番鴨呼腸孤病毒感染的分子致病機(jī)制的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

番鴨呼腸孤病毒感染的分子致病機(jī)制的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

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1、^?"-,IP.i.1/./-.959V..9;#學(xué)校編號(hào)10394圖書分類號(hào)Q學(xué)號(hào)B2011110密級(jí)公開^@巧走巧狂乂#\全日制學(xué)術(shù)學(xué)位研究生博±學(xué)位論文番鴨呼腸孤病毒感染的分子致病機(jī)制的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究TranscritomicsanalsisofthemolecularpypathoenicmechanismofMuscovduckgyreovirusinfection王全溪‘.'朵、學(xué)科專業(yè);動(dòng)物學(xué)研究方向;宿主與病原

2、的互作指導(dǎo)教師;張彥定教授f.^申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博±研究生論文提交日期:2015年12月8日論文評(píng)閱人:直室論文答辯日期:2015年11月30日答辯委員會(huì)主席一帆教授:黃學(xué)位授予單位:福建師范大學(xué)學(xué)位授予日期:2015年12月19日"*-2015年12月界\:蘭餐1%\公—4'.?.?t,fl挙巧編馬10394圖書分類號(hào)0959.9學(xué)與R2m"in密級(jí)么開@巧走巧必火學(xué)全日制學(xué)術(shù)學(xué)位研究生博±學(xué)位論文番鴨呼腸孤病毒感染的分子致病機(jī)制的轉(zhuǎn)錄

3、組學(xué)研究TranscritomicsanalsisofthemolecularpyathoenicmechanismofMuscovyduckpgreovirusinfection王全溪學(xué)科專業(yè):動(dòng)物學(xué)研究方向:宿主與病原的互作指導(dǎo)教師;張彥定教授申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博壬研究生論文提交日期:2015年12月8日論文評(píng)閱人:論文答辯日期:2015年n月30日答辯委員會(huì)主席一帆教榜:黃學(xué)位授予單位:福建師范大學(xué)學(xué)位授予日期15年12月19日:202015年12

4、月中文摘要中文摘要番鴨呼腸孤病毒(Muscovyduckreovims,MDRV)是近10年來發(fā)現(xiàn)的引起維番鴨較高發(fā)病率和死亡率的病毒。肝臟和脾臟是MDRV感染的主要範(fàn)器官。為探討,本研究W肝臟和脾臟為主要研究對(duì)象MDRV感染的分子致病機(jī)制,應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法,對(duì)10日齡番鴨轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序、組裝和注釋;篩選和分析了MDRV感染后肝臟和脾臟的差異表達(dá)基因,并對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行了功能分析;最后對(duì)MDRV感染激活機(jī)體先天性免疫功能,誘導(dǎo)細(xì)胞調(diào)亡的分子機(jī)制和導(dǎo)致肝臟脂肪變性的分子機(jī)制進(jìn)行了分析和驗(yàn)證。研

5、究結(jié)果闡明了MDRV感染的分子致病機(jī)理,主要結(jié)果如下:1.本研究得到總長(zhǎng)度17G的轉(zhuǎn)錄組序列,組裝得到65,535個(gè)Unigenes,平均長(zhǎng)度%7bp;COG注釋共獲得41,651個(gè)Unigenes的注釋,包含25個(gè)生物學(xué)功能。2.MDRV感染5日齡維番鴨后第5天,差異表達(dá)基因篩選發(fā)現(xiàn),脾臟有1,352個(gè)基因表達(dá)量上調(diào),4,906個(gè)基因表達(dá)量下調(diào);GO顯著性富集分析表明,這些基因共參與了48?jìng)€(gè)生物學(xué)功能,KEGG顯著性富集229個(gè)Pathw巧。31.差異表達(dá)基因篩選發(fā)現(xiàn)巧臟有4190個(gè)基因表達(dá)量上調(diào)

6、,113個(gè)基因下調(diào)。,,GO顯著性富集分析表明,這些基因共參與了48?jìng)€(gè)生物學(xué)功能,KEGG顯著性富集237個(gè)Pathw巧。4.MDRV感染肝臟和脾臟差異基因的比較分析發(fā)現(xiàn),脾臟的差異表達(dá)基因W下調(diào)為主,350,GO功能,肝臟W上調(diào)為主兩個(gè)器官的共有差異表達(dá)基因1,個(gè)分析表明,送些共有差異表達(dá)基因參與了42個(gè)生物學(xué)功能,KEGG功能分析表明,共有差異表達(dá)基因涉及的免疫功能的有炎癥因子,先天性免疫功能,抗原提呈過程等。共有差異表達(dá)基因的獲得將為進(jìn)一步闡明MDRV感染的致病機(jī)理提供了有力的依據(jù)。5MD

7、RV感染上調(diào)了脾臟中模式識(shí)別受體RIG-A.KEGG分析表明,,I,MD5,TLR---1,TLR2,TLR4的表達(dá)來識(shí)別MDRV,活化IRF7促進(jìn)I型IFN的分泌和調(diào)-JAK-STAT信號(hào)節(jié)NF成信號(hào)通路促進(jìn)炎癥因子IL6的分泌,激活,刺激IFN的分-PCR驗(yàn)證泌,增強(qiáng)機(jī)體先天性免疫功能。結(jié)果經(jīng)Q,證實(shí)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)確可靠。6.TUN化法和流式細(xì)胞術(shù)證實(shí),MDRV感染誘導(dǎo)了巧臟細(xì)胞調(diào)亡。KEGG分析as-民P表明,MDRV感染通過激活了F信號(hào)通路,正1信號(hào)通路,抑制了I3K/AKT信號(hào)I中文摘要e

8、stern-通路誘導(dǎo)細(xì)胞調(diào)亡。Wblot和QPCR驗(yàn)證表明。,轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)確可靠><7.MDRV感染肝臟中脂肪酸含量極顯著的増加(/0.01,從而誘導(dǎo)肝臟脂肪)變性。KEGG分析表明,MDRV感染抑制了肝細(xì)

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