利用SSR標記技術(shù)對白樺長纖維性狀的研究

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時間:2019-05-15

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1、摘要白樺(BerulaplaO,phyUa)為我國東北與內(nèi)蒙古林區(qū)的先鋒樹種,是非常優(yōu)良的短周期闊葉紙漿用材樹種。纖維長度是影響紙張品質(zhì)的主要因素之一,為了加速長纖維白樺紙漿材新品種選育進程,本文進行了以下研究:1、通過測定和分析帽兒山實驗林場583株白樺和哈爾濱林場200株白樺纖維長度的分布特點,不僅說明纖維長度性狀是典型數(shù)量性狀、適合采用分子標記技術(shù)進行研究,而且分別從中選擇出能代表這2個群體的100株個體組成分析群體用于長纖維性狀分子標記分析、40株驗證群體用于長纖維標記的驗證。2、通過正交設(shè)計方法確定了SSR反應(yīng)體系,并對結(jié)果進行了驗證。在正交設(shè)計的基礎(chǔ)上,得出了白樺SSR最佳反應(yīng)體系

2、。20/zL反應(yīng)體系包括:DNAl00ng,Mg+23mmol/L,Taq酶0.5U,dNTP0.5mmol/L,引物濃度為0.49mol/L;循環(huán)參數(shù)為:94℃預(yù)變性5min后,進行35個循環(huán)94℃變性30s,59.5℃復(fù)性30s,72℃延伸30s;72℃延伸5min,4。C保存。3、利用生物信息學(xué)方法,分析了NCBI數(shù)據(jù)庫的2548條歐洲白樺(Betulapendula)EST序列,結(jié)果表明:其中共有260條EST序列含有307個SSR,占全部EST的10.20%,SSR的出現(xiàn)頻率是12.05%。利用SSRPrimer和Primer3軟件對發(fā)現(xiàn)的260個含有SSR序列的EST序列進行東北白

3、樺SSR引物設(shè)計,結(jié)果表明:在Primer3設(shè)計出的176對引物,共有104對引物產(chǎn)生擴增現(xiàn)象,占合成引物的59.09%,其中27對引物具有多態(tài)性,僅占25.96%;在SSRPrimer設(shè)計的100對引物,有37對引物產(chǎn)生了擴增產(chǎn)物,占合成引物的37.00%,其中只有18對引物的擴增具有多態(tài)性。4、通過纖維長度與SSR標記的多元回歸分析,得到了4條與白樺纖維長度呈顯著相關(guān)SSR片段擴增條帶。利用與這4條片段對應(yīng)的SSR引物對驗證群體進行擴增結(jié)果表明,4對長纖維性狀SSR引物對長纖維白樺的鑒定率平均為60.00%,對短纖維鑒定率為7.00%,其中PBl5引物對長纖維性狀個體的鑒定率高達75.00

4、%。關(guān)鍵詞白樺,SSR,EST-SSR,纖維性狀A(yù)bstractTheBetulaplatyphyllaispioneerandexcellentshortcyclebroad-leavedpulptreeinnortheastandinner-Mongofiaregion.Becausethefiberlengthisthemainfactorforpaperqnality,thehereinafterstudyWasdoneinthispapertoacceleratetheprogressofnewvarietyforlongfiberpulpB.platyphylla.Aftermea

5、surementandanalysisfiberlengthtrait㈣anddistributingtraitof538individualsfromnatureB.platyphyllapopulationinmaoershanexperimentforestrycentreand200individualsfromnatureB.pkty}I的lkpopulationinharerbinexperimentforestrycentre,theFLTisthemodelquantitytraitsuittostudyusingmarkeranalysis,moreoverthe100ind

6、ividualsfrommaoershanand40fromharerbinwereselectedtobeanalyzedbymoleen]emarker.TheorthogonaldesignWasusedtooptimizeSSR-PCRamplificationsystem011B.platyphylla.AmostsuitableSSR-PCRsystemforB.platyphyllaWasestablished,itWas20/MLreactionsystemwhichcontained150rigDNAtemplate,3mmol/LMg“,0.5UTaqDNApolymere

7、se,0.5mmol/LdNTP,0.4/“mol/LPrimer,SSR-PCRreactionsystemofbirchwasperformed.InitialdenaturationWasfor5minat94"C,followby35cyclesofdenaturationfor30Sat94℃,annealingfor30Sat59.5"C,extensionfor30Sat72"Can

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