全基因組選擇在櫛孔扇貝（chlamys farreri）育種中的應(yīng)用

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1、簿寸財(cái)和々ＯＣｔＡＮｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆｃｈｉｎａ博±學(xué)位論文ＤＯＣＴＯ民ＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮ全基因組選擇在巧孔扇貝（ＣＡ／ａ巧化々ｗＷ）論文巧目：巧種中的應(yīng)用ｓｅｌｅｃｔｉｏｎｉｎｂｒｉｎｏｆＡｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆｅｎｏｍｅｅｅｄｇｇ：Ｚｈｌａｍｓａｒｒｅｒｉ巧文巧目ｉｋｏｎｇ＾ｃｄ＼＼〇ｖ｛Ｃｈｙｆ）作者：＿＿巧導(dǎo)教師：包振民學(xué)位類別：學(xué)術(shù)學(xué)位夸業(yè)名稱：海洋生物學(xué)Ｉ研巧方向：海洋生物遺傳學(xué)Ｉ—打ｊｆｒ

2、：３Ｉ—＊全巧ｔ７ａ／ｗｓｕｍｎ）ｌＡｊ組選巧巧巧孔扇０?。牘枺煞N中的應(yīng)Ｗ謹(jǐn)心又此文獻(xiàn)給我敬愛的導(dǎo)師、親愛的父母和支持我的愛人?。崳姀埦福崳姡玻埃保的辏翟拢崳娚綎|青島全基因細(xì)近巧在巧孔扇＾育種中的應(yīng)用＇全基因組選擇在巧孔扇貝（ＣＡ／ｏ知Ｔｒｍ）育種中的應(yīng)用：學(xué)位論文答辯日期指導(dǎo)教師簽字：答辯委員會(huì)成員簽字；ｙｗ４ｐ４＞全基因巧途擇在巧化扇Ｗ（ＣＷａ＞７〇ａ／ａ；ｒｇｎ）育種中的應(yīng)用獨(dú)創(chuàng)聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研巧工作

3、及取得的研究成果，除了文中特別加標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其。據(jù)我所知他人己經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研巧成果，也不包含未獲得（注＝如沒有其他需要特別聲明的，本欄可空）或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書使用過的材料一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均己在論文中作了明。與我確的說明并表示謝意。＂＾＾＾＊＾＾＾＾＾＾學(xué)位論文作者簽名：＾簽字日期：＾＾年巧＾曰學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書、本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留使用學(xué)位論文的規(guī)定，并同意Ｗ下事項(xiàng)：１、學(xué)校有權(quán)保留并向國(guó)家有關(guān)部口或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印

4、件和磁盤，化許論文被査閱和借閱。２、學(xué)?？桑讓W(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索，可Ｗ＂采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。同時(shí)授權(quán)巧華大學(xué)中＂國(guó)學(xué)術(shù)期刊（光盤版）電子雜志社用于出版和編入ＣＮＫＩ《中國(guó)知識(shí)資源總庫》，授權(quán)中國(guó)科學(xué)技術(shù)信息研究所將本學(xué)位論文收錄到《中國(guó)學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫》。（保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書）：學(xué)位論文作者簽名：導(dǎo)師簽字ｕ曰簽字曰期；興？月＼＾日簽字曰期年ｉ：月／ｙ年ｒ！‘全基兇組選擇在巧孔扇貝（ＣＷｆｌ／ｎ＞ｙ＾／７ｙｎ）育種中

5、的應(yīng)用全基因組選擇在巧孔扇貝（ＣＡ／ａｗｙｓ於ＡｒｅｒＯ育種中的應(yīng)用箱要＇巧孔扇貝（ＣＷｆｌ／ｗｓｒｍ）是我國(guó)重要的海洋水產(chǎn)貝類，具有較高的營(yíng)養(yǎng)＿ｙ＞價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值，借助二代測(cè)序平臺(tái)，。本研巧構(gòu)建了巧孔扇貝連續(xù)Ｈ代選擇群體－ＲＡＤ技術(shù)獲得了大量ＳＮＰ位點(diǎn)采用２ｂ，對(duì)王個(gè)世代進(jìn)行了系統(tǒng)的群體遺傳學(xué)研巧。同時(shí)采用全基因組選擇和全基因組關(guān)聯(lián)分析技術(shù)針對(duì)巧孔扇貝進(jìn)行全基因組育種值估計(jì)．ＱＴＬ精細(xì)定位等。本研巧將為水產(chǎn)養(yǎng)殖尤其是貝類育種方面提供寶貴的經(jīng)驗(yàn)。１巧孔扇貝連續(xù)選擇群體的構(gòu)建一本

6、章節(jié)著重介紹了構(gòu)建巧孔扇貝Ｈ個(gè)世代連續(xù)選擇群體。在個(gè)容量為２０００只扇貝的群體中采用截頭法Ｗ殼髙為目的性狀上選前５％進(jìn)行選擇，兩年性一成熟后繼續(xù)Ｗ殼高為候選性狀采用截頭法進(jìn)行選擇，待第Ｈ世代長(zhǎng)成年后，測(cè)，量其體尺性狀，挑取巧絲Ｌ；＾＆ＤＮＡ提取。在選擇的過程中子代在２４月齡的體尺性化遺傳増量不明蟲。２巧孔扇貝Ｈ個(gè)連續(xù)選擇世代群體遺傳學(xué)分析采用２ｂ＞ＲＡＤ技術(shù)構(gòu)建了巧孔扇貝Ｈ個(gè)世代群體共計(jì)巧９個(gè)扇貝的測(cè)序文１ＮＰ標(biāo)記。對(duì)Ｈ個(gè)世代進(jìn)行群體遺傳學(xué)庫，測(cè)序數(shù)據(jù)通過分型可拿到８４５０個(gè)Ｓ－．３４％、研

7、究發(fā)現(xiàn)，群體巧溫伯格平巧的標(biāo)記比例為Ｗ，隨著世代的遞進(jìn)離哈迪．０、０．０９２１±０．０３８８、０．０７３３±０．０３０８，１２．６４％、２３．１１％數(shù)為０．０９９９±０４０４，香農(nóng)多樣性指近交系數(shù)為化０２５６、化０３２３、化０４６８，通過構(gòu)建分子親緣關(guān)系矩陣發(fā)現(xiàn)無明顯塊狀聚集，Ｆｓｔ檢驗(yàn)無明顯群體分化，全基因組范圍內(nèi)的連鎖不平巧檢擁發(fā)現(xiàn)隨著＂＂世代的選擇，ＬＤ出現(xiàn)了衰巧現(xiàn)象？這說明連續(xù)選擇對(duì)巧孔扇貝蓬萊紅品種養(yǎng)殖群體的群體遺傳結(jié)構(gòu)產(chǎn)生了巧巧，但是群體巧傳多樣性仍維持在較巧水平，可Ｗ繼續(xù)進(jìn)行群體選育。

8、３全基因組選擇與全基因組關(guān)聯(lián)分析在巧孔扇貝中的應(yīng)用采用ＧＢＬＵＰ，Ｂａｙｅｓｌａｓｓｏ，ＢａｙｅｓＡ，ＢａｙｅｓＢ四種全基因組選擇的方法對(duì)全基凹沮選擇巧巧孔扇巧ｔｒＷｗｗｖｓ／ａｒｒｅＷ）巧種中的應(yīng)用．５３９只扇貝分別進(jìn)行了個(gè)體全基因組育種值估計(jì)及各標(biāo)