中國豌豆地方品種ssr標記遺傳多樣性分析

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1、作物學報ACTAAGRONOMICASINICA2008,34(8):1330?1338http://www.chinacrops.org/zwxb/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2008.01330中國豌豆地方品種SSR標記遺傳多樣性分析1,2221,?宗緒曉關建平王述民劉慶昌12(中國農業(yè)大學農學與生物技術學院,北京100094;中國農業(yè)科學院作物科學研究所/國家農作物基因資源與

2、基因改良重大科學工程,北京100081)摘要:利用21對豌豆多態(tài)性SSR引物,對來自全國春、秋播區(qū)19省區(qū)市的1221份豌豆地方品種進行遺傳多樣性分析,共擴增出104條多態(tài)性帶,每對引物平均擴增出4.95個等位變異,其中有效等位變異占62.52%。省份間SSR等位變異分布均勻,但是省份間有效等位變異數(shù)、Shannon’s信息指數(shù)(I)差異明顯,省籍資源群間遺傳多樣性差異顯著。遺傳多樣性以內蒙古資源群最高,甘肅、四川、云南和西藏等資源群其次,遼寧資源群最低。PCA三維空間聚類圖揭示,我國豌豆地方品種資源分化成

3、3個基因庫,基因庫I主要由春播區(qū)的內蒙古、陜西資源構成,基因庫II主要由秋播區(qū)最北端的河南資源構成,基因庫III主要由除上述省份之外的其他省區(qū)市的資源構成。UPGMA聚類分析表明,不同省份資源群間的遺傳距離變化范圍為5.159~27.586,中國豌豆地方資源據(jù)此聚類成2個組群8個亞組群,與3個基因庫的聚類結果相呼應。聚類結果顯示,我國豌豆地方品種資源群間遺傳距離與其來源地生態(tài)環(huán)境相關聯(lián)。關鍵詞:豌豆栽培種(PisumsativumL.);SSR;遺傳多樣性;中國地方品種資源GeneticDiversitya

4、mongChinesePea(PisumsativumL.)LandracesRe-vealedbySSRMarkers1,2221,?ZONGXu-Xiao,GUANJian-Ping,WANGShu-Min,andLIUQing-Chang12(DepartmentofPlantGeneticsandBreeding,CollegeofAgricultureandBiotechnology,ChinaAgriculturalUniversity,Beijing100094;InstituteofCrop

5、Sciences/TheNationalKeyFacilityforCropGeneResourcesandGeneticImprovement,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100081,China)Abstract:Atotalof1221pea(PisumsativumL.)landracesfrom19provincesinspringsowingandwintersowingareasinChinawereemployedforSSRana

6、lysis.Onehundredandfourpolymorphicbandsweredetectedbyusing21SSRprimerpairs.4.95allelesweredetectedbyeachSSRprimerpaironaverage,ofwhich,62.52%wereeffectiveallelesfordiversity.SSRalleleswereuniformlydistributedinthelandracesamongprovinces,whilethenumberofeff

7、ectiveallelesandShannon'sinformationindex(I)variedmuchamongprovincialbasedgroupsofgeneticresources.Significantdifferenceappearedinthemajorityofpairwisecomparisonsforgeneticdiversitybetweenprovincialbasedgroupsofgeneticresources.InnerMongoliapossessedthehig

8、hestlevelofgeneticdiversity(I=1.066),followedbyGansu(I=1.041),Sichuan(I=1.026),Yunnan(I=1.017)andTibet(I=0.996);Liaoningwasthelowest(I=0.515)ingeneticdiversity.ThreegenepoolsweredetectedinChinesepealandraces,

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