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《雙孢蘑菇ssr標記的開發(fā)及其在遺傳育種分析中的應用》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內容在學術論文-天天文庫。
1、碩士學位論文萬方數據密級雙孢蘑菇SSR標記的開發(fā)及其在遺傳育種分析中的應用指導老師鎣為踢單位地址浙江省壅抖隨申請學位類別理堂亟±專業(yè)植物堂論文提交時間論文答辯時間2014．3．262014．5．19學位授予單位和日期逝江!』巫范太堂2Q!壘：魚答辯委員會主席陳明態(tài)硒究員論文評閱人萬方數據DissertationforMasterDevelopmentandApplicationofSSRMarkersinAgaricusbisporusCandidate：Supervisor：Discipline：BotanyCollegeof
2、ChemistryandLifeScience，ZhejiangNormalUniversity,Jinhua321004，Zhejiang，ChinaMarch2014萬方數據摘要雙孢蘑菇中SSR標記的開發(fā)及其在遺傳育種分析中的應用應用MISA軟件分析了雙孢蘑菇基因組SSR位點組成，其中單核苷重復基序為主導類型，占總SSR的52．9％；其次是三、二核苷酸重復基序，其出現頻率分別為34．3％和11．4％。A／T、AG／CT、AAC／GTT分別是單、二、三核苷酸的主要重復基序。采用Primer5．0軟件設計引物，共設計有效擴增SS
3、R引物112對，經篩選，其中97對在8份雙孢蘑菇基因組中擴增如條帶，25對表現出多態(tài)性，進一步研究表明共檢測到67個等位基因，平均每個位點2．68個，平均Nei’S基因多樣性指數為0．5023。8份雙孢蘑菇品種的遺傳相似系數變化范圍為0．3363～0．8641，平均值為0．5385；基于Nei’S遺傳相似系數的UPGMA聚類分析，在遺傳距離O．46處，8個雙孢蘑菇品種(系)分為2個類群，親緣關系的遠近與其種質來源有一定的相關性。在單孢分離子代的遺傳分析中，有19對引物在單孢分離子代中遵循孟德爾自由分離定律。通過對溶壁酶組成及濃度
4、、滲透壓穩(wěn)定劑、菌絲培養(yǎng)方法等研究，建立了有效的雙孢蘑菇原生質體制備與再生系統(tǒng)。實驗利用濃度為1．5％溶壁酶，0．6MKC作為滲透壓穩(wěn)定劑，25℃酶解3．4小時，原生質體量可達106／ml。純化后的原生質體選擇0．6M蔗糖作為滲透壓穩(wěn)定劑，PDMA培養(yǎng)基中25℃培養(yǎng)約10天原生質體可再生。以多態(tài)性良好的SSR引物作為鑒定同核原生質體主要標記，完成了對4株雙孢蘑菇同核體的鑒定。論文最后利用生物信息學的手段挖掘分析了雙孢蘑菇和其四孢亞種間的SNP和SV的差異。本研究對這些潛在的多態(tài)性SSR的開發(fā)為雙孢蘑菇遺傳多樣性分析、圖譜構建提供
5、了更豐富的候選分子標記基礎，為進一步進行雙孢蘑菇新品種的選育和種質資源的分析評價及管理提供了遺傳依據。關鍵詞：雙孢蘑菇：微衛(wèi)星；單孢分離子代群體；遺傳多樣性；同核原生質體；SNP：SV萬方數據摘要DevelopmentandApplicationofSSRMarkersinAgaricus’DtsporusABSTRACTAMISAsearchrevealedsimplesequencerepeats(SSRs)basedonthegenomesofAgaricusb／sp0172S．Among，singlenucleotide
6、type(52．9％)isthemostabundant，followedbytri-(34．3％)，di一(11．4％)．Themostabundantmono-nucleotide，di．nuclotideandtri-nucleotiderepeatswereA／T、AG／CT、AAC／GTT．Atotalof12primerpairsweresuccessfullydesignedbyPrimer5．0，ofwhich97primersproducedbandsand25primerpairsshowedpolymorp
7、hismin8A．bisporusgenotypes．Furtherstudyshowedthat67allelesweredetectedwiththeaverageof2．68．TheaverageofNei’Sgeneticdiversityindex(H)Was0．5023．Thegeneticsimilaritycoefficientrangedfrom0．3363to0．8641withaaverageof0．5385．TheUPGMAclusteranalysisbasedonSSRdatashowedthatth
8、eseparentallinescouldbeclassifiedintotwogroupsatthethresholdof0．46，whichWassomerelatedtotheirpedigreeanalysis．19primerpairsfollowed
