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《合浦珠母貝α-淀粉酶基因結(jié)構(gòu)、snp篩選、生長(zhǎng)關(guān)聯(lián)與生態(tài)響應(yīng)研究》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、學(xué)校代碼：10264研究生學(xué)號(hào)：M100101096上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文合浦珠母貝α-淀粉酶基因結(jié)構(gòu)、SNP題目：篩選、生長(zhǎng)關(guān)聯(lián)與生態(tài)響應(yīng)研究Genomicstructure,SNPscreening,growthassociationandecologicalresponseof英文題目：α-amylasegeneinthepearloysterPinctadafucata專業(yè)：水產(chǎn)養(yǎng)殖研究領(lǐng)域：海水珍珠貝生物技術(shù)姓名：李璐指導(dǎo)教師：喻達(dá)輝研究員上海海洋大學(xué)，上海，201306中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)研究所，廣州，510300二O一三年六月Genomics
2、tructure,SNPscreening,growthassociationandecologicalresponseofα-amylasegeneinthepearloysterPinctadafucataADissertationSubmittedByLuLiFortheDegreeofMasterofAgronomySupervisor:ProfessorDahuiYuSpeciality:AquacultureShanghaiOceanUniversity,Shanghai201306,P.R.ChinaSouthChinaSeaFisheriesRes
3、earchInstitute,CAFSGuangzhou510300,P.R.ChinaJune,2013上海海洋大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：我恪守學(xué)術(shù)道德，崇尚嚴(yán)謹(jǐn)學(xué)風(fēng)。所呈交的學(xué)位論文，是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下，獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)明確注明和引用的內(nèi)容外，本論文不包含任何其他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫(xiě)過(guò)的作品及成果的內(nèi)容。論文為本人親自撰寫(xiě)，我對(duì)所寫(xiě)的內(nèi)容負(fù)責(zé)，并完全意識(shí)到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者簽名：日期：年月日上海海洋大學(xué)學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書(shū)學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，同意學(xué)校保留并向國(guó)家有
4、關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版，允許論文被查閱或借閱。本人授權(quán)上海水產(chǎn)大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密□，在年解密后適用本版權(quán)書(shū)。本學(xué)位論文屬于不保密□學(xué)位論文作者簽名：指導(dǎo)教師簽名：日期：年月日日期：年月日上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文答辯委員會(huì)成員名單姓名工作單位職稱備注施志儀上海海洋大學(xué)教授主席白俊杰珠江水產(chǎn)研究所研究員委員鄒記興華南農(nóng)業(yè)大學(xué)教授委員黃桂菊南海水產(chǎn)研究所副研究員秘書(shū)答辯地點(diǎn)南海水產(chǎn)研究所答辯日期2013.5.24上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文合浦珠母貝α-淀粉酶
5、基因結(jié)構(gòu)、SNP篩選、生長(zhǎng)關(guān)聯(lián)與生態(tài)響應(yīng)研究摘要合浦珠母貝（Pinctadafucata）是重要的海水養(yǎng)殖貝類和生產(chǎn)珍珠的主要母貝。然而與脊椎動(dòng)物不同的是，貝類等無(wú)脊椎動(dòng)物的生長(zhǎng)機(jī)制仍不清楚，至今仍未克隆到與脊椎動(dòng)物生長(zhǎng)激素類似的基因。消化酶是重要的代謝酶類，而淀粉酶（amylase）是植食性動(dòng)物的重要消化酶，在以藻類為餌料的貝類碳水化合物代謝中起重要作用，對(duì)貝類生長(zhǎng)具有重要影響。本研究克隆了合浦珠母貝α-淀粉酶基因全長(zhǎng)，分析了其基因結(jié)構(gòu)及組織表達(dá)模式；采用直接測(cè)序法篩選了基因SNP多態(tài)位點(diǎn)并將其與生長(zhǎng)性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析；運(yùn)用熒光定量方法檢測(cè)了基因表達(dá)水平對(duì)不同養(yǎng)
6、殖生態(tài)因子及貝齡的應(yīng)答，以期為探討貝類生長(zhǎng)的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ)。研究結(jié)果如下：1、獲得α-淀粉酶基因的cDNA全長(zhǎng)、基因組結(jié)構(gòu)及其組織表達(dá)特征。采用RT-PCR和cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)克隆獲得了1704bp的α-淀粉酶cDNA全長(zhǎng)（GenBank登錄號(hào)：JX683681），其中5’UTR長(zhǎng)17bp，3’UTR長(zhǎng)118bp，開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)1569bp，編碼由522個(gè)氨基酸組成的多肽。SignalP4.0軟件分析表明，該多肽具有20個(gè)氨基酸組成的信號(hào)肽。多重序列比對(duì)顯示,合浦珠母貝α-淀粉酶與大珠母貝α-淀粉酶的序列一致性最高（91.6%）；系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)顯示其與大珠母貝親
7、緣關(guān)系最近。在cDNA序列基礎(chǔ)上，利用常規(guī)PCR方法及染色體步移技術(shù)克隆獲得了10850bp的基因組DNA序列（GenBank登錄號(hào)：JX683680），其中包括9個(gè)外顯子，8個(gè)內(nèi)含子和3932bp的啟動(dòng)子，啟動(dòng)子區(qū)域存在典型的轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列GATA-1，AP-1和SP1等。采用熒光定量RT-PCR技術(shù)分析α-淀粉酶的組織表達(dá)特征，發(fā)現(xiàn)其在消化腺、腸、性腺、腮、肌肉、外套膜均有表達(dá)，其中消化腺當(dāng)中表達(dá)量最高，并與其它組織差異極顯著（P<0.001）。2、SNP篩選及其與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析。對(duì)α-淀粉酶基因進(jìn)行分段擴(kuò)增，采用直接測(cè)序法，共獲得候選SNP（singlen
8、ucleo
