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《差異表達(dá)基因克隆技術(shù)的新進(jìn)展 》由會員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、差異表達(dá)基因克隆技術(shù)的新進(jìn)展 提要分離并克隆差異表達(dá)基因是目前功能性基因研究的熱點(diǎn)。mRNA差異展示是篩選差異表達(dá)基因最有效的技術(shù)之一，它的主要不足是有一定假陽性。RDA、SSH、DSD、LSH技術(shù)能夠克服假陽性，但也具有一定的不足，應(yīng)根據(jù)需要選擇運(yùn)用。隨著能擴(kuò)增長片段及具有自動校正功能的Taq酶出現(xiàn)及應(yīng)用，這些技術(shù)將會不斷完善與發(fā)展，具有廣闊的應(yīng)用前景?！ ￡P(guān)鍵詞差異表達(dá)基因；克隆 現(xiàn)代分子生物學(xué)研究表明，人類基因組約由10萬左右的不同基因組成，這些基因選擇性的表達(dá)決定了機(jī)體整個(gè)生命過程，基因表達(dá)的變化處于控制生物學(xué)調(diào)節(jié)
2、機(jī)制的中心位置。因此，分離并克隆差異表達(dá)基因不僅有助于闡明生命的粵秘，而且還能為基因診斷與治療提供重要的理論依據(jù)。近幾年來，差異表達(dá)基因克隆技術(shù)不斷完善與發(fā)展，已成為研究腫瘤和疾病等相關(guān)基因的重要手段?！ ∫?、mRNA差異展示8 mRNA差異展示（mRNAdifferentialdisplay,DDRT-PCR）是目前篩選差異表達(dá)基因最有效的方法之一，其基本原理是：3´端采用錨定引物，與mRNA3´polya結(jié)合，進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄，形成mRNA：cDNA雜交分子，5´端采用20條隨機(jī)引物，與錨定
3、引物一起進(jìn)行PCR擴(kuò)增，其產(chǎn)物經(jīng)測序膠顯示出來，再回收鑒定克隆差異條帶。1992年Liang和Pardee[1]建立此技術(shù)時(shí)，5´端采用20條隨機(jī)引物，每條由10個(gè)堿基組成，3´端采用12條引物即T12MN(M=A、C或G，N=A、G、C、T)。這種組合從統(tǒng)計(jì)學(xué)上幾乎能完全覆蓋所有的mRNA序列，差異表達(dá)的基因會全部呈現(xiàn)出來。實(shí)踐證明，這種方法有效，但假陽性率在50%～70%左右，差異條帶在Northern印跡上重現(xiàn)性差，后續(xù)處理也比較復(fù)雜。1994年Ito[2]等對3´端引物進(jìn)行了改進(jìn)，把
4、12條引物改為3條，即T12A、T12C、T12G，使得實(shí)驗(yàn)操作簡化。1995年Ayala[3]等提出了在3´端錨定引物與5´端隨機(jī)引物上皆增加10個(gè)堿基，使得上下游引物Tm值在60℃左右，PCR循環(huán)參數(shù)也改為前5個(gè)循環(huán)采用Liang和Pardee推薦的參數(shù)，即94℃30s，40℃2min,72℃30s。經(jīng)這樣改進(jìn)，顯著地增強(qiáng)了差異條帶的重復(fù)性和敏感性，同時(shí)使得差異條逼帶的克隆十分方便。1996年4月，Liang和Pardee[4]對5´端此物進(jìn)行了改進(jìn)，引物條數(shù)改為8條，皆帶上HindⅢ酶
5、切位點(diǎn)，每條由13個(gè)堿基組成，3´端錨定引物采用3條，也帶上HindⅢ酶切位點(diǎn)，每條由18個(gè)堿基組成，PCR循環(huán)條件仍采用94℃30s,40℃2min,72℃830s,40個(gè)循環(huán)，最后在72℃延伸7min。1998年[5]我們在Liang和Pardee改進(jìn)的基礎(chǔ)上，對PCR循環(huán)參數(shù)進(jìn)行了改進(jìn)，即前5個(gè)循環(huán)采用94℃30s,40℃2min,72℃30s,后35個(gè)循環(huán)采用94℃30s,55℃2min,72℃30s，最后在72℃延伸7min。經(jīng)這樣改進(jìn)，既保持了擴(kuò)增效率，又增強(qiáng)了差異條帶的特異性及重復(fù)性，降低了假陽性率。
6、 總之，mRNA差異展示具有簡便、快速、所需起始材料少、同時(shí)可在多個(gè)材料之間或不同處理材料之間進(jìn)行比較等優(yōu)點(diǎn)，但具有較高頻率的假陽性和短小的差異片段的缺點(diǎn)，給后續(xù)處理帶來一系列問題，雖然此技術(shù)經(jīng)過了一些起改進(jìn)，但這兩個(gè)缺點(diǎn)仍限制著此方法的充分應(yīng)用。 二、代表性差示分析 代表性差示分析（representationaldifference8analysis,RDA）最早由Lisitsyn等提出的。1994年，Hubank和Schatz[6]將其應(yīng)用于克隆差異表達(dá)基因，其基本原理是：靶方（Tester,T）和驅(qū)動方（Driv
7、er,D）的cDNA在進(jìn)行差方式分析前均用一種識別4堿基序列的限制酶作切割處理，形成平均長度為256bp的cDNA片段代表群，第一次T與D雜交反應(yīng)時(shí)，兩者總量比為1：100，第二次增加到1：400，第三次增加到1：8000，再利用PCR以指數(shù)形式擴(kuò)增雙鏈模板，而僅以線性形式擴(kuò)增單鏈模板這一特性，通過降低cDNA群體復(fù)雜度和多次更換cDNA兩端接頭，來特異擴(kuò)增目的基因片段。特別是T減D雜交反應(yīng)后僅設(shè)置了72℃復(fù)性與延伸及95℃變性這兩個(gè)循環(huán)參數(shù)，共20個(gè)循環(huán)，從而使PCR產(chǎn)物特異性大大提高。此技術(shù)最大的優(yōu)勢是差異條帶在North
8、ern印跡上重現(xiàn)性好，假陽性少。缺點(diǎn)是所需起始材料較多，更多信賴于PCR技術(shù)，T與D之間若存在較多差異，或T中存在某些基因上調(diào)表達(dá)，則難達(dá)到預(yù)期目的，而且工作量比DDRT-PCR大，周期長?！ ∪?、抑制性扣除雜交 抑制性扣除雜交（suppressionsubtractive
