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《大鰭鳠(mystus macropterus bleeker)遺傳多樣性及其線粒體控制區(qū)結(jié)構(gòu)的研究》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、西南大學(xué)碩士學(xué)位論文大鰭鳠(MystusmacropterusBleeker)遺傳多樣性及其線粒體控制區(qū)結(jié)構(gòu)的研究姓名:周麗申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):水生生物學(xué)指導(dǎo)教師:魏剛20080501西南大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要大鰭鯪(坳s徹s擾以c唧紀(jì),跖sBleeker)遺傳多樣性及其線粒體控制區(qū)結(jié)構(gòu)的研究水生生物學(xué)專業(yè)碩士研究生周麗指導(dǎo)教師魏剛教授摘要大鰭鯪(岣眄觚研口cn節(jié)紀(jì)ⅢsBleeker),屬鯰形目(Silurifi)n粥s)鱗科(Ba鰣d∽)鱧屬(朋如船&印矗)。分布于長(zhǎng)江和珠江水系,為我國(guó)特有經(jīng)濟(jì)魚類,具有肉質(zhì)細(xì)嫩、骨刺少、
2、味道鮮美、經(jīng)濟(jì)價(jià)值高的優(yōu)點(diǎn)。目前,對(duì)大鰭鰉的研究主要集中在形態(tài)學(xué)、繁殖生物學(xué)、池塘馴化、養(yǎng)殖技術(shù)以及能量學(xué)上的研究,對(duì)其種質(zhì)資源狀況、遺傳多樣性現(xiàn)狀和線粒體控制區(qū)結(jié)構(gòu)方面的研究還比較薄弱。近年來(lái),由于長(zhǎng)江干流大型水電樞紐工程,如葛洲壩、三峽大壩等的建成,引起了許多學(xué)者對(duì)三峽庫(kù)區(qū)魚類種質(zhì)資源狀況的研究,但是對(duì)大鰭鱧的研究甚少,大壩的建成可能造成其生活環(huán)境的改變、產(chǎn)卵場(chǎng)地的破壞以及生殖隔離的產(chǎn)生,這些是否使大鰭鯪遺傳結(jié)構(gòu)及多樣性現(xiàn)狀也受到了一定的影響是一個(gè)值得深入研究探討的阿題。因此。從E唾‘A分子水平對(duì)大鰭鯪種群遺傳結(jié)構(gòu)及基因多
3、樣性狀況進(jìn)行研究是很有必要的。.本文采用黜廿D分子標(biāo)記方法對(duì)長(zhǎng)江流域(合川、廣元、岳陽(yáng)和金口)四個(gè)不同江段采集的野生大鰭鯪遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)方面進(jìn)行研究。研究表明:從l6條引物產(chǎn)生的譜帶中,總共獲得l39個(gè)位點(diǎn),多態(tài)位點(diǎn)101個(gè),多態(tài)位點(diǎn)百分率為72.66%。具體到每一群體,其多態(tài)位點(diǎn)比率為23.74%一39.57%,可見(jiàn)每一群體內(nèi)的多態(tài)位點(diǎn)比率低于4個(gè)群體整體的多態(tài)位點(diǎn)比率:大鰭鯪群體內(nèi)遺傳多樣性指數(shù)分別為:2.2237、1.9689、1.9356、1.0770,即岳陽(yáng)群體最大,金口群體次之,合川群體再次之,廣元群體最
4、?。黄銷ei比Shannon估算的大鰭鯪群體的遺傳變異指數(shù)低,但其遺傳變異分布趨勢(shì)基本上是一致的,即YY>JK>HC>GY(岳陽(yáng)>金口>合川>廣元),這一結(jié)果顯示了4個(gè)群體遺傳多樣性及地理分布的差異狀況,岳陽(yáng)江段處于長(zhǎng)江中游,上下游群體間基因交流頻繁,且岳陽(yáng)江段又與洞庭湖等湖泊相連,使得該處的大鰭鱧群體內(nèi)交流機(jī)率較其他流域高出許多,而廣元位于長(zhǎng)江上游的支流,群體間的基因交流較少,故其多樣性指標(biāo)較低;大鰭鰉四個(gè)群體遺傳相似度和遺傳距離研究表明:大鰭鯪群體間的遺傳相似度的變化范圍為:O.7490~O.9678,岳陽(yáng)群體和廣元群體遺
5、傳相似度最低為O.7490,岳陽(yáng)群體和金硼南人學(xué)碩士學(xué)位論文摘要口群體相似度最高為0.9678;同時(shí),岳陽(yáng)群體和金口群體的遺傳距離最小,廣元群體和岳陽(yáng)群體的遺傳距離最大,分別為O.10l5和O.2890,這與UPGMA聚類圖顯示的結(jié)果一致,金口群體和岳陽(yáng)群體首先聚類,然后聚類的是合川群體和廣元群體,最后,這兩個(gè)類群再聚類;遺傳分化系數(shù)Gst為O.4053,即40.53%的遺傳分化發(fā)生在群體之問(wèn),有59.47%的遺傳分化發(fā)生在群體內(nèi)。本文還對(duì)大鰭鯪線粒體控制區(qū)序列進(jìn)行了擴(kuò)增,通過(guò)與已發(fā)表的長(zhǎng)吻鮑(三哦黝讎?yán)獺酊rosf7由)、
6、圓尾擬鱗(n例如6qg,姍f繃“豇)和光澤黃顙(,鋤∞6口gr淞一坷d婦)IIIDNA控制區(qū)序列進(jìn)行比較分析,發(fā)現(xiàn)大鰭鯪線粒體控制區(qū)序列有A、T含量高,G含量低的特點(diǎn)。同時(shí),大鰭鯪線粒體控制區(qū)包括三個(gè)主要識(shí)別區(qū)域:擴(kuò)展終止相關(guān)序列(ext∞ded僦lIli豫l嬲s0Iciated∞quenceETA。S)、中央保守序列(Cer昀lc∞鯽Ⅳed∞queIlceblock)、保守序列(C伽sc:ryed∞que眥eblock)。其E,rAS序列為:TAC舶A1’GT‘X丑唧1炎rAGT;中央保守序列中的CSB.F的序列為:A1’G
7、,rAGTAAGAAACCAccAACCCTCA盯,CsB-E序列為:AGl3(ⅪA閹隊(duì)舶隗G,rGGGG,在鱗科魚類中的普遍序列為:AGGGCAA-.A工GT(jGGG,含有GT(ⅪG.box的穩(wěn)定結(jié)構(gòu),CSB.D的序列為:W盯rAC礎(chǔ)ATCTGGl]陀饑A:保守序列中CSB.1的序列為:觚瑚rAA:r(托ArGl]陌rA觚AAC悶rA,CSB.2序列較易識(shí)趴,為TAAACCCCC饑ACCCCC,CSB.3為:TI珊AACCC∞AAACCAG。大鰭鰻在不同的種屬問(wèn)存在大致相同的保守區(qū)段:既AS結(jié)構(gòu)、CS&D、CSB.F、CS
8、B-E、GrC曬G勘x結(jié)構(gòu),CSB.1、CSB.2、CsB.3,其中CsB-D和GrGGGjbox結(jié)構(gòu)很保守,而CSB.F、CSB.E、CSB-2、CSB一3存在個(gè)別堿基的變異。關(guān)鍵詞:大鰭鯪隊(duì)PD遺傳多樣性線粒體控制區(qū)Il兩南人學(xué)碩十學(xué)位論文AbstractStudieso