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《小麥抗條銹病基因Yr5分子標記的鑒定》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關內容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、東北農業(yè)大學碩士學位論文小麥抗條銹病基因Yr5分子標記的鑒定姓名:陳曉紅申請學位級別:碩士專業(yè):植物學指導教師:胡寶忠;牛永春2003.6.1摘要小麥條銹病是一種世界性病害,嚴重威脅著小麥生產。在抗病育種中應用分子標記輔助選擇有利于實現(xiàn)抗條銹病多基因積累,加速持久抗病品種的培育進程。以小麥抗條銹病基因Yr5的供體親本Triticumspdtaalbum作為對照,對近等基因系YrS/6xAvocetS和感病親本AvocetS進行RAPD分析。擴增產物用4%變性PAGE分離,銀染顯色??梢詸z測到50~100條帶,是瓊脂糖凝膠電泳的5倍以上。本研究篩選了
2、240個隨機引物,發(fā)現(xiàn)23條穩(wěn)定的多態(tài)性DNA片段。可見,該方法顯著提高了小麥RAPD分析的多態(tài)性水平。而且,由于PAGE能夠穩(wěn)定檢出低拷貝的擴增片段,也改善了RAPD分析的重復性。/對23條多態(tài)性DNA片段與Yr5基因的遺傳連鎖性進行初步檢測,確定了分別由5條引物擴增的S13202∞、S1348363、S1476Ⅲ、S1476∞l、S1397830、S1380359共6條多態(tài)性片段與Yr5基因有連鎖性。將其中連鎖性好的多態(tài)性片段S1320207、S1348363、S1476401進行克隆、測序,并根據(jù)序列設計特異性引物。用121株AvocetS和
3、Yr5/6×AvocetS雜交制備的F2代分離群體進一步進行遺傳連鎖性檢測。特異擴增產物SC-S1320l"與7r5基因完全連鎖;標記SC.S13483劈與Yr5基因緊密連鎖(交換率0.008),表明已經成功轉化為TrS基因的SCAR標記。y對小麥抗條銹病基因Yr5的近等基因系材料,提取接種后1211、24h、48h葉片的總RNA,制備三個時間段的eDNA模板。根據(jù)已克隆R基因普遍具有的NBS結構域的P-loop、Kinase-2a、Kinase.3a、EGF區(qū)設計5條RGA簡并引物,組成5對引物組合。用相同的模板與引物,在低嚴謹條件下擴增,獲得4
4、條多態(tài)性片段;在高嚴謹條件下擴增,發(fā)現(xiàn)l條多態(tài)性片段D-4。將引物組合Nl-E1擴增抗病和感病材料的產物分別回收作為模板,用引物組合K2
5、.El和Touchdown程序再擴增,檢測到1條550bp左右差異DNA帶,記為RD-1;將引物組合K2,-E擴增抗病和感病材料的產物分別回收作為模板,用引物組合KhS-El和Touchdown程序再擴增,檢測到l條470bp左右差異DNA帶,記為RD-2。用巢式PCR兩次擴增目的DNA片段,提高了特異性。更有利于目的DNA片段檢出。關鍵詞小主濼諺猜;抗病塞囪;M:分子滌毛V,l—————————2鎏型生塑塑生堂
6、警圣———————一IdentificationofRAPDMarkersLinkedtotheResistanceGeneYr5againstWheatStripeRustAbstractStriperust(yellowrust)。causedbyPucciniastriiformisWest.£sp.tritici,isoneofthemostimportantdiseasesonwheatthroughouttheworld.Itisaneffectivewaytobreedresistantcultivarsconferringmajor
7、resistancegenebymaker-assistedselection,whichwouldacceleratebreedingprogram.RAPDanalysisWaSperformedbetweenanear-isogenicline(NIL)Yr5/6×AvocetScarryingtheresistancegeneYr5againstwheatstriperustanditssusceptibleparentAvocetS,usingtheYr5genadonorparentTriticumspeltaalbumascontr0
8、1.AmplifiedDNAfragmentswereseparatedwith4%denaturingPAGE(polyacrylamidegelelectrophoresis)anddisplayedbysilverstaining.Fiftyto100bandsweredetected,5foldsmorethanthatrevealedonagsrosegels.Atotalof240randomprimerswerescreened,and23reproduciblepolymorphicDNAfragmentswerefound。The
9、resultssuggestedthatusingdenaturingPAGE-silverstainingcouldre