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《大黃魚肌鈣蛋白基因克隆及序列特征【畢業(yè)設(shè)計】》由會員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、本科畢業(yè)設(shè)計（20__屆）大黃魚肌鈣蛋白基因克隆及序列特征目 錄摘要1關(guān)鍵詞1Abstract1Keywords1引言11材料與方法11.1材料11.1.1實驗材料11.1.2主要試劑、儀器21.1.3主要耗材21.2方法21.2.1EST方法的原理21.2.2質(zhì)粒的提取21.2.3EST測序31.2.4目的基因的生物信息學(xué)分析32結(jié)果32.1質(zhì)粒抽提檢測結(jié)果32.2序列測定42.3序列分析52.3.1大黃魚肌鈣蛋白cDNA序列與其他魚類的同源性52.3.2系統(tǒng)進(jìn)化樹92.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析102.4.1一級結(jié)構(gòu)102.4.2二級結(jié)構(gòu)102
2、.4.3三維結(jié)構(gòu)113討論123.1肌鈣蛋白的特征123.2EST方法的不足124結(jié)論12致謝14參考文獻(xiàn)14摘要：肌鈣蛋白是橫紋肌中起主要調(diào)節(jié)作用的蛋白質(zhì)。有三個亞基：與原肌球蛋白結(jié)合的肌鈣蛋白T、調(diào)節(jié)肌動球蛋白ATP酶活性的肌鈣蛋白I和鈣結(jié)合的肌鈣蛋白C。肌鈣蛋白復(fù)合體調(diào)節(jié)了肌動蛋白與肌球蛋白的結(jié)合，影響肌肉收縮。因此該基因的研究對經(jīng)濟(jì)魚類性狀的改良具有重大意義。本實驗從大黃魚肌肉cDNA文庫，運(yùn)用EST技術(shù)獲得肌鈣蛋白基因序列，得到一條長為一千四百多個堿基的基因序列。在NCBI上經(jīng)BlastX比對后，證實這是大黃魚的肌鈣蛋白基因。再
3、同金頭鯛、斑馬魚、大西洋鱈、鵪鶉、灰樹蛙、原雞、小家鼠、吐綬雞、非洲爪蟾等進(jìn)行同源性比較，發(fā)現(xiàn)大黃肌鈣蛋白基因與金頭鯛、斑馬魚的同源性很高，達(dá)到了100%，與原雞、小家鼠、灰樹蛙的同源性也比較高，有91%，同吐綬雞、非洲爪蟾、鵪鶉也有90%。這些數(shù)據(jù)說明，肌鈣蛋白序列相當(dāng)保守。從系統(tǒng)進(jìn)化樹分析得到，大黃魚編碼的肌鈣蛋白位于高等動物群體中，并且與金頭鯛、大西洋大比目魚、大西洋鮭、大西洋鱈的親緣關(guān)系最近，與文昌魚、裸蓋魚、黑頭呆魚的關(guān)系都較遠(yuǎn)。最后，通過EXPASY分析其編碼蛋白質(zhì)序列，以確定蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)，二級結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)。關(guān)鍵詞：大黃魚
4、；肌鈣蛋白；EST；序列分析Abstract:Troponin?isa?proteininstriatedmusclethatplaysamajor?rolein?regulation.Ithasthree?subunits:the?troponin?Tthatcombineswithtropomyosin,?thetroponin?Ithatregulates?the?activityoftheATP?enzymeofActomyosin,and?theTroponin?C?thatcombineswiththe?calcium.Tro
5、ponincomplexregulatesthecombinationoftheactin?and?myosin,thenleadstothecontractionofmuscle.Therefore,the?researchonthisgenes?isofgreatsignificancetothetraitsimprovementofeconomicfish.Inthisstudy,?thetroponin?sequencesfromthe?cDNA?library?ofLarimichthyscroceamusclebyESTtec
6、hnologyweregot,thenobtainedagenesequencewiththebaseofmorethanfourteenhundredatlength.On?the?NCBI,itwasconfirmedthatthis?wasthe??troponin?geneofLarimichthyscroceaafterthecomparisionthroughBlastX.AfterthehomologywithSparusaurata,Daniorerio,Gadusmorhua,Coturnixcoturnixl,Hyla
7、chrysoscelis,Gallusgallus,Musmusculus,MeleagrisgallopavoandXenopus?laevis,thegeneofLarimichthyscroceatroponinhadhighhomologywithSparusaurata,Daniorerio,reaching?100%,hadrelativelyhigh?homologywithHylachrysoscelis,Gallusgallus,Musmusculus,reaching91%,andhadasmuchas90%highw
8、ithMeleagrisgallopavo,Xenopus?laevisandCoturnixcoturnixwasfoundduringtheexperiment.These?dataind
