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1、實(shí)驗(yàn)質(zhì)粒DNA的提取及電泳檢測(cè)一實(shí)驗(yàn)?zāi)康耐ㄟ^本實(shí)驗(yàn)學(xué)習(xí)掌握堿裂解法提取細(xì)菌質(zhì)粒DNA。二實(shí)驗(yàn)原理1.細(xì)菌中有兩種DNA,即染色體DNA和質(zhì)粒DNA。2.質(zhì)粒DNA的提取方法有三種:堿裂解法,煮沸法,去污劑(如Triton和SDS)裂解法。3.堿裂解法比較劇烈,可破壞堿基配對(duì),使宿主細(xì)胞DNA變性,共價(jià)閉合環(huán)狀DNA由于空間纏繞,兩條鏈不會(huì)徹底分開。當(dāng)外界條件到達(dá)復(fù)性條件時(shí),質(zhì)粒DNA的雙鏈又迅速恢復(fù)原狀,而較大的線性染色體DNA難以復(fù)性。三實(shí)驗(yàn)材料:轉(zhuǎn)化后的細(xì)菌(含有質(zhì)粒的大腸桿菌)四、實(shí)驗(yàn)用具和藥品1.實(shí)驗(yàn)用具:搖床
2、,離心機(jī),移液器及槍頭,玻璃試管(15mL)及塞子,離心管(1.5mL)2.實(shí)驗(yàn)試劑:(1)溶液I50mmol/L葡萄糖25mmol/L三羥甲基氨基甲烷(Tris)Tris·HCl(pH8.0)10mmol/L乙二胺四乙酸(EDTA)(pH8.0)(2)溶液II0.4mol/LNaOH,2%SDS,用前等體積混合(3)溶液III5mol/L乙酸鉀60ml冰乙酸11.5ml水28.5ml(4)TE緩沖液10mmol/LTris·HCl(pH8.0)1mmol/LEDTA(pH8.0)(5)70%乙醇(放-20℃冰箱中,用
3、后即放回)(6)加樣緩沖液(6X):40%蔗糖、0.25%溴酚蘭(7)電泳緩沖液:0.045mol/LTris-硼酸0.001mol/LEDTA(0.5XTBEbuffer)電泳緩沖液貯存液:5X:54gTris堿、27.5g硼酸、20ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)五實(shí)驗(yàn)步驟(一)細(xì)菌繁殖挑取白色的單菌落若干,轉(zhuǎn)移到3mL液體LB培養(yǎng)基(附加100mg/mlAmp),37℃過夜振蕩(200r/min)培養(yǎng)。(二)菌體收集將過夜培養(yǎng)的菌體轉(zhuǎn)入1.5mL離心管,離心30sec5000r/min;棄上清提取質(zhì)粒(
4、三)質(zhì)粒提取方法一:堿裂解法提取質(zhì)粒DNA1..將上述沉淀重懸于250μL冰預(yù)冷的溶液Ⅰ中,劇烈震蕩;2.加入250μL溶液Ⅱ,蓋緊管口,快速顛倒離心管5~10次;3.加入350μL冰預(yù)冷的溶液Ⅲ,蓋緊管口,溫和地顛倒離心管5~10次;9000r/min離心5min上清轉(zhuǎn)移到另一新1.5mL離心管中;4.加等體積氯仿,振蕩混合,靜置,9000r/min離心5min,上清轉(zhuǎn)移到另一新1.5mL離心管中;5.加入1/10體積3mol/L的醋酸鈉和2倍體積的乙醇,充分混勻,靜置5min;9000r/min離心5min;6.棄
5、上清,用70%ethanol洗滌;7.加30μLTE溶解,-20℃保存。方法二:試劑盒提取方法1.離心收集的菌體中加入含RNAase的溶液Ⅰ250μL,重懸菌體,不應(yīng)留有小的菌塊;2.加溶液Ⅱ250μL,輕輕顛倒離心管4-6次,使菌體充分裂解,至溶液澄清;3.加入350μL冰預(yù)冷的溶液Ⅲ,溫和并充分地上下翻轉(zhuǎn)混合6-8次;4.12000r/min離心10min;5.將上清轉(zhuǎn)移到DNA結(jié)合管(置于2ml離心管中),12000r/min離心1min,棄濾液;6.將制備管置回離心管,加入去蛋白試劑500μL,12000r/m
6、in離心1min,棄濾液;7.將制備管置回離心管,加洗滌液700μL,12000r/min離心1min,棄濾液;以同樣的方法再用700μL洗滌液洗滌一次,棄濾液。8.將制備管置回2ml離心管中,12,000×g離心1min,去除殘余的洗滌液;10將DNA結(jié)合柱放入另一個(gè)新的1.5mL離心管中,在制備管膜中央加60-80μL洗脫液或去離子水,室溫靜置1min。12,000×g離心1min。(四)檢測(cè)提取DNA質(zhì)量的電泳檢測(cè)。取4ul質(zhì)粒DNA+2ul加樣緩沖液+6ulddH2O;配制1%的瓊脂糖凝膠電泳30min,EB染
7、色,拍照。注意事項(xiàng):氯仿對(duì)眼睛、皮膚、粘膜及呼吸道都有刺激作用,它是致癌劑并可損傷肝臟和腎臟,操作時(shí)需戴手套、口罩。六實(shí)驗(yàn)作業(yè)1.思考本實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵步驟是什么?2.瓊脂糖電泳鑒定質(zhì)粒DNA時(shí),能看到幾條帶,快慢順序是什么?3.附上電泳圖片。(注:專業(yè)文檔是經(jīng)驗(yàn)性極強(qiáng)的領(lǐng)域,無法思考和涵蓋全面,素材和資料部分來自網(wǎng)絡(luò),供參考??蓮?fù)制、編制,期待你的好評(píng)與關(guān)注)