同時(shí)檢測(cè)美洲型及歐洲型豬繁殖與呼吸綜合征病毒多重rt-pcr方法的建立與應(yīng)用

同時(shí)檢測(cè)美洲型及歐洲型豬繁殖與呼吸綜合征病毒多重rt-pcr方法的建立與應(yīng)用

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1、廣西大學(xué)碩士學(xué)位論文同時(shí)檢測(cè)美洲型及歐洲型豬繁殖與呼吸綜合征病毒多重RT--PCR方法的建立與應(yīng)用姓名:趙日浪申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):臨床獸醫(yī)學(xué)指導(dǎo)教師:鐘誠(chéng)20120628同時(shí)檢測(cè)美洲型及歐洲型豬繁殖與呼吸綜合征病毒多重RT-PCR方法的建立與應(yīng)用’摘要為了建立豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)的快速鑒別檢測(cè)方法,本研究針對(duì)PRRSV的基因序列設(shè)計(jì)并合成3對(duì)特異性引物,分別為CO—ORF7、EU-ORF5和AM-Nsp2:利用CO.ORF7擴(kuò)增美洲型和歐洲型毒株ORF7基因433bp/398bp片段;利用AM—Ns

2、p2擴(kuò)增美洲型經(jīng)典毒株和變異毒株Nsp2基因338bp/248bp片段;利用EU—ORF5擴(kuò)增歐洲型毒株ORF5基因614bp片段。經(jīng)過(guò)反應(yīng)條件的優(yōu)化,成功建立了能同時(shí)檢測(cè)并區(qū)分美洲型經(jīng)典毒株、高致病性變異毒株以及歐洲型毒株的多重RT-PCR檢測(cè)方法。該方法可以特異擴(kuò)增PRRSV對(duì)應(yīng)的基因片段,而與豬瘟病毒(CSFV)、豬口蹄疫病毒(F加V)、豬偽狂犬病病毒(PRV)、豬細(xì)小病毒(PPV)、豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)均無(wú)交叉反應(yīng);對(duì)重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的檢出下限為1.67×103拷貝/此;在相同條件下進(jìn)行的重復(fù)試驗(yàn)可獲得均勻

3、一致的結(jié)果。應(yīng)用檢測(cè)PRRSV的多重RT-PCR方法對(duì)臨床采集的176份疑似病料進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果PRRSV陽(yáng)性45份,其中美洲型變異毒株41份、經(jīng)典毒株4份,未檢測(cè)到歐洲型毒株。針對(duì)臨床上PRRSV和CSFV混合感染時(shí)有發(fā)生的情況,為建立能同時(shí)檢測(cè)CSFV和PRRSV的方法,針對(duì)CSFV和PRRSV的基因序列設(shè)計(jì)3對(duì)特異性引物,即CSF-NS2、AM-Nsp2、EU-ORF5。其中,CSF-NS2擴(kuò)增CSF毒株NS2基因508bp片段,AM-Nsp2擴(kuò)增PRRS美洲型經(jīng)典毒株和變異毒株Nsp2基因338bp/248bp片

4、段,EU-ORF5擴(kuò)增PRRS歐洲型毒株ORF5基因614bp片段。經(jīng)過(guò)反應(yīng)條件的優(yōu)化,建立了能同時(shí)檢測(cè)并區(qū)分CSF毒株和PRRS美洲型經(jīng)典毒株、變異毒株及歐洲型毒株的多重RT-PCR方法。該方法可以特異擴(kuò)增CSFV和PRRSV,而與FMDV、PRV、PPV、PCV2均無(wú)交叉反應(yīng);對(duì)CSFV和PRRSV4種重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的檢出下限均為1.67x103拷貝/止。應(yīng)用該方法對(duì)采集的106份臨床疑似病料進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果CSFV和PRRSV變異株混合陽(yáng)性4份,占3.77%(4/106);CSFV陽(yáng)性7份,占6.60%(7/106

5、);PRRSV變異株陽(yáng)性17份,占16.04%(17/106)。本研究成功建立了的兩種檢測(cè)PRRSV的多重RT-PCR方法,一是同時(shí)檢測(cè)美洲型及歐洲型PRRSV的多重RT-PCR方法,二是同時(shí)檢測(cè)CSFV及美洲型、歐洲型PRRSV的多重RT-PCR方法,為PRRSV和CSFV的臨床快速鑒別檢測(cè)和流行病學(xué)調(diào)查提供了有效的技術(shù)平臺(tái)。關(guān)鍵詞:豬繁殖與呼吸綜合征病毒;美洲型毒株;歐洲型毒株;豬瘟病毒;多重RT-PCR;檢測(cè)方法EstablishmentandapplicationofamultiplexRT-PCRassayf

6、orsimultaneousdetectionoftheNorthAmericangenotypeandtheEuropeangenotypeofporcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus(PRRSV)ABSTRACTAbstract:InordertoestablishoneassaytosimultaneousanddifferentialdetectionoftheNorthAmerican(NA)genotypeandtheEuropean(E∽genotype

7、ofporcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus(PRRSV),threepairsofspecificprimersweredesigned.neywerenamedasCO—ORF7,EU-ORF5andAM-Nsp2,respectively,ofwhichCO—ORF7specificallyamplified433bp/398bpORF7genefragmentoftheNAgenotypeandtheEUgenotype,AM-Nsp2specifically

8、amplified338bpor248bpNsp2genefragmentoftheclassicalstrainorthehighlypathogenic(uP)variantoftheNAgenotype,andEU—ORF5specificallyamplified614bpORF5genefragmentoftheEUge

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