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《基于線粒體基因組D-loop區(qū)全序列分析安義瓦灰雞遺傳多樣性及其起源進化關系-論文.pdf》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、，參麓_onlines意■嫩■揀燎一麓ystem：http：Hww若w．iabiotechorggy黥嘗囂漿醞l==基于線粒體基因組D．1oop區(qū)全序列分析安義瓦灰雞遺傳多樣性及其起源進化關系高玉時賈曉旭唐修君唐夢君樊艷風陸俊賢顧榮葛慶聯(lián)蘇一軍江蘇省家禽科學研究所揚州I225125通訊作者，gaoysl00@sina．COIll摘要本研究旨在探究江西安義瓦灰雞(Gallusgallusdomestiaus)的遺傳多樣性和起源。對30只安義瓦灰雞線粒體基因組(mitochondrialgenome，mtDNA)D．1oop區(qū)全序列的進行PC
2、R擴增和測序(GenBank登錄號：KP893677～KP893682)，并結合GenBank中紅色原雞的D1oop區(qū)序列，分析安義瓦灰雞線粒體多態(tài)性及其起源。結果發(fā)現(xiàn)，安義瓦灰雞mtDNAD．1oop區(qū)全長1231～1232bp，核苷酸多樣性)為(O．00613+0．00014)，單倍型多樣性(rid)為(0．837~0．027)。在30只個體中，共發(fā)現(xiàn)18處單核苷酸多態(tài)位點，6種單倍型。系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)，6種單倍型可以分為A、B、C3個分支，其中C為主要分支，有3種單倍型，A分支有1種倍型，B分支有2種倍型。A和B分支與紅色原雞滇南亞
3、種(Gallusgallusspadiceus)聚為一類，C分支與4個原雞亞種聚為一類。研究結果表明，安義瓦灰雞mtDNAD—loop區(qū)有豐富的多態(tài)性，并且有多個母系起源，從分子水平上為安義瓦灰雞的遺傳資源保護和開發(fā)利用提供了參考。關鍵詞安義瓦灰雞，線粒體DNA，D—loop區(qū)，系統(tǒng)發(fā)育關系，起源TheGeneticDiversityandOriginAnalysisofAnyiTile-likeChickens(Callusgallusdomestiaus)BasedonMitochondrialDNAD—loopSequenceGAO
4、Yu—ShiJIAXiao—XuTANGXiu—JunTANGMeng—JunFANYan—FengLUJun-XianGURongGEQing—LianSUYi—JunJiangsuInstituteofPoultryScience，Yangzhou225125，ChinaCorrespondingauthor．gaoys100@sina．comAbstractThisstudysoughttoassessmitochondrialDNA(mtDNA)diversityandoriginofJiangxiAnyiTile—likeChi
5、ckens(Gallusgallusdomestiaus)．Bloodsampleswerecollectedfrom30chickens．ThecompletesequenceofthemtDNAD-loopwasPCRamplifiedandsubsequentlysequenced(GenbankaccessionNo．KP893677-KP893682．)．DNAsequenceofmtDNAD—loopoffiveredjunglefowlsubspecieswerecollectedfromtheGenBankanduseda
6、sreferencesequences．Theresultsshowedthat，theD-loopregionofAnyiTile—likeChickenswas1231-1232bpinlength．Thenucleotidediversitywas(0．006134-0．00014)，andthehaplotypediversitywasf0．837~0．027)．The6haplotypeswereobservedbasedon18mutantsiteandclusteredintothreeclades(A，B，andC)，of
7、whichcladeCwasdominant．ThreehaplotypesbelongtocladeC，twohaplotypesareincladeB．oneisincladeA．ThecladeAandcladeBwereclusteredwithGallusgallusspadiceus，cladeCwasclusteredwithfoursubspeciesofredjunglefow1．TheseresultsshowahighmitochondrialD．1oopdiversityandindicatemultiplemat
8、ernaloriginsforAnyiTile-likeChickens．Theresults基金項目：國家自然科學基金(No．31372277)收稿日期：2014．12．30接受日期：201
