不同品系金魚和鯽魚的線粒體分子標記及其系統(tǒng)發(fā)育分析

不同品系金魚和鯽魚的線粒體分子標記及其系統(tǒng)發(fā)育分析

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1、摘要我國的魚類實驗動物開發(fā)利用研究工作比較滯后,標準化的魚類實驗動物至今仍是空白。以中國為原產(chǎn)地的金魚(國朋船j船a姍芒船№)可以作為一種魚類實驗動物進行研究與開發(fā)。關于金魚的解剖性狀、蛋白質(zhì)、同工酶和基因組DNA的隨機多態(tài)擴增(RAPD)已有一些研究報道,但是,把金魚作為實驗動物,其系統(tǒng)進化關系和分子遺傳背景尚有一些爭議,很有必要進行深入的研究。線粒體DNA具有自身獨特的遺傳系統(tǒng),是理想的物種鑒定的遺傳標記物之一。作為分子標記己被廣泛應用于各物種系統(tǒng)發(fā)生的研究。本文通過研究不同品系的金魚和鯽魚的線粒體DNA控制區(qū)及其一側(cè)tRNA基因部分核苷酸序列及Cytb序列的對比,為金魚的系統(tǒng)進化關

2、系和遺傳背景研究提供分子生物學證據(jù)。本研究的主要研究內(nèi)容如下:1、對金魚的代表品種紅龍睛、紅帽子、虎頭、琉金、墨龍睛、水泡眼及彭澤鯽的線粒體DNA控制區(qū)及tRNA—Thr和tRNA—Phe基因進行了測序,將所得序列同GenBank中日本白鯽、紅鯽、鯉魚的序列進行比較分析。分析結(jié)果說明tRNA—Thr、tRNA—Phe基因序列變化較小,保守性高,進化慢,不能很好地提供系統(tǒng)發(fā)育信息;控制區(qū)遺傳變異程度較高,因而可以為金魚和鯽魚系統(tǒng)發(fā)育研究提供一個好的分子遺傳標記。從線粒體控制區(qū)分析證實了金魚起源于鯽魚,在演化過程中其遺傳物質(zhì)發(fā)生了較大的變異,各個品種金魚的遺傳物質(zhì)也形成了一定的分化。2、對金

3、魚的代表品種紅龍睛、紅帽子、虎頭、琉金、墨龍睛、水泡眼、珍珠及彭澤鯽的Cytb基因進行了測序,將所得序列同GenBank中日本白鯽、銀鯽、紅鯽、野鯽和鯉魚的序列進行比較分析。從Cytb基因分析,進一步證實了金魚起源于鯽魚。關鍵詞:金魚,鯽魚,線粒體DNA,控制區(qū),Cytb基因AbstractTheresearchoffishasanexperimentalanimalis1aginChina,andthestandardizedanimalofexperimentalfishisstillblankness.G01dfish(('a,assj£,sa啪fus比射哆,whichorigin

4、proVenanceisChina,couldbeaexperimentanimaloffishforstudyandexploration.Theanatomyproperties,protein,isodynamicenzymeandrandomlyamplifiedp01ymorphicgenomeDNAofthe901dfishhavebeenstudiedandreported.HowerVer,asaexperimentalanimal,therelationshipofsystemevolutionandtheinheritm01ecularbackgroundaresti

5、llarguably.MtDNAisawidelyusedmolecularmarkertoinvestigatethephylogenesisofspecies.Inpresentstudy,mitochondrialtRNA—Thrgene,tRNA—Phegeneandpartialcontrolregion(D一100p)andCytbofdifferentvarietiesof901dfishes(1么nFsj£,sa“2一a}£,s訓andcruciancarps(c:’arssj“sa“,a芒“曲hadbeensequenced.TherelationshipofmtDNA

6、m01eculargeneticbetweenthesefishesandotherrelatedfisheswerei1luminated.Themajorresultsinthispaperwerepresentedasf0110ws:1、MitochondrialtRNA—Thrgene,tRNA—Phegeneandpartialcontr01regionofrepresentativevarietiesof餳,ssj“sa“,a芒“sIlIyar,reddragongoldfish,redcap901dfish,tigerheadgoldfish,901dplatinggold

7、fish,blackdragon901dfish,waterVesiclego1dfishandCTa粥sj“sa“,a芒隊sofPengZeweresequenced.ThemolecularphylogenetictreeoftRNA—Thrgene,tRNA—Phegeneandpartialcontrolregionsequencesamongthesegoldfish,redcruciancarp,Japanesecruc

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