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《花生根全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及分析.pdf》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫(kù)。
1、中國(guó)油料作物學(xué)報(bào)2014,36(5):653-660ChineseJournalofOilCropSciencesdoi:10.7505/j.issn.1007-9084.2014.05.015花生根全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及分析11111,21陳華,張沖,蔡鐵城,鄧燁,鄭奕雄,莊偉建(1.福建省作物分子與細(xì)胞生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福建福州,350002;2.仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院,廣東廣州,510225)摘要:以閩花6號(hào)為材料,利用SMART技術(shù)成功構(gòu)建了花生根全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)。原始文庫(kù)滴度為1.3×610cfu/mL,重組率達(dá)9
2、5.8%,插入片段大小為750~2000bp,符合全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。隨機(jī)挑選35個(gè)單克隆進(jìn)行雙向測(cè)序,共獲得30條有效序列。通過與NCBI非冗余蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)和注釋,獲得已知功能基因或具推測(cè)功能的基因15個(gè),未知功能基因7個(gè),新基因13個(gè),其中34個(gè)(97.1%)基因?yàn)榛ㄉ磮?bào)道的基因。因此,該文庫(kù)的構(gòu)建為克隆和研究花生根部重要表達(dá)基因、從分子水平上揭示花生根的生長(zhǎng)發(fā)育規(guī)律提供了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞:花生;SMART技術(shù);全長(zhǎng)cDNA文庫(kù);根中圖分類號(hào):S565.203文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):1007-9084(2
3、014)05-0653-08Constructionandanalysisofrootsfull-lengthcDNAlibraryofpeanut11111,21CHENHua,ZHANGChong,CAITie-cheng,DENGYe,ZHENGYi-xiong,ZHUANGWei-jian(1.FujianProvincialKeyLaboratoryofCropMolecularandCellBiology,Fuzhou350002,China;2.ZhongkaiUniversityofAgriculture
4、andEngineering,Guangzhou510225,China)Abstract:RootcDNAlibraryofpeanutwasconstructedwiththerootsofArachishypogaeacvMinhua6using6SMARTtechnique.Theoriginallibraryhadatiterof1.3×10cfu/mL,ofwhich95.8%cloneswererecombinantandinsertcDNAswerefrom750bpto2000bp.35clonesfro
5、mthecDNAlibraryweresequencedand30validsequencesweregenerated.25knownorhypothenticalfunctionalgenes,7unidentifiedgenesand13novelgenewereannotatedbyBlastxsearchesagainsttheNCBInon-redundantproteindatabase.Amongthesegenes,34genes(97.1%)hadnotbeenreportedinpeanut.The
6、resultrevealedthatexpressiongenesinpeanutrootreportedonlineatpresentwerestillrare.ThefulllengthcDNAlibraryofpeanutrootsconstructedinthisstudywouldbebeneficialtomineimportantfunctionalgenesexpressedinpeanutrootsandsupplybasistostudyonthegrowthanddevelopmentofpeanu
7、trootsfrommolecularlevel.Keywords:Peanut;SMARTtechnology;Full-lengthcDNAlibrary;Root根系是植物長(zhǎng)期適應(yīng)陸地生活的重要器官之花生白藜蘆醇的研究已成為花生研究的熱點(diǎn)之[3,4]一,可以從土壤中吸收水分和無機(jī)養(yǎng)分,并通過根的一。另外,花生根部是響應(yīng)干旱脅迫的重要部[5]微管組織運(yùn)輸和轉(zhuǎn)運(yùn)到地上部,還可以將地上部合位,花生根部病害如根腐病、根結(jié)線蟲病等也是[1]成的光合產(chǎn)物等有機(jī)物輸送到根的各部位?;ㄓ绊懟ㄉa(chǎn)量和品質(zhì)的重要病害之一。然而,目前生是
8、我國(guó)重要的油料和經(jīng)濟(jì)作物,其根系屬直根系,已知的花生功能基因基本集中在地上部分的轉(zhuǎn)錄由主根和多級(jí)側(cè)根組成,是支撐、固定花生植株,吸本,在分離花生根部表達(dá)的功能基因及調(diào)控基因方收和輸導(dǎo)水分、養(yǎng)分、合成某些氨基酸和激素的器面報(bào)道甚少。因此,構(gòu)建花生根全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)對(duì)官。具有抗菌、抗脂質(zhì)過氧化以及降低固醇等