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《大黃魚(yú)垂體腫瘤轉(zhuǎn)化基因克隆及分子特征【畢業(yè)設(shè)計(jì)】》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、本科畢業(yè)設(shè)計(jì)（20__屆）大黃魚(yú)垂體腫瘤轉(zhuǎn)化基因克隆及分子特征12目錄引言21材料與方法21.1材料、試劑、儀器21.1.1實(shí)驗(yàn)材料……………………………………………………………………………………...21.1.2實(shí)驗(yàn)試劑……………………………………………………………………………………...21.1.3主要耗材………………………………………………………………………………………31.1.4主要儀器………………………………………………………………………………………31.2方法31.2.1質(zhì)粒提取…………………………………………………………………………………….
2、..31.2.2EST序列測(cè)序…………………………………………………………………………………31.2.3目的基因的生物信息學(xué)分析…………………………………………………………………42結(jié)果與分析42.1大黃魚(yú)PTTGcDNA序列測(cè)定42.2大黃魚(yú)PTTG蛋白序列分析52.2.1大黃魚(yú)PTTG蛋白同源性比較……………………………………………………………...52.2.2系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析……………………………………………………………………………...72.3大黃魚(yú)PTTG蛋白結(jié)構(gòu)分析82.3.1一級(jí)結(jié)構(gòu)分析……………………………………………………………………………
3、…...82.3.2二級(jí)結(jié)構(gòu)分析………………………………………………………………………………...83討論93.1EST的應(yīng)用103.2ESTs數(shù)據(jù)的不足114小結(jié)與展望114.1小結(jié)114.2展望11致謝13參考文獻(xiàn)1412摘要：目的：用EST測(cè)通大黃魚(yú)垂體腫瘤轉(zhuǎn)化基因（PTTG）cDNA的全長(zhǎng)，并利用生物信息學(xué)方法對(duì)其蛋白一級(jí)、二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行模擬分析。方法：根據(jù)大黃魚(yú)肌肉組織cDNA全長(zhǎng)文庫(kù)，經(jīng)大規(guī)模隨機(jī)測(cè)序及重疊群內(nèi)EST序列的拼接,獲得了PTTG基因全長(zhǎng)cDNA序列。多序列比對(duì)采用ClustalW程序。運(yùn)用MEGA2.1軟件，采用Neighbor-j
4、oining法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。用EXPASY網(wǎng)站上的SOPMA法預(yù)測(cè)PTTG蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)和二級(jí)結(jié)構(gòu)。結(jié)果：測(cè)得大黃魚(yú)PTTGcDNA全長(zhǎng)1254bp，含有1個(gè)155bp的5'非編碼區(qū)（UTR），550bp的3'UTR和549bp的開(kāi)放閱讀框（ORF）。整個(gè)開(kāi)放閱讀框編碼182個(gè)氨基酸，預(yù)測(cè)的相對(duì)分子質(zhì)量為20639.0Da，理論等電點(diǎn)為8.68。蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示,該蛋白主要由隨機(jī)卷曲、延伸鏈、α螺旋和β-轉(zhuǎn)角組成。結(jié)論：由PTTG蛋白構(gòu)建的NJ進(jìn)化樹(shù)顯示大黃魚(yú)的PTTG蛋白與胡瓜魚(yú)、白斑狗魚(yú)的親緣關(guān)系較近，與人類、牛的親緣關(guān)系都較遠(yuǎn)。關(guān)鍵詞：大黃魚(yú)；P
5、TTG；EST；序列分析【Abstract】:Objective:Todeterminethefull-lengthofcDNAsequencesofpituitarytumortransforminggene(PTTG)fromPseudosciaenacroceabyEST.ThebioinformaticsandbiotechnologysoftwarewasusedtopredicttheprimarystructuresandsecondarystructureofPTTG.Method:Baseonmuscletissuefull-length
6、cDNAlibraryconstructedsuccessfullyinPseudosciaenacrocea,obtainfull-lengthcDNAsequenceofPTTGgenebyrandomsequencingonalargescaleandESTsequencesassemblyinacongtig.ClustalWprogramwasusedtomakemultiplesequencealignment.UsingMEGA2.1software,thephylogenetictreewasconstructedbyusingNeighb
7、or-joiningmethod.TheprimarystructureandsecondarystructureofPTTGwerepredictedusingSOPMAonEXPASYwebsite.Results:Thefull-lengthofPTTGcDNAsequenceis1254bp,containinga5'UTR(untranslatedregion)of155bp,a3'UTRof550bp,andanORFof549bp.TheORFsequenceencodesapolypeptideof182aminoacidswithanes
8、timatedmolecularweightof20639.0Da
