紅掌轉(zhuǎn)錄組測序及花青素生物合成途徑差異表達基因的分析

紅掌轉(zhuǎn)錄組測序及花青素生物合成途徑差異表達基因的分析

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1、''--'V:-:(.A./-;;'、';;.-'.-.盧:皆,V.:^A■'"''"’.-''-'V,i沾巧;;、v齡M'.??.'A.HS;\:.—;乂7一\戶〇."<''’.、V,..:戈->芒:,,安''如...,-,乂:..-‘S663.單位代碼:W743分類號.:;邊’'''.:1—如:20672密級公巧學號12130:公開,?'-.*?S一.、';..3I:八、寧夏大舉心■'>:;.?.’護如碩工學位論文澤V;V/''心‘-:

2、心;,紅掌轉(zhuǎn)聚細測序及花青素生物合成途徑差t^了W異表達基因的分析一‘^?TranscrtomeAnalsisandAiithocaninBiosnthesisipyyyGeneticExressionintheSatheof泣巧</廬6?化《^?pp-么.■'.'‘^…,>矜二:’‘心’擇>.巧.學位.,申請人:彭偉佳■'片和,?'';平吉成教授指導教師.K苗V.--.指導教師;M張黎教Tr搜jr.■?'.t-.T■,,—,-T,,-'‘

3、申請學位口類級別;農(nóng)學碩±I..-今、萬:果柄學作,?;Q....._—’-'V':岡林植物與觀當園藝V.;研巧方向...一‘V ̄<.、乂、:一.、:.'戶/P元:心.f在學農(nóng)學院、..*■■.一,-一‘':,:,;、'^.--:論文完成曰期2015年5月.._’纖:麵麵冥’—化心山<-丑■,.公。:心.;一心T-獨創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是我個人在導師指導下進行的研巧工作及取得的研究成果。盡我所知>1,除了文中特別加^標注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已|經(jīng)發(fā)表

4、或撰寫過的研巧成果,也不包含為獲得寧夏大學或其它教育機構(gòu)的學位或證一書而使用過的材料。與我同工作的同志對本研充所做的任何貢獻均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名:時間:年月聲日關(guān)于論文使用授權(quán)的說明本人完全了解寧夏大學有關(guān)保留、使用學位論文的規(guī)定,即;學校有權(quán)保留送交論文的復印件和磁盤,,允許論文被查I匆和借閱可W采用影印、縮印或掃描等復制手段保存、匯編學位論文。同意寧夏大學可W用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學位論文的全部或部分內(nèi)容。研究生簽名:Mi時間:年r月^曰皆-導師簽名;時間:年\月。日3摘要’紅掌C4nA

5、w7Mma?<ire£?jMm)作為具有重要經(jīng)濟價值的盆花、切花種類。?。薹鹧嫔鯙橹鳎崳娨^賞部位,其顏色是決定商品價值的最重要因素。傳統(tǒng)的雜交育種方式耗時長、后代變異大,,選種困難利用誘變育種,獲得變異植株概率小很難得到變異后代!分子育種是培育;,新晶種的新方法,但因目前對紅掌分子研巧背景缺乏分子方面研巧相對滯后。為提高紅掌選育效率,有必要建立紅掌性狀控制的分子遺傳學基礎(chǔ),因此建立紅掌基因組數(shù)據(jù)庫意義重一大UuminaH設(shè)e/MiSe8個連(S^S8)。本研巧采用新代髙通量lqq測序方法對紅掌續(xù)生長期做轉(zhuǎn)錄姐測序,并對S5(盛花期:紅色)和S8(衰老期:綠色

6、)時期分別做數(shù)字基因表達譜(DGE)測序,豐富了紅掌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫信息,獲得控制紅掌佛焰巷花青素生物合成途徑中顏色變化的關(guān)鍵基因。為后續(xù)功能基因克隆、分子標記篩選W及基因改良育種等提供了背景參考:。具體研充結(jié)果如下(l)1、對紅掌佛焰荀整個生長周期進斤轉(zhuǎn)錄姐測序得到有效基因序列ceanreads56445573-i,條,數(shù)提量達5.64Gi并得到長度分布在2002000bp的單基因簇(ungene)64576條豐富了紅掌轉(zhuǎn)錄姐數(shù)據(jù)信息。2、對S5(盛花期:紅色)和S8(衰老期:綠色)時期進行數(shù)字基因表達譜測序,分別得到:2和185的390條(

7、1.86G)可分析序列(cleanreads),其中彼12766374條(l.8G)成功注釋有差異表達的基因序列2316條。3、轉(zhuǎn)錄組結(jié)合數(shù)字基因表達譜測序,得到了在S5和S8兩個時期差異表達的10條與花青素生物代謝途經(jīng)有關(guān)的基因序列,通過NCBI比對,10條序列確定為8種基因,分別為’--3-(巧經(jīng)化酶査耳麗合成酶覽)、查耳麗異構(gòu)酶(CWn、黃燒麗P咨化酶jy)、類黃麗3’(巧好)、二氧黃麗醇還原酶(0巧?)、花色巧合酶(^5)、無色

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