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1、山西大學(xué)2013屆碩士學(xué)位論文棗樹(shù)eDNA文庫(kù)EST序列的生物信息學(xué)分析作者姓名指導(dǎo)教師學(xué)科專業(yè)研究方向培養(yǎng)單位學(xué)習(xí)年限戎宏立曹秋芬研究員作物遺傳育種植物分子生物學(xué)生物工程學(xué)院2010年9月至2013年6月二。一三年六月ThesisforMaster’Sdegree，ShanxiUniversity,2013BioinformaticsanalysisofESTfromcDNAliabraryofZiziphusjujubaStudentNameSupervisorMaiorSpecialt7DepartmentResearchDurationHong．1iRo
2、ngProf．Qiu．fenCao，1／’●●—一●●乙roptienetlcsandBreedlngPlantMolecularBiologyInstituteofBio．engineering2010．09—2013．06June，2013目錄煳嬲1．2．5基因本體論(geneontology)概述??????????????．8第二章棗樹(shù)eDNA文庫(kù)的篩選與EST的功能注釋?????????????103．2研究方法???????????????????????????233．2．1EST-SSR的查找?????????????????????．．233．
3、2．2數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)????????????????????????．．243．3結(jié)果與分析??????????????????????????243．3．1棗樹(shù)EST中SSR的總體特點(diǎn)與發(fā)生頻率???????????243．3．2棗樹(shù)EST-SSR的特征???????????????????．253．4討論??????????????????????????????27第四章棗樹(shù)核糖體蛋白的生物信息學(xué)分析???????????????一294．1研究材料???????????????????????????294．2研究方法?????????????????????
4、??????294．3結(jié)果與分析??????????????????????????294．3．1核糖體蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析????????????????一304．3．2核糖體蛋白的潛在磷酸化位點(diǎn)分析?????????????．．314。3．3核糖體蛋白的疏水性／親水性分析??????????????。324．3．4核糖體蛋白的進(jìn)化關(guān)系及亞細(xì)胞定位????????????．．384。4討論??????????????????????????????????????．40第五章棗樹(shù)親環(huán)素蛋白的生物信息學(xué)分析???????????????．．425．1親環(huán)素研究概況
5、????????????????????????425．1．1植物親環(huán)素的存在和發(fā)現(xiàn)過(guò)程???????????????一425．1．2親環(huán)素的功能??????????????????????．．425．2研究材料與方法????????????????????????425．2．1研究材料????????????????????????～425．2．2研究方法????????????????????????．．435．3結(jié)果與分析??????????????????????????435．3．1棗親環(huán)素的序列分析???????????????????一435．3．
6、2不同植物親環(huán)素基因編碼區(qū)的多重比較???????????．．445．3．3不同植物親環(huán)素蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)?????????????～455．3．4棗樹(shù)親環(huán)素蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)????????????????一455．3．5親環(huán)蛋白的疏水性／親水性分析???????????????．465．3．6親環(huán)蛋白的潛在磷酸化位點(diǎn)????????????????一465。3．7棗樹(shù)親環(huán)素蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)??????????????一475．3．8棗樹(shù)親環(huán)素蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域、信號(hào)肽和亞細(xì)胞定位?????．．485．3．9棗親環(huán)素蛋白的功能結(jié)構(gòu)域分析??????????????
7、．．495．4討論??????????????????????????????????????．49參考文獻(xiàn)??????????????????????????????．51攻讀學(xué)位期間取得的研究成果?????????????????????56致謝???????????????????????????????57個(gè)人簡(jiǎn)況及聯(lián)系方式?????????????????????????58承諾書(shū)?????????????????????????????59學(xué)位論文使用授權(quán)聲明????????????????????????60ContentsChineseAbstr
8、act?????????
