草莓果實cDNA文庫的構(gòu)建及鑒定-論文.pdf

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1、第29卷第2期北京農(nóng)學院學報V01.29,NO.22014年4月JOURNALOFBEIJINGUNIVERSITYOFAGRICULTUREApr.,2014草莓果實cDNA文庫的構(gòu)建及鑒定張少會,沈元月(北京市農(nóng)業(yè)應用新技術(shù)重點實驗室,北京農(nóng)學院植物科學技術(shù)學院,北京102206)摘要:草莓是研究果實發(fā)育的模式植物。基因表達譜分析已成為目前分子生物學領(lǐng)域重要的研究方向。草莓cDNA文庫構(gòu)建是研究果實發(fā)育基因表達的基礎(chǔ)工作。本研究從草莓白果中提取高質(zhì)量的總RNA,通過MMIV反轉(zhuǎn)錄酶的作用,把RNA中的mRNA反轉(zhuǎn)成cD

2、NA第一鏈,再利用特異引物通過LD-PCR擴增合成雙鏈cDNA。將純化帶有黏性末端的雙鏈cDNA與kTripIEx2載體進行連接,最后對重組載體進行E.coliXI1一Blue體外包埋為cDNA原始文庫。經(jīng)過鑒定,原始文庫的滴度為1.13×10~cfu/mL,重組率為100,插入片段多分布在0.2-2.0kb之間,表明構(gòu)建的草莓果實cDNA文庫質(zhì)量較高,能夠滿足后續(xù)的分子生物學研究工作的需要,同時也為其他果樹相關(guān)研究提供借鑒。關(guān)鍵詞:草莓果實;RNA提取;cDNA文庫中圖分類號:$668.4網(wǎng)絡出版地址:http://ww

3、w.cnki.net/kcms/detail/】】.2156.S.20140507.2042.062.html文章編號:1002—3186(2014)02—0012·O3文獻標志碼:Adoi:10.13473/j.cnki.issn.1002—3186.2014.0052ConstructionofacDNAlibraryofstraberryfruitZHANGShaohui,SHENYuanyue(BeijingKeyLabofNew—techinAgricultureApplication,BeijingUniver

4、sityofAgriculture,Beijing102206,China)Abstract:Strawherryisamodelplantforfruitdevelopmentresearch.Geneexpressionprofilingisanimportantresearchfieldofmolecularbiology.Thus,constructionofcDNA1ibrary1aysfoundationonstudyingfruitdevelopment—relatedgeneexpressioninstra

5、wberry.Inthisstudy,totalRNAwasisolatedfromfruitsofstrawberrywhitefruitstage,singlestrandcDNAwassyn—thesizedbasedontheextractedmRNAsoftotalRNAusingMMIVreversetranscriptase.a(chǎn)nddoublestrandcDNAsweresyn—thesizedusingPCR,thendoublestrandcDNAswerepurifiedandpackagedbyth

6、ephagepackagingsystemandligatedtothebluntedTripEx2vector,finallytransformedintotherecombinantvectorofE.coliXL1一Blue.Theresultsshowedthatthecon—structedcDNAlibraryiSofthetiterof1.13×lOcfu/m1,theinsertsizesiSbetween0.2~2kh,andrecombinationrateofthecDNAlibraryreached

7、i00,indicatingthatahighercDNAlibraryofstrawberryfruitisconstructed,whichmeetstheneedsofsubsequentmolecularbiologyresearch,meanwhileprovidesafoundationforotherfruittreerelatedstudies.Keywords:strawberryfruit;RNAextract;cDNAlibrary近年來,隨著基因大規(guī)模、高通量測序的實現(xiàn),基因表達莓果實發(fā)育特殊的白果

8、期果實為試驗材料,在提取分離高質(zhì)譜分析在挖掘新基因及基因新功能方面具有明顯的優(yōu)勢,目量RNA的基礎(chǔ)上,通過反轉(zhuǎn)錄、PCR擴增、載體連接、體外前已成為分子生物學領(lǐng)域重要的研究方向。cDNA文庫代包埋等一系列cDNA文庫構(gòu)建的操作,成功構(gòu)建草莓果實高表mRNA的反轉(zhuǎn)錄復本,從中可以分離各種cDNA,在研究質(zhì)

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