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1、DNA順式作用元件制作人:李靜2012110205作物栽培學(xué)與耕作學(xué)內(nèi)容簡(jiǎn)介順式作用元件概述順式作用元件結(jié)構(gòu)順式作用元件與反式作用因子關(guān)系同一DNA分子中具有轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)功能的特異DNA序列。定義化學(xué)本質(zhì)存在于DNA分子中的較短的DNA序列順式作用元件概述順式作用元件在分子遺傳學(xué)領(lǐng)域,相對(duì)同一染色體或DNA分子而言為“順式”;對(duì)不同染色體或DNA分子而言為“反式”。順式作用元件結(jié)構(gòu)順式作用元件結(jié)構(gòu)(一)啟動(dòng)子啟動(dòng)子一般位于真核基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游200bp以內(nèi)。包括至少一個(gè)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)以及一個(gè)以上的機(jī)能組件。1.TATA盒TATA盒共有序列是TATAAAA,通常位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-25
2、~-30bp,決定轉(zhuǎn)錄的方向和精確的轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)。TATA盒是基本轉(zhuǎn)錄因子TFIID結(jié)合位點(diǎn)。2.起始子在一些真核基因的上游沒(méi)有典型的TATA盒,但在某些無(wú)TATA盒的基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)附近發(fā)現(xiàn)了起始子元件INR,一般將位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)下游的調(diào)控序列稱為下游起始子。3.上游啟動(dòng)子元件除TATA盒外,GC盒(GGGCGG)和CAAT盒(GCCAAT)也是很多基因常見的,它們通常位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-30~-110bp區(qū)域。順式作用元件結(jié)構(gòu)(二)調(diào)節(jié)元件一般位于基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-200bp以上區(qū)域的順式作用元件,包括增強(qiáng)子和沉寂子1.增強(qiáng)子起正調(diào)控作用的順式元件,位于真核基因中遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始
3、點(diǎn),能明顯增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄效率的順式作用元件,它對(duì)方向和定位無(wú)依賴性。一般具有組織特異性和細(xì)胞特異性。序列長(zhǎng)度一般在70~200bp之間,基本核心組件常為8~12bp,部分序列有回文結(jié)構(gòu)特征,可以單拷貝或多拷貝串聯(lián)形式存在。2.沉寂子和起正調(diào)控作用的增強(qiáng)子相對(duì)應(yīng)的是起負(fù)調(diào)控作用的沉寂子。它的功能不受定位和方向的限制。與相應(yīng)的反式作用因子結(jié)合后,可降低或封閉某些基因的表達(dá)。增強(qiáng)子和沉寂子協(xié)調(diào)可決定基因表達(dá)的時(shí)空順序3.轉(zhuǎn)座元件一些DNA序列在染色體上的座位可以在一系列的靶位點(diǎn)之間插入或移出,此系列稱為轉(zhuǎn)座元件。順式作用元件與反式作用因子關(guān)系反式作用因子:與順式作用元件結(jié)合的可擴(kuò)散性
4、蛋白,包括基礎(chǔ)因子,上游因子,誘導(dǎo)因子。真核生物的轉(zhuǎn)錄調(diào)控是調(diào)控的最重要的途經(jīng),大多是通過(guò)順式作用元件和反式作用因子復(fù)雜的相互作用而實(shí)現(xiàn)的。順式作用元件與反式作用因子關(guān)系1.順式作用元件本身不編碼任何蛋白質(zhì),僅僅提供一個(gè)作用位點(diǎn),只有與反式作用因子相互作用才起作用。2.反式作用因子通過(guò)不同的途經(jīng)發(fā)揮調(diào)控作用,它們與特異的靶基因的順式元件相結(jié)合起作用。反式作用因子一般具有兩大類結(jié)構(gòu)域:一類是識(shí)別和結(jié)合特異DNA順式作用元件所必需的,一類是調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄基因效率所必需的。兩類結(jié)構(gòu)域具有不同的特征,但同一類結(jié)構(gòu)域具有一些共同的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。反式作用因子結(jié)構(gòu)域類型1.螺旋-轉(zhuǎn)折-螺旋有2個(gè)螺旋,
5、螺旋2是識(shí)別和DNA結(jié)合,一般結(jié)合于大溝;螺旋1和其它蛋白質(zhì)結(jié)合。兩個(gè)螺旋由一個(gè)轉(zhuǎn)角鏈接2.鋅指鋅指這個(gè)名稱來(lái)源于它的結(jié)構(gòu),它由一小組保守的氨基酸和鋅離子結(jié)合,在蛋白質(zhì)中形成了相對(duì)獨(dú)立的功能域,像一根根手指伸向DNA的大溝。3、亮氨酸拉鏈兩個(gè)蛋白質(zhì)分子對(duì)應(yīng)的螺旋區(qū)之間的兩行亮氨酸通過(guò)疏水性相互作用形成1個(gè)類似拉鏈的結(jié)構(gòu),稱為亮氨酸拉鏈。對(duì)形成穩(wěn)定的蛋白二聚體十分重要。4、螺旋一環(huán)一螺旋有2個(gè)螺旋,螺旋中有些疏水氨基酸,分布在螺旋一側(cè)。螺旋間被長(zhǎng)短不同的肽斷分隔而形成的結(jié)構(gòu)。反式作用因子結(jié)構(gòu)域類型反式作用因子結(jié)構(gòu)域類型反式作用因子通過(guò)不同的結(jié)構(gòu)域與不同DNA順式作用元件互作用來(lái)實(shí)
6、現(xiàn)真核基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制。反式作用因子結(jié)構(gòu)域類型反式作用因子通過(guò)不同的結(jié)構(gòu)域類型與不同DNA順式作用元件相互作用,來(lái)實(shí)現(xiàn)真核基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制。謝謝!