甘藍(lán)mlpk基因的克隆與序列分析

甘藍(lán)mlpk基因的克隆與序列分析

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1、第32卷第1期作 物 學(xué) 報(bào)Vol132,No112006年1月 46~50頁ACTAAGRONOMICASINICApp146-50Jan1,2006甘藍(lán)MLPK基因的克隆與序列分析11,2,32,X趙永斌 朱利泉 王小佳(12西南大學(xué)農(nóng)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院;重慶市蔬菜學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,重慶400716)摘 要:采用PCR、RT2PCR以及其他分子生物學(xué)方法,以甘藍(lán)基因組DNA和柱頭cDNA為模板對(duì)MLPK基因進(jìn)行擴(kuò)增克隆,首次得到長度分別為1615bp和1294bp的基因片段。序列分析表明,甘藍(lán)MLPK與蕪菁MLPK的cDNA序列相似性達(dá)98%,前者的內(nèi)含子數(shù)為4個(gè),比

2、后者少了3個(gè);同時(shí),在前者內(nèi)含子中發(fā)現(xiàn)了不同于典型的GU2AG規(guī)則的新的序列,即第3、4個(gè)內(nèi)含子5′端堿基是TA、CG,3′端堿基為CAGG、GT,推測(cè)甘藍(lán)MLPK的mRNA具有獨(dú)特的剪切機(jī)制。這為甘藍(lán)自交不親和分子機(jī)理研究提供了新內(nèi)容。關(guān)鍵詞:自交不親和;信號(hào)傳導(dǎo);MLPK基因;內(nèi)含子;剪切中圖分類號(hào):Q51CloningandSequencesAnalysisofMLocusProteinKinaseGenefromBrassicaoleracea11,2,32,3ZHAOYong2Bin,ZHULi2QuanandWANGXiao2Jia(CollegeofA

3、gronomyandLifeScience,SouthwestUniversity,ChongqingKeyLaboratoryofOlericulture,Chongqing400716,China)Abstract:TheDNAandcDNAfragmentsofMlocusencodingproteinkinasewereinitiallyamplifiedfromgenomicDNAandstigmacDNAinBrassicaoleraceabyusingPCR,RT2PCRandothermolecularmethods.Theirlengthswere

4、1615bpand1294bprespectively.Forthefirsttime,sequenceanalysisindicatedthattherewas98%identityofMLPKcDNAbetweenBrassicaoleraceaandBrassicarapa.InBrassicaoleracea,theMLPKgenecontainedfourintrons,whichwerethreeintronslessthanthoseinBrassicarapa.Moreover,intwoendsofintronsofMLPKgenefromBras

5、sicaoleracea,therewerenewbasesequenceswhichdidn’tcomplywithtypicalGU2AGrule:TAandCGexistedinthe5′endofthethirdandthefourthintronofMLPKgene;CAGGandGTwerefoundrespectivelyinthe3′endofthesequences.Sowespeculatedthatthesenewbasesequencesmayhaverelationtoanewspliceprocess.Theseresultsprovid

6、edsomenewinsightintothemolecularmechanismofself2incompatibilityinBrassicaoleracea.Keywords:Self2incompatibility;Signaltransduction;MLPKgene;Intron;Splice  蕓薹屬植物中普遍存在著一個(gè)以S2locus基因的突變體的研究中發(fā)現(xiàn),自交不親和信號(hào)傳導(dǎo)途徑介導(dǎo)的自交不親和(Self2Incompatibility,SI)信號(hào)傳導(dǎo)還受M2locus基因的調(diào)控,該基因同S2locus基因類途徑,在S多基因家族中,包含SLG(S2

7、locus似,但獨(dú)立于后者,只在柱頭中表達(dá),編碼一個(gè)膜錨[1]glycoprotein)、雌性決定基因SRK(Slocusreceptor定磷酸化蛋白———M位點(diǎn)蛋白激酶(Mlocusprotein[2][6]kinase)及雄性決定基因SCR(S2locuscystein2richkinase,MLPK)。目前對(duì)MLPK的研究,只限于蕪[3]protein)PSP11(S2locusprotein11),當(dāng)具有相同單倍菁中,鑒于此種情況,還不能明確MLPK在SI信號(hào)型時(shí),來自花粉中的半胱氨酸富含蛋白SCRPSP11與傳導(dǎo)途徑中的作用,因此還有必要對(duì)其他蕓薹屬植

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