。在現(xiàn)有的文獻(xiàn)資料中,對(duì)白木香的研究主要集中在組織培養(yǎng)和化學(xué)成分等方面,遺傳學(xué)方面的研究尚未見(jiàn)報(bào)道?! ‰S機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA技術(shù)(randomlyamplifiedpolymorphicDNA,RAPD)是1990年由gCl2、隨機(jī)引物、瓊脂糖、CTAB、ED

6、TA、巰基乙醇購(gòu)于上海生工生物技術(shù)有限公司;DNAMarker由大連寶生物公司提供。Hema-8000型PCR儀(珠海黑馬儀器廠)、島津UV-2550型紫外分光光度計(jì)(日本島津);DYC型電泳儀(北京六一儀器廠);5810R型冷凍高速離心機(jī)(eppendorf)?! ?.3DNA提取與檢測(cè)采用改良的CTAB法提取基因組DNA[3]。紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA樣品在230,260,280nm處吸光度;0.8%瓊脂糖凝膠電泳,檢測(cè)DNA片段大小和完整性,觀察并拍照?! ?.4PCR擴(kuò)增和RAPD反應(yīng)體系的優(yōu)化參考陳大霞等[3]的方法,擴(kuò)增反應(yīng)在Hema-8000型

7、PCR儀上進(jìn)行。在RAPD分析之前,為了確定沉香基因組DNA最佳擴(kuò)增條件,分別研究了模板DNA濃度、Taq酶用量、dNTPs、引物濃度、Mg2+濃度、退火溫度對(duì)RAPD反應(yīng)的影響,采用保持與其他因素一致的條件下,變化單一因素從而篩選最佳濃度,找出適合沉香RAPD反應(yīng)的最佳反應(yīng)條件。PCR擴(kuò)增基本體系為:在20μl反應(yīng)體系中,含模板DNA15ng、Taq酶1.0U、dNTPs0.3mmol·L-1、隨機(jī)引物0.2μmol·L-1、Mg2+1.5mmol·L-1。PCR反應(yīng)條件:94℃,10min;94℃,1min;36℃,1min;72℃,2min;45個(gè)循環(huán)

8、,72℃,8min。產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。  1.

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