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1、山東農(nóng)業(yè)科學(xué)2013,45(11):7~i1ShandongAgriculturalSciences麻核桃CBF基因的克隆與生物信息學(xué)分析張建朋,張士剛,陳新,徐麗,賈建云。,張力思。,劉慶忠(1.龍口市農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣中心,山東龍口265701;2.泰安市農(nóng)業(yè)局,山東泰安271000;3.山東省果樹(shù)研究所/山東省果樹(shù)生物技術(shù)育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東泰安271000)摘要:CBF基因是植物CBF抗冷途徑的樞紐,對(duì)增強(qiáng)植物抗冷能力極為重要。本研究根據(jù)已知的核桃CBF基因序列設(shè)計(jì)通用性引物,對(duì)麻核桃cDNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,成功
2、獲得麻核桃CBF基因全長(zhǎng)序列,命名為JhCBF。JhCBF全長(zhǎng)820bp,包含一個(gè)645bp的開(kāi)放讀碼框(ORF),編碼214個(gè)氨基酸。序列分析表明JhCBF與其他物種來(lái)源的CBF具有較高的同源性,其中,與樺木科白樺的同源性最高,為61.22%;JhCBF含有一個(gè)預(yù)測(cè)的AP2結(jié)構(gòu)域及CBF特有的兩段短肽序列。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明JhCBF與樺木科白樺的親緣關(guān)系最近,最先聚為一類(lèi)。關(guān)鍵詞:麻核桃;CBF基因;克??;生物信息學(xué)分析中圖分類(lèi)號(hào):Q785文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001—4942(2013)11—0007—0
3、5CloningandBioinformaticAnalysisofCBFGenefromJuglanshopeiensisHuZhangJianpeng,ZhangShigang,ChenXin,XuLi,JiaJianyun,ZhangLisi,LiuQingzhong(1.LongkouAgriculturalTechnologyPromotionCenter,Longkou265701,China;2.TaianAgriculturalBumau,Taian271000,China;3.ShandongIn
4、stituteofPomology/ShandongPr~inciaKeyLaboratoryofFruitTreeBiotechnologyBreeding,Taian271000,China)AbstractCBFgeneplaysacentralroleinCBFcold—responsepathwayinplant.Itisveryimportantinincreasingplantcoldtolerance.Universalprimersweredesignedaccordingtopublishedw
5、alnutCBFgenes,andthenPCRamplificationwascarriedoutusingJuglanshopeiensiscDNA.Finally,theJuglanshopeiensisCBFgenewasobtained,namedJhCBF.Thefull—lengthofJhCBFwas820bp,containinganopeningread-ingframe(ORF)of645bp.Thededucedproteinhad214aminoacids.Sequenceanalysis
6、showedthatJh—CBFsharedhighhomologywithCBFfromotherplants.Amongthem,thehomologywithCBFfromBetulaplatyphylla(Betulaceae)wasthehighestof61.22%.JhCBFcontainedapredictedAP2domainandtwopep-tidesequenceswhichwerespecifictoCBF.PhylogenetictreeanalysisindicatedthatJhCB
7、Fhadtheclosestre-lationshipwithCBFfromBetulaplatyphylla(Betulaceae),andtheywereclusteredintoonegroupfirstly.KeywordsJuglanshopeiensisHu;CBFgene;Clone;Bioinformaticanalysis麻核桃(JuglanshopeiensisHu)屬胡桃科核桃中屬于最高檔次的品種。低溫凍害是影響核(Juglandaceae)胡桃屬(Juglans),主要分布在河桃生長(zhǎng)發(fā)育、造
8、成核桃產(chǎn)量和質(zhì)量下降的主要因北、天津、山西和北京的部分山區(qū)。麻核桃集紋路素之一。南方的泡核桃引種到北方種植時(shí),多數(shù)多變、皮質(zhì)良好、造型優(yōu)美等優(yōu)點(diǎn)于一身,在文玩因低溫脅迫致死,而我國(guó)獨(dú)有的麻核桃能夠在河收稿日期:2013—07—29基金項(xiàng)目:科技部科技基礎(chǔ)工作資助項(xiàng)目“國(guó)家核桃板栗種質(zhì)資源平臺(tái)”(2013—048);農(nóng)業(yè)部種質(zhì)資源保護(hù)項(xiàng)目(2013—26);山