紅掌轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及花青素生物合成途徑差異表達(dá)基因的分析

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1、''--'V:-:(.A./-;;'、';;.-'.-.盧:皆,V.:^A■'"''"’.-''-'V,i沾巧;;、v齡M'.??.'A.HS;\:.—;乂7一\戶〇."<''’.、V,..:戈->芒:,,安''如...,-,乂:..-‘S663.單位代碼:W743分類號(hào).:;邊’'''.:1—如:20672密級(jí)公巧學(xué)號(hào)12130:公開,?'-.*?S一.、';..3I:八、寧夏大舉心■'>:;.?.’護(hù)如碩工學(xué)位論文澤V;V/''心‘-:

2、心;,紅掌轉(zhuǎn)聚細(xì)測(cè)序及花青素生物合成途徑差t^了W異表達(dá)基因的分析一‘^?TranscrtomeAnalsisandAiithocaninBiosnthesisipyyyGeneticExressionintheSatheof泣巧</廬6?化《^?pp-么.■'.'‘^…,>矜二:’‘心’擇>.巧.學(xué)位.,申請(qǐng)人:彭偉佳■'片和,?'';平吉成教授指導(dǎo)教師.K苗V.--.指導(dǎo)教師;M張黎教Tr搜jr.■?'.t-.T■,,—,-T,,-'‘

3、申請(qǐng)學(xué)位口類級(jí)別;農(nóng)學(xué)碩±I..-今、萬:果柄學(xué)作,專化名稱....._—’-'V':岡林植物與觀當(dāng)園藝V.;研巧方向...一‘V ̄<.、乂、:一.、:.'戶/P元:心.f在學(xué)農(nóng)學(xué)院、..*■■.一,-一‘':,:,;、'^.--:論文完成曰期2015年5月.._’纖:麵麵冥’—化心山<-丑■,.公。:心.;一心T-獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研巧工作及取得的研究成果。盡我所知>1,除了文中特別加^標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已|經(jīng)發(fā)表

4、或撰寫過的研巧成果,也不包含為獲得寧夏大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證一書而使用過的材料。與我同工作的同志對(duì)本研充所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名:時(shí)間:年月聲日關(guān)于論文使用授權(quán)的說明本人完全了解寧夏大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,即;學(xué)校有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和磁盤,,允許論文被查I匆和借閱可W采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。同意寧夏大學(xué)可W用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容。研究生簽名:Mi時(shí)間:年r月^曰皆-導(dǎo)師簽名;時(shí)間:年\月。日3摘要’紅掌C4nA

5、w7Mma?<ire£?jMm)作為具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的盆花、切花種類。?。薹鹧嫔鯙橹鳎崳娨^賞部位,其顏色是決定商品價(jià)值的最重要因素。傳統(tǒng)的雜交育種方式耗時(shí)長(zhǎng)、后代變異大,,選種困難利用誘變育種,獲得變異植株概率小很難得到變異后代!分子育種是培育;,新晶種的新方法,但因目前對(duì)紅掌分子研巧背景缺乏分子方面研巧相對(duì)滯后。為提高紅掌選育效率,有必要建立紅掌性狀控制的分子遺傳學(xué)基礎(chǔ),因此建立紅掌基因組數(shù)據(jù)庫意義重一大UuminaH設(shè)e/MiSe8?jìng)€(gè)連(S^S8)。本研巧采用新代髙通量lqq測(cè)序方法對(duì)紅掌續(xù)生長(zhǎng)期做轉(zhuǎn)錄姐測(cè)序,并對(duì)S5(盛花期:紅色)和S8(衰老期:綠色

6、)時(shí)期分別做數(shù)字基因表達(dá)譜(DGE)測(cè)序,豐富了紅掌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫信息,獲得控制紅掌佛焰巷花青素生物合成途徑中顏色變化的關(guān)鍵基因。為后續(xù)功能基因克隆、分子標(biāo)記篩選W及基因改良育種等提供了背景參考:。具體研充結(jié)果如下(l)1、對(duì)紅掌佛焰荀整個(gè)生長(zhǎng)周期進(jìn)斤轉(zhuǎn)錄姐測(cè)序得到有效基因序列ceanreads56445573-i,條,數(shù)提量達(dá)5.64Gi并得到長(zhǎng)度分布在2002000bp的單基因簇(ungene)64576條豐富了紅掌轉(zhuǎn)錄姐數(shù)據(jù)信息。2、對(duì)S5(盛花期:紅色)和S8(衰老期:綠色)時(shí)期進(jìn)行數(shù)字基因表達(dá)譜測(cè)序,分別得到:2和185的390條(

7、1.86G)可分析序列(cleanreads),其中彼12766374條(l.8G)成功注釋有差異表達(dá)的基因序列2316條。3、轉(zhuǎn)錄組結(jié)合數(shù)字基因表達(dá)譜測(cè)序,得到了在S5和S8兩個(gè)時(shí)期差異表達(dá)的10條與花青素生物代謝途經(jīng)有關(guān)的基因序列,通過NCBI比對(duì),10條序列確定為8種基因,分別為’--3-(巧經(jīng)化酶査耳麗合成酶覽)、查耳麗異構(gòu)酶(CWn、黃燒麗P咨化酶jy)、類黃麗3’(巧好)、二氧黃麗醇還原酶(0巧?)、花色巧合酶(^5)、無色

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