粗腳粉螨居群遺傳多樣性的ISSR分析

粗腳粉螨居群遺傳多樣性的ISSR分析

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1、摘要粗腳粉螨是我國(guó)常見(jiàn)的粉螨,是倉(cāng)儲(chǔ)糧食、經(jīng)濟(jì)作物和食用菌的重要害螨,其經(jīng)濟(jì)重要性受到國(guó)內(nèi)外的廣泛重視。本研究采用ISSR分子標(biāo)記探討了不同居群粗腳粉螨的遺傳多樣性及其居群遺傳結(jié)構(gòu)。主要研究?jī)?nèi)容及結(jié)果如下。(1)探索并確定了卡n腳粉螨基因組DNA提取的最佳方案。SDS(10%m/v)40“l(fā),蛋白酶K(10mg/mL)61上l,STE204I,tl;消化溫度:45℃;消化時(shí)l’口J:10—12h;粗腳粉螨個(gè)體數(shù):50只;總體積250“1。(2)建立了ISSR—PCR最佳反應(yīng)體系。通過(guò)『F交實(shí)驗(yàn)方法,建立了粗腳粉螨IS

2、SR.PCR最佳反應(yīng)體系:M92+濃度2.0mmol/L、TaqDNA聚合酶0.75U、dNTPs濃度0.25}tmol/L、引物濃度0.31amol/L、模版DNA量20rig,總體積為251.d。(3)ISSR.PCR擴(kuò)增結(jié)果:共篩選出18條條帶清晰、擴(kuò)增穩(wěn)定、多態(tài)性高的引物,分別對(duì)江西南昌(NC)、九江(JJ)及安徽巢湖兩個(gè)不同寄主(AH—l、AH.2)共4個(gè)不同居群進(jìn)行ISSR.PCR擴(kuò)增,共獲得136條帶,其中多念性條帶107條,多念帶百分比(PPB)為78.68%。(4)遺傳多樣性分析:在居群水平上,平均

3、期望雜合度(He),Shannon信息指數(shù)(I)和多念帶百分比分別為O.1302,0.1875和30.15%;在物種水平上,期望雜合度(He),Shannon指數(shù)(I)和多念帶百分率(PPB)分別為0.0586,O.5314和78.68%。4個(gè)居群的遺傳多樣性山高到低為:JJ>NC>AH.I>AH.2,九江居群遺傳多樣性豐富度最高。(5)群體問(wèn)遺傳變昴分析:各居群?jiǎn)柕幕蚍只禂?shù)Gst為0.6283,說(shuō)明四個(gè)居群J、日J(rèn)表現(xiàn)出較高水平的遺傳分化,這與AMOVA分析結(jié)果(FsT=0.5824,P<0.001)接近。遺傳

4、結(jié)構(gòu)分析表明J苦群?jiǎn)柣鶅戳?Nm=O.2957)水平較低。基于遺傳距離的UPMGA聚類分析顯示安徽粗腳粉螨兩居群親緣關(guān)系最為緊密,九江居群與其他居群親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。分析結(jié)果可得:不同居群的粗腳粉螨發(fā)生了一定的分化,地理居群遺傳差異大于不同寄主居群遺傳差異,各居群遺傳距離與地理距離無(wú)關(guān),說(shuō)明地理隔離并不是形成遺傳差異的主導(dǎo)因素。關(guān)鍵詞:ISSR;粗腳粉螨:遺傳多樣性Abstract———————————————————————————————————————————————————————————一ABSTRACTAcd

5、rMsSiroLinnaeus,acommonacaroidmiteinChina,isoneofthemainpestmitesdamagingthestoredproducts,economiccropsandediblefungi.Themiteiswidelystudiedduetoitseconomicimportance.Inthispaper,thegeneticstructureandgeneticdiversityofA.sireindifferemareaofChinawerestudiedbyu

6、singISSRmarker.Themainresultswereasfollows:r1)ThediscussionandestablishmentoftheoptimumprotocolextractingDNAofA.sire:SDS(10%m/v)40I,tl,proteinaseK(10mg/mL)61al,STE2049l,total250pJofdigestingsystem,andthesampleseachconsistingof50individualsweredigestedat45℃for10

7、.12h.(2)OptimizationofISSR-PCRreactionsystem:theoptimalISSR-PCRreactionsystemwasestablishedwithL16(4’)orthogonaldesign:lOXPCRBuffer2.5mmol/L,Mg-'+2.0mmol/L.dNTPs0.25p.mol/L,ISSRprimers0.39mol/L,DNA20ng,TaqDNApolymeraseO.75U,total25肛1.(3)Theresultsofamplificatio

8、n:18primerswereselectedfortheirabilitytoproduceclearandreproduciblepatternsofpolymorphicbands.Thoseprimerswerethenusedforanalysinggeneticdiversitywithinandamongpopulationsof

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