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1、第29卷第2期北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào)V01.29,NO.22014年4月JOURNALOFBEIJINGUNIVERSITYOFAGRICULTUREApr.,2014草莓果實(shí)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及鑒定張少會(huì),沈元月(北京市農(nóng)業(yè)應(yīng)用新技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京農(nóng)學(xué)院植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,北京102206)摘要:草莓是研究果實(shí)發(fā)育的模式植物。基因表達(dá)譜分析已成為目前分子生物學(xué)領(lǐng)域重要的研究方向。草莓cDNA文庫(kù)構(gòu)建是研究果實(shí)發(fā)育基因表達(dá)的基礎(chǔ)工作。本研究從草莓白果中提取高質(zhì)量的總RNA,通過(guò)MMIV反轉(zhuǎn)錄酶的作用,把RNA中的mRNA反轉(zhuǎn)成cD
2、NA第一鏈,再利用特異引物通過(guò)LD-PCR擴(kuò)增合成雙鏈cDNA。將純化帶有黏性末端的雙鏈cDNA與kTripIEx2載體進(jìn)行連接,最后對(duì)重組載體進(jìn)行E.coliXI1一Blue體外包埋為cDNA原始文庫(kù)。經(jīng)過(guò)鑒定,原始文庫(kù)的滴度為1.13×10~cfu/mL,重組率為100,插入片段多分布在0.2-2.0kb之間,表明構(gòu)建的草莓果實(shí)cDNA文庫(kù)質(zhì)量較高,能夠滿足后續(xù)的分子生物學(xué)研究工作的需要,同時(shí)也為其他果樹(shù)相關(guān)研究提供借鑒。關(guān)鍵詞:草莓果實(shí);RNA提??;cDNA文庫(kù)中圖分類號(hào):$668.4網(wǎng)絡(luò)出版地址:http://ww
3、w.cnki.net/kcms/detail/】】.2156.S.20140507.2042.062.html文章編號(hào):1002—3186(2014)02—0012·O3文獻(xiàn)標(biāo)志碼:Adoi:10.13473/j.cnki.issn.1002—3186.2014.0052ConstructionofacDNAlibraryofstraberryfruitZHANGShaohui,SHENYuanyue(BeijingKeyLabofNew—techinAgricultureApplication,BeijingUniver
4、sityofAgriculture,Beijing102206,China)Abstract:Strawherryisamodelplantforfruitdevelopmentresearch.Geneexpressionprofilingisanimportantresearchfieldofmolecularbiology.Thus,constructionofcDNA1ibrary1aysfoundationonstudyingfruitdevelopment—relatedgeneexpressioninstra
5、wberry.Inthisstudy,totalRNAwasisolatedfromfruitsofstrawberrywhitefruitstage,singlestrandcDNAwassyn—thesizedbasedontheextractedmRNAsoftotalRNAusingMMIVreversetranscriptase.a(chǎn)nddoublestrandcDNAsweresyn—thesizedusingPCR,thendoublestrandcDNAswerepurifiedandpackagedbyth
6、ephagepackagingsystemandligatedtothebluntedTripEx2vector,finallytransformedintotherecombinantvectorofE.coliXL1一Blue.Theresultsshowedthatthecon—structedcDNAlibraryiSofthetiterof1.13×lOcfu/m1,theinsertsizesiSbetween0.2~2kh,andrecombinationrateofthecDNAlibraryreached
7、i00,indicatingthatahighercDNAlibraryofstrawberryfruitisconstructed,whichmeetstheneedsofsubsequentmolecularbiologyresearch,meanwhileprovidesafoundationforotherfruittreerelatedstudies.Keywords:strawberryfruit;RNAextract;cDNAlibrary近年來(lái),隨著基因大規(guī)模、高通量測(cè)序的實(shí)現(xiàn),基因表達(dá)莓果實(shí)發(fā)育特殊的白果
8、期果實(shí)為試驗(yàn)材料,在提取分離高質(zhì)譜分析在挖掘新基因及基因新功能方面具有明顯的優(yōu)勢(shì),目量RNA的基礎(chǔ)上,通過(guò)反轉(zhuǎn)錄、PCR擴(kuò)增、載體連接、體外前已成為分子生物學(xué)領(lǐng)域重要的研究方向。cDNA文庫(kù)代包埋等一系列cDNA文庫(kù)構(gòu)建的操作,成功構(gòu)建草莓果實(shí)高表mRNA的反轉(zhuǎn)錄復(fù)本,從中可以分離各種cDNA,在研究質(zhì)