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《紅笛鯛α-珠蛋白和β-珠蛋白基因的克隆及序列分析.pdf》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、第31卷第3期廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào)V01.31No.32011年6月JournalofGuangdongOceanUniversityJun.2011紅笛鯛Q.珠蛋白和13.珠蛋白基因的克隆及序列分析張新中,魯義善,吳灶和,簡紀(jì)常(廣東海洋大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院,廣東省水產(chǎn)經(jīng)濟(jì)動(dòng)物病原生物學(xué)及流行病學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室暨廣東省高等學(xué)校水產(chǎn)經(jīng)濟(jì)動(dòng)物病害控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東湛江524025)摘要:應(yīng)用已知的標(biāo)簽序列通過RACE.PCR和RT-PCR方法成功克隆紅笛鯛(Lu和lqUSsanguineus)洳珠蛋白和p-珠蛋白基因的全長eDNA序
2、列。a.珠蛋白和B.珠蛋白基因的cDNA全長分別為560和563bp,開放閱讀框分別為429和444bp,各編碼143和148個(gè)氨基酸,理論相對分子質(zhì)量分別為15690和16400,理論等電點(diǎn)為7.79和6.61。氨基酸序列BLAST結(jié)果表明,紅笛鯛a.珠蛋白基因和D.珠蛋白基因編碼的氨基酸序列與其他魚類的相似性分別在59%~79%和55%~80%之間。用鄰接法(Neighbor-Joining)構(gòu)建的c【.珠蛋白基因和D一珠蛋白基因的系統(tǒng)發(fā)育樹表明,紅笛鯛與真鯛(Pagrusmajor)、金頭鯛(Sparusaur
3、ata)和螄(Seriolaquinqueradiata)等親緣關(guān)系較近。關(guān)鍵詞:紅笛鯛;儀.珠蛋白;B.珠蛋白;基因克??;基因序列中圖分類號(hào):Q959.483.3+Q75文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號(hào):1673-9159(2011)03-0001-06MolecularCloningandSequenceAnalysisofa—and[I-GlobinGeneofHunpheadSnapper伍“咖nussanguineus)ZHANGXin-zhong,LUYi-shan,、^,UZao-he,JIANJi·chang(
4、FisheriesCollegeofGuangdongOceanUniversity,GuangdongProvincialKeyLaboratoryofPathogenicBiologyandEpidemiologyforAquaticEconomicAnimals&KeyLaboratoryofDiseasesControllingfo,.AquaticEconomicAnimalsofGuangdongHigherEducationInstitutions,Zhanjiang524025,China)Abstr
5、act:Full—lengthcDNAsequenceofu-globinand13-globingeneofhumpheadsnapper(Lutjanussanguineus)wereclonedbyRACE-PCRandRT-PCRmethodfromtheknownESTs.Thelengthofa-globinandp-globingeneare560bpand563bprespectively.Theopenreadingframeof0【一globinandp-globingenecontain429b
6、pand444bprespectively,andencode143and148aminoacidsrespectively.Relativemolecularweightofa-globinand13-globinare15690and16400.Thetheoreticalisoelectricpointofthemare7.79and6.61.respectively.Resultsofaminoacidsequenceanalysisshowthatthesimilarityofa-globinandp-gl
7、obingeneofhumpheadsnappercomparedwithotherfishareintherangeof59%一79%and55%一80%respectivelyPhylogenetictreeofa—globinandp-globingenearebuiltbyneighbor-joiningmethodandtheresultsalsoshowthathumpheadsnapperhastheclosesthomologywithPagrusmajor,SparusaurataandSeriol
8、aquinqueradiata.Keywords:Lu駟nussanguineus;a—globingene;13-globingene;clone血紅蛋白由兩個(gè)僅類和兩個(gè)B類珠蛋白鏈構(gòu)成,每個(gè)珠蛋白鏈均結(jié)合一個(gè)血紅素。目前,珠蛋白在多種脊椎動(dòng)物基因調(diào)控和生物學(xué)進(jìn)化研究方面已成為一種模式蛋白,有關(guān)鯉(Cyprinuscarpio)、收稿日期:2