dna順式作用元

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1、DNA順式作用元件制作人:李靜2012110205作物栽培學與耕作學內(nèi)容簡介順式作用元件概述順式作用元件結構順式作用元件與反式作用因子關系同一DNA分子中具有轉錄調(diào)節(jié)功能的特異DNA序列。定義化學本質存在于DNA分子中的較短的DNA序列順式作用元件概述順式作用元件在分子遺傳學領域,相對同一染色體或DNA分子而言為“順式”;對不同染色體或DNA分子而言為“反式”。順式作用元件結構順式作用元件結構(一)啟動子啟動子一般位于真核基因轉錄起始點上游200bp以內(nèi)。包括至少一個轉錄起始點以及一個以上的機能組件。1.TATA盒TATA盒共有序列是TATAAAA,通常位

2、于轉錄起始點上游-25~-30bp,決定轉錄的方向和精確的轉錄起始點。TATA盒是基本轉錄因子TFIID結合位點。2.起始子在一些真核基因的上游沒有典型的TATA盒,但在某些無TATA盒的基因轉錄起始點附近發(fā)現(xiàn)了起始子元件INR,一般將位于轉錄起始點下游的調(diào)控序列稱為下游起始子。3.上游啟動子元件除TATA盒外,GC盒(GGGCGG)和CAAT盒(GCCAAT)也是很多基因常見的,它們通常位于轉錄起始點上游-30~-110bp區(qū)域。順式作用元件結構(二)調(diào)節(jié)元件一般位于基因轉錄起始點上游-200bp以上區(qū)域的順式作用元件,包括增強子和沉寂子1.增強子起正調(diào)

3、控作用的順式元件,位于真核基因中遠離轉錄起始點,能明顯增強啟動子轉錄效率的順式作用元件,它對方向和定位無依賴性。一般具有組織特異性和細胞特異性。序列長度一般在70~200bp之間,基本核心組件常為8~12bp,部分序列有回文結構特征,可以單拷貝或多拷貝串聯(lián)形式存在。2.沉寂子和起正調(diào)控作用的增強子相對應的是起負調(diào)控作用的沉寂子。它的功能不受定位和方向的限制。與相應的反式作用因子結合后,可降低或封閉某些基因的表達。增強子和沉寂子協(xié)調(diào)可決定基因表達的時空順序3.轉座元件一些DNA序列在染色體上的座位可以在一系列的靶位點之間插入或移出,此系列稱為轉座元件。順式作

4、用元件與反式作用因子關系反式作用因子:與順式作用元件結合的可擴散性蛋白,包括基礎因子,上游因子,誘導因子。真核生物的轉錄調(diào)控是調(diào)控的最重要的途經(jīng),大多是通過順式作用元件和反式作用因子復雜的相互作用而實現(xiàn)的。順式作用元件與反式作用因子關系1.順式作用元件本身不編碼任何蛋白質,僅僅提供一個作用位點,只有與反式作用因子相互作用才起作用。2.反式作用因子通過不同的途經(jīng)發(fā)揮調(diào)控作用,它們與特異的靶基因的順式元件相結合起作用。反式作用因子一般具有兩大類結構域:一類是識別和結合特異DNA順式作用元件所必需的,一類是調(diào)節(jié)轉錄基因效率所必需的。兩類結構域具有不同的特征,但同

5、一類結構域具有一些共同的結構特點。反式作用因子結構域類型1.螺旋-轉折-螺旋有2個螺旋,螺旋2是識別和DNA結合,一般結合于大溝;螺旋1和其它蛋白質結合。兩個螺旋由一個轉角鏈接2.鋅指鋅指這個名稱來源于它的結構,它由一小組保守的氨基酸和鋅離子結合,在蛋白質中形成了相對獨立的功能域,像一根根手指伸向DNA的大溝。3、亮氨酸拉鏈兩個蛋白質分子對應的螺旋區(qū)之間的兩行亮氨酸通過疏水性相互作用形成1個類似拉鏈的結構,稱為亮氨酸拉鏈。對形成穩(wěn)定的蛋白二聚體十分重要。4、螺旋一環(huán)一螺旋有2個螺旋,螺旋中有些疏水氨基酸,分布在螺旋一側。螺旋間被長短不同的肽斷分隔而形成的結

6、構。反式作用因子結構域類型反式作用因子結構域類型反式作用因子通過不同的結構域與不同DNA順式作用元件互作用來實現(xiàn)真核基因的轉錄調(diào)控機制。反式作用因子結構域類型反式作用因子通過不同的結構域類型與不同DNA順式作用元件相互作用,來實現(xiàn)真核基因的轉錄調(diào)控機制。謝謝!

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